Secondary structure (Cloverleaf model) | >CHL090800146 Lys TTT
a ttac attacttgaa
G - C
G - C
G - C
T - A
T - A
G - C
C - G T A
T G G C C C A
A A A | | | | | G
T C T C A C C G G G C
G | | | | T T
G G A G T
T A A TAGTT
C C
T - A
C - G
G - C
G - C
C A *
T A
T T T
intron: position=39, length=2996 (in A-loop)
GTGCGATTATGGGGTTCAATACATAATATGTAATAAAATTCTTTAACATAGCTGAAATTTTGTTAAAAAA
AACGGCTTACTTGGATGTATGAAAAATATCACAAGGACTATAGCATGCCGGTAAGTAATTCATCAATATT
AATTCATAAAAATTACAAGTTAAAAGGTGTATGGATAAATAAAAACAATCGATTACTGAAATTACAGGTC
AAGTAAATATGCCAGACTTTACTCAGAAATCAAGAAGATAGGAAAATGGAGAATATCGAATAATTATGAA
TATTCTTTTATTGAATATAAATAGACTAGAGTCATAATTTATATTCCTAGAACATTCTGAGTTATCTTAA
ATTTACTGGTAGGCTAAGAGCTAGTGAATAATCAGTTTAAGTAAACTTCATTCCGTTTGGAATATATAAA
CCAAAAGTCAATCCTAATCACCCATTAGATATGTTCTAAAGTTCTCCATATATTGACTACAGAAATTTAA
TGTTTTATAAGTCATAAGAGTGATCAAAAAAGATCATACCATGTATAATTCATAACATACAATATAATAT
AACAATATATACAATATAATAGAATATAACAATATATACATTGTAACATATTATATATTCATATTATAAT
ATTATATATATTATAATATTATATATATTATATATTCATATACTATATTCCTATATAATATATTCCTATT
ATATAATATATTCCTATATATTGTTAACAATATTAACAATATATTAAACACTATAATAGATATATAACAA
TATAATATATCTATAATATATATATTATAGATATATAATATATTATAGATATATATATATTATAGATAAT
ATACAAAGAATATAATAAATATACAAAGAATATAATAAATACTTTCTATAAATAGAAAAGACTTCTCAGC
AATAAACTTATTCCTATTTTTGTTCAATGAATTTAATTTCAAAAAAGAATGAGCTTAAACAAGGATTCTA
TCCTTTATTTTTCTTGGAGGAATTTTATACTAGAGTTTTGATTCACATGAATCATAACCATATACTGAAA
ATAGGAAATATAAAGGAATCGAAATTGATTCATGTGAATAGAATATGTCATTATTTACTTATTAAGAGAT
TGATTCGTCAGATACGTAAACAAAGTCATAAGTACAATGGTATCTCTGAATTTCCTAATTATGAAACAGA
ATTTTATTTTCAATATAAAAATCGATTTTATAATTTAATTATAGAAAATGCTTTTCTTCTTATATTGCAA
ATGATATGGCAACATCAAAAGACAAGGAAAAACGATCCCTCTATTTTAATACACCGATCTATACAATCGG
CTTTTCCATTTTTAGAAAAGAAAATTATTCATTGTATTTGGATTATACATGGAAAAATACAACTTTTTCA
TACAATTGAACAATTCAATTTTTTGTTTTTATTACTTTATGAAAGAATCCGTGATAAAAGCTTTCTTCAT
TTACTAAAAAACATATTGAATTTAAACAAAGAATTTTTGATTGAAAAATTCTATTGTGAAAAATTCCATT
TGATTGAATTGTCAATGTTTTTCAGGAATTTATATATAAATGAATTTGACTCTTTTATCGTTTATCATAT
CGTTAAAACATGGAAATTAGCCTATTTGTTGAATCCAATTAAAGCTATAGATGATTTTTCTTTCATACAA
AAAAATGATATTTTGCTTAATATAAAAAGAAAACAGAAACGTCTTCCTTTGGTGTGTTGGTTGGCTAACA
AATCTTTCTATTCTCTGTATGGAAATATACACTATGTACGTCGTGACCTTTCCTTTTTGATGGCTATTCA
AGCAGGAAAACATATTTCTCGCTTTTGGAAGTATAATTGTATAAAATTTCTCCAACTGAAGTTAGGATTT
CCTTGTTCTTTAGATGTTTTATACTTAAAATCTCTTTTCAATCAAGATTTTTTGTTTTTAGGTTATAGAA
TTGTCAATAAATTGTGGAAAAAAAACTTCAAGATAAGAGCGGTTTCTTGGTATTCGCCTATTCTATTTTT
TTTGAAAGGCCGAAGGATTTCAACAAAAATGCCAGTATTTAATCTAATTGATAGGTTAAGTGTTATGCAC
TTATGTAATCTTGAAGGCTATCCAATTCATAAGGCTGCATGGTCTGTATTTAATGACAAACAAATTATGA
ACATCTTTTCTAACTTATTGAGAAACATACTTTTTTATTATAGTGGATGTTCAAATCGTTCTGATTTAGG
CAAAATTCAATATATTCTCGAATTTTCATGTATGAAAACATTAGCATTTAAACATAAATCTAGTATTAGA
TCTACATGGACGCAATATAAAAAACATGTTTCATTTTTAAGTTTAGTCAAAAATAGACATAAGAATGGTA
AGACTTCAGTTGATCTTTACTTTCTATTTCAAAAAACAAATAAATTCTGGTTATTAGATTTATCTAAGAT
TCAAGATTCTCTTGCTTGTTTTATTTTGATGGATTAAAGAAATTCAAAGATAGAATATCAGAAAGATAGC
ATAGCATATGAATTTTGATAGAATAACAATATAATTGAATCTCAATGAGAATAAAAAATGAAATGAAAAT
TGTTTTTTTTGTATATTTATGTATAAATATACAAAAAAAACAATTCAAGATTTATTATTCTATTTCATCG
GAATGAATAAAATAGAACTATACATGAGGAAAGCCGCTTGCAGTGAAAATTGCATGTGCGGTTTGGGAAG
AGGTTTATTATTGTATTTATAAATACAAGAAAATAAAGAAAAGATCTACTATGAATTTTTGATACATATA
TTGATAAATATATAAATAAATATATATATAAAAATAAATATATATTTATATATATATTTATTTTTATTTA
TATATTTATTTATTAATAATAAGTTGTAATATATCAAAATCAAAATAAACAAAATTAGATCAAGTGAAAA
ATACGATACAAATAATATATAGATACATATATAAATACTATATTACCTACTTTCAT
|