Home | tRNADB-CE : tRNA gene database curated manually by experts

This is the navigation skips to jump to main contents

Jump to main contents.

Top | Keyword | BLAST | Download | HOW TO USE

tRNA gene List

[OMDI] human gut metagenome; feces

HIT: 64 sequence(s).

Download Sequence
View ClustalW result

The reliable tRNA genes	All candidate tRNA genes

Select	Sequence ID	Genome ID (or Accession No.)	Phylum/Class (Sample source for ENV)	Species	Start	End	Direction	AA	Anticodon	Genome/Seq. Info.	Decision
	>WENV183455238	OMDI01009513	[OMDI] human gut metagenome; feces		3	77	+	fMet	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455232	OMDI01006602	[OMDI] human gut metagenome; feces		57	131	+	Ala	TGC	[ENA]	◯
	>WENV183455245	OMDI01017654	[OMDI] human gut metagenome; feces		68	151	+	Tyr	GTA	[ENA]	◯
	>WENV183455221	OMDI01002146	[OMDI] human gut metagenome; feces		89	173	+	Leu	GAG	[ENA]	◯
	>WENV183455243	OMDI01015514	[OMDI] human gut metagenome; feces		113	28	-	Tyr	GTA	[ENA]	◯
	>WENV183455231	OMDI01006125	[OMDI] human gut metagenome; feces		136	210	+	Ile2	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455235	OMDI01007123	[OMDI] human gut metagenome; feces		136	220	+	Leu	CAA	[ENA]	◯
	>WENV183455240	OMDI01012646	[OMDI] human gut metagenome; feces		172	246	+	Cys	GCA	[ENA]	◯
	>WENV183455236	OMDI01007411	[OMDI] human gut metagenome; feces		178	103	-	Pro	TGG	[ENA]	◯
	>WENV183455222	OMDI01002628	[OMDI] human gut metagenome; feces		193	267	+	Ile	GAT	[ENA]	◯
	>WENV183455187	OMDI01000040	[OMDI] human gut metagenome; feces		225	151	-	Asn	GTT	[ENA]	◯
	>WENV183455223	OMDI01002628	[OMDI] human gut metagenome; feces		284	358	+	Ala	TGC	[ENA]	◯
	>WENV183455242	OMDI01014940	[OMDI] human gut metagenome; feces		341	414	+	Lys	TTT	[ENA]	◯
	>WENV183455224	OMDI01002755	[OMDI] human gut metagenome; feces		369	440	+	Cys	GCA	[ENA]	◯
	>WENV183455207	OMDI01000884	[OMDI] human gut metagenome; feces		374	449	+	Ala	GGC	[ENA]	◯
	>WENV183455239	OMDI01009743	[OMDI] human gut metagenome; feces		419	334	-	Ser	TGA	[ENA]	◯
	>WENV183455244	OMDI01016361	[OMDI] human gut metagenome; feces		443	358	-	Leu	CAA	[ENA]	◯
	>WENV183455202	OMDI01000560	[OMDI] human gut metagenome; feces		516	591	+	Ala	TGC	[ENA]	◯
	>WENV183455241	OMDI01012684	[OMDI] human gut metagenome; feces		524	599	+	Ala	TGC	[ENA]	◯
	>WENV183455197	OMDI01000138	[OMDI] human gut metagenome; feces		540	468	-	Glu	TTC	[ENA]	◯
	>WENV183455200	OMDI01000247	[OMDI] human gut metagenome; feces		578	497	-	Leu	CAG	[ENA]	◯
	>WENV183455203	OMDI01000560	[OMDI] human gut metagenome; feces		595	671	+	Ile	GAT	[ENA]	◯
	>WENV183455233	OMDI01006735	[OMDI] human gut metagenome; feces		602	529	-	Trp	CCA	[ENA]	◯
	>WENV183455237	OMDI01008684	[OMDI] human gut metagenome; feces		650	725	+	Lys	TTT	[ENA]	◯
	>WENV183455213	OMDI01001496	[OMDI] human gut metagenome; feces		687	611	-	fMet	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455234	OMDI01006811	[OMDI] human gut metagenome; feces		872	946	+	fMet	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455228	OMDI01004788	[OMDI] human gut metagenome; feces		923	999	+	Arg	TCT	[ENA]	◯
	>WENV183455209	OMDI01001029	[OMDI] human gut metagenome; feces		967	892	-	Pro	CGG	[ENA]	◯
	>WENV183455229	OMDI01004788	[OMDI] human gut metagenome; feces		1006	1082	+	His	GTG	[ENA]	◯
	>WENV183455216	OMDI01001604	[OMDI] human gut metagenome; feces		1018	1092	+	Pro	TGG	[ENA]	◯
	>WENV183455230	OMDI01005014	[OMDI] human gut metagenome; feces		1029	1119	+	Ser	CGA	[ENA]	◯
	>WENV183455226	OMDI01004651	[OMDI] human gut metagenome; feces		1038	1113	+	Trp	CCA	[ENA]	◯
	>WENV183455208	OMDI01001029	[OMDI] human gut metagenome; feces		1072	999	-	Gln	CTG	[ENA]	◯
	>WENV183455227	OMDI01004699	[OMDI] human gut metagenome; feces		1160	1069	-	Ser	GGA	[ENA]	◯
	>WENV183455225	OMDI01003187	[OMDI] human gut metagenome; feces		1243	1318	+	Gly	CCC	[ENA]	◯
	>WENV183455218	OMDI01001723	[OMDI] human gut metagenome; feces		1542	1617	+	Val	GAC	[ENA]	◯
	>WENV183455198	OMDI01000213	[OMDI] human gut metagenome; feces		1668	1591	-	Pro	CGG	[ENA]	◯
	>WENV183455219	OMDI01001723	[OMDI] human gut metagenome; feces		1750	1674	-	Val	CAC	[ENA]	◯
	>WENV183455214	OMDI01001510	[OMDI] human gut metagenome; feces		1767	1840	+	Ile2	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455199	OMDI01000247	[OMDI] human gut metagenome; feces		1808	1882	+	Arg	TCT	[ENA]	◯
	>WENV183455217	OMDI01001721	[OMDI] human gut metagenome; feces		1881	1956	+	Pro	CGG	[ENA]	◯
	>WENV183455220	OMDI01001815	[OMDI] human gut metagenome; feces		1900	1817	-	Leu	TAA	[ENA]	◯
	>WENV183455215	OMDI01001510	[OMDI] human gut metagenome; feces		1960	2035	+	Thr	GGT	[ENA]	◯
	>WENV183455212	OMDI01001326	[OMDI] human gut metagenome; feces		2012	1936	-	Ile	GAT	[ENA]	◯
	>WENV183455210	OMDI01001135	[OMDI] human gut metagenome; feces		2164	2090	-	Ile	GAT	[ENA]	◯
	>WENV183455211	OMDI01001192	[OMDI] human gut metagenome; feces		2194	2276	+	Leu	CAA	[ENA]	◯
	>WENV183455206	OMDI01000869	[OMDI] human gut metagenome; feces		2476	2550	+	Gly	CCC	[ENA]	◯
	>WENV183455195	OMDI01000124	[OMDI] human gut metagenome; feces		2561	2488	-	Glu	TTC	[ENA]	◯
	>WENV183455204	OMDI01000704	[OMDI] human gut metagenome; feces		2616	2690	+	fMet	CAT	[ENA]	◯
	>WENV183455205	OMDI01000704	[OMDI] human gut metagenome; feces		2694	2766	+	Phe	GAA	[ENA]	◯
	>WENV183455201	OMDI01000294	[OMDI] human gut metagenome; feces		3753	3826	+	Phe	GAA	[ENA]	◯
	>WENV183455194	OMDI01000083	[OMDI] human gut metagenome; feces		3778	3694	-	Leu	TAA	[ENA]	◯
	>WENV183455184	OMDI01000031	[OMDI] human gut metagenome; feces		4719	4792	+	Glu	CTC	[ENA]	◯
	>WENV183455186	OMDI01000038	[OMDI] human gut metagenome; feces		4815	4740	-	Ala	GGC	[ENA]	◯
	>WENV183455196	OMDI01000132	[OMDI] human gut metagenome; feces		5759	5833	+	His	GTG	[ENA]	◯
	>WENV183455193	OMDI01000077	[OMDI] human gut metagenome; feces		6174	6261	+	Ser	CGA	[ENA]	◯
	>WENV183455188	OMDI01000049	[OMDI] human gut metagenome; feces		6329	6255	-	Arg	CCG	[ENA]	◯
	>WENV183455185	OMDI01000037	[OMDI] human gut metagenome; feces		7144	7218	+	Asp	GTC	[ENA]	◯
	>WENV183455189	OMDI01000052	[OMDI] human gut metagenome; feces		7192	7266	+	Thr	TGT	[ENA]	◯
	>WENV183455190	OMDI01000052	[OMDI] human gut metagenome; feces		7305	7387	+	Tyr	GTA	[ENA]	◯
	>WENV183455191	OMDI01000052	[OMDI] human gut metagenome; feces		7568	7640	+	Thr	GGT	[ENA]	◯
	>WENV183455192	OMDI01000053	[OMDI] human gut metagenome; feces		7966	7884	-	Leu	TAG	[ENA]	◯
	>WENV183455182	OMDI01000011	[OMDI] human gut metagenome; feces		11258	11184	-	Pro	GGG	[ENA]	◯
	>WENV183455183	OMDI01000012	[OMDI] human gut metagenome; feces		14180	14255	+	Val	TAC	[ENA]	◯
Select	Sequence ID	Genome ID (or Accession No.)	Phylum/Class (Sample source for ENV)	Species	Start	End	Direction	AA	Anticodon	Genome/Seq. Info.	Decision

Download Sequence
View ClustalW result

BACK