This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes clustered and arranged according to each identical group
HIT:
1 Group(s).
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No.
Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Identical group No.173121 (269 seq.)
>W1710888849
LNAA01000005
Cyanobacteriota
Oscillatoriales cyanobacterium MTP1 [LNAA]
6672
6599
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W131063388
ANKQ01000002
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa TAIHU98 [ANKQ]
196062
195987
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W131203784
ASZQ01000264
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa SPC 777 [ASZQ]
13586
13511
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>C171128321
LT578417
Cyanobacteriota
Cyanobium sp. NIES-981 [LT578417]
12882
12807
-
Asp
GTC
-
¡û
>C021105
AP008231
Cyanobacteriota
Synechococcus elongatus PCC 6301 [AP008231]
1693695
1693622
-
Asp
GTC
[Ensembl]
¡û
>C021148
CP000100
Cyanobacteriota
Synechococcus elongatus PCC 7942 = FACHB-805 [CP000100]
2623091
2623164
+
Asp
GTC
[Ensembl]
¡û
>C025530
BA000039
Cyanobacteriota
Thermosynechococcus vestitus BP-1 [BA000039]
1921204
1921128
-
Asp
GTC
[Ensembl]
¡û
>WENV180013654
FMSI01121304
[FMSI] soil metagenome; Soil
6099
6024
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180110922
OAPN01013756
[OAPN] marine metagenome; 2011
327
402
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180114798
OAPS01048480
[OAPS] marine metagenome; sea water
328
403
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180585107
OCOK01003232
[OCOK] marine metagenome; ENVO:00002010
220
294
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180591495
OCOV01029848
[OCOV] marine metagenome; ENVO:01000301
258
333
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180678661
OCVV012052853
[OCVV] gut metagenome; gut
118
195
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180678662
OCVV012052853
[OCVV] gut metagenome; gut
118
195
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV180794106
ODIY01006305
[ODIY] human metagenome; G_DNA_Buccal mucosa
323
399
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>W08011017
ABSE01000005
Cyanobacteriota
Cyanobium sp. PCC 7001 [ABSE]
10363
10288
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV181367853
OFQD01002076
[OFQD] freshwater metagenome; Freshwater Lake
1235
1310
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV181414150
OGCL01000054
[OGCL] hot springs metagenome; Hot spring water
82296
82221
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV181446436
OGDT01004284
[OGDT] metagenome; Human gut stool
1522
1445
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV181556515
OGIU01050138
[OGIU] metagenome; Human gut stool
104
27
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>W141242562
CAIM01000300
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa PCC 9807 [CAIM]
4265
4340
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W141242590
CAIN01000057
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa PCC 9808 [CAIN]
3672
3597
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV182584617
OJHG01003059
[OJHG] seawater metagenome; Sea water
2386
2461
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV170573994
FLYL01061895
[FLYL] hot springs metagenome; Sediment
75
150
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV170609187
FUWD011305299
[FUWD] metagenome; unknown
138
213
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV170798828
MDSV01203183
[MDSV] marine metagenome; seawater
402
475
+
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV170865671
MDTB01122428
[MDTB] marine metagenome; seawater
3285
3212
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>WENV170909360
MDTE01077226
[MDTE] marine metagenome; seawater
2865
2792
-
Asp
GTC
[ENA]
¢þ
>CHL1810000518
AP012598
Viridiplantae
Vigna angularis (AP012598)
33889
33964
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810000673
AP014702
Viridiplantae
Takakia lepidozioides (AP014702)
45192
45117
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810000947
EU043314
Viridiplantae
Aneura mirabilis (EU043314)
35181
35104
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810001751
FJ546412
Viridiplantae
Syntrichia ruralis (FJ546412)
46383
46456
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810001771
FJ556581
Viridiplantae
Alsophila spinulosa (FJ556581)
27659
27734
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810002439
GU191333
Viridiplantae
Isoetes flaccida (GU191333)
58278
58353
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810002482
GU191334
Viridiplantae
Equisetum arvense (GU191334)
53765
53690
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810002706
GU811709
Viridiplantae
Phoenix dactylifera (GU811709)
31423
31348
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810002818
HF567869
Viridiplantae
Tectona grandis (HF567869)
31373
31297
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810003240
HM347959
Viridiplantae
Eucalyptus grandis (HM347959)
32799
32726
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810003245
HM535629
Viridiplantae
Pteridium aquilinum subsp. aquilinum (HM535629)
27277
27352
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810003380
HM778032
Viridiplantae
Myriopteris lindheimeri (HM778032)
27702
27777
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810004264
JF715054
Viridiplantae
Silene conica (JF715054)
27094
27019
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810004346
JF715057
Viridiplantae
Silene vulgaris (JF715057)
28609
28533
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810004404
JF746994
Viridiplantae
Erycina pusilla (JF746994)
31151
31076
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810004656
JN032131
Viridiplantae
Pharus latifolius (JN032131)
16889
16962
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810005124
JN867585
Viridiplantae
Ginkgo biloba (JN867585)
34194
34119
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810005524
JQ755301
Viridiplantae
Vigna unguiculata (JQ755301)
33747
33822
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006133
JX427551
Viridiplantae
Sedum sarmentosum (JX427551)
30257
30184
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006619
JX827163
Viridiplantae
Apopellia endiviifolia (JX827163)
37088
37012
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006857
KC180769
Viridiplantae
Eucalyptus obliqua (KC180769)
32779
32706
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006913
KC180771
Viridiplantae
Eucalyptus delegatensis (KC180771)
32859
32786
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006941
KC180772
Viridiplantae
Eucalyptus verrucata (KC180772)
32816
32743
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810006969
KC180773
Viridiplantae
Eucalyptus baxteri (KC180773)
32793
32720
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007025
KC180775
Viridiplantae
Eucalyptus sieberi (KC180775)
32846
32773
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007053
KC180776
Viridiplantae
Eucalyptus elata (KC180776)
32780
32707
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007081
KC180777
Viridiplantae
Eucalyptus regnans (KC180777)
32828
32755
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007109
KC180778
Viridiplantae
Eucalyptus umbra (KC180778)
32888
32815
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007137
KC180779
Viridiplantae
Eucalyptus cloeziana (KC180779)
32845
32772
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007165
KC180780
Viridiplantae
Eucalyptus patens (KC180780)
32738
32665
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007249
KC180784
Viridiplantae
Eucalyptus melliodora (KC180784)
32936
32863
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007277
KC180785
Viridiplantae
Eucalyptus polybractea (KC180785)
32803
32730
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007305
KC180786
Viridiplantae
Eucalyptus cladocalyx (KC180786)
32882
32809
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007361
KC180789
Viridiplantae
Eucalyptus aromaphloia (KC180789)
32849
32776
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007417
KC180791
Viridiplantae
Eucalyptus camaldulensis (KC180791)
32855
32782
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007445
KC180792
Viridiplantae
Eucalyptus deglupta (KC180792)
32874
32801
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007473
KC180793
Viridiplantae
Eucalyptus spathulata (KC180793)
32610
32537
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007529
KC180795
Viridiplantae
Eucalyptus diversicolor (KC180795)
32863
32790
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007557
KC180796
Viridiplantae
Eucalyptus salmonophloia (KC180796)
32877
32804
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007585
KC180797
Viridiplantae
Eucalyptus microcorys (KC180797)
32883
32810
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007613
KC180798
Viridiplantae
Eucalyptus guilfoylei (KC180798)
32808
32735
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007641
KC180799
Viridiplantae
Eucalyptus erythrocorys (KC180799)
32436
32363
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007669
KC180800
Viridiplantae
Corymbia gummifera (KC180800)
32039
31966
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007697
KC180801
Viridiplantae
Corymbia maculata (KC180801)
32326
32253
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007725
KC180802
Viridiplantae
Corymbia eximia (KC180802)
32303
32230
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007781
KC180804
Viridiplantae
Angophora floribunda (KC180804)
32410
32337
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007809
KC180805
Viridiplantae
Angophora costata (KC180805)
32464
32391
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007837
KC180806
Viridiplantae
Allosyncarpia ternata (KC180806)
32625
32552
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007864
KC180807
Viridiplantae
Stockwellia quadrifida (KC180807)
32243
32170
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810007895
KC311467
Viridiplantae
Pharus lappulaceus (KC311467)
16865
16938
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810008483
KC536646
Viridiplantae
Marsilea crenata (KC536646)
30446
30522
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810009703
KF225592
Viridiplantae
Osmundastrum cinnamomeum (KF225592)
45387
45462
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810009730
KF225594
Viridiplantae
Diplopterygium glaucum (KF225594)
44721
44796
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810009893
KF356392
Viridiplantae
Neyraudia reynaudiana (KF356392)
16158
16231
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810010261
KF527884
Viridiplantae
Agrostemma githago (KF527884)
29481
29405
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810010288
KF527885
Viridiplantae
Silene conoidea (KF527885)
27787
27711
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810010343
KF527887
Viridiplantae
Silene paradoxa (KF527887)
28928
28852
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810010370
KF534478
Viridiplantae
Haloxylon ammodendron (KF534478)
30306
30230
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810010398
KF534479
Viridiplantae
Haloxylon persicum (KF534479)
30302
30226
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810011648
KJ461680
Viridiplantae
Klebsormidium flaccidum (KJ461680)
44566
44639
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810012093
KJ566307
Viridiplantae
Paphiopedilum armeniacum (KJ566307)
32694
32619
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810012405
KJ629115
Viridiplantae
Salicornia brachiata (KJ629115)
29863
29788
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810012433
KJ629116
Viridiplantae
Salicornia europaea (KJ629116)
29783
29708
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810013241
KJ817846
Viridiplantae
Tetraphis pellucida (KJ817846)
49000
49075
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810013582
KJ944326
Viridiplantae
Phalaenopsis hybrid cultivar (KJ944326)
31959
31884
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810014129
KM103376
Viridiplantae
Wisteria floribunda (KM103376)
32485
32560
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810014200
KM111545
Viridiplantae
Sanionia uncinata (KM111545)
39427
39354
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810014926
KM462876
Viridiplantae
Microthamnion kuetzingianum (KM462876)
73144
73217
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810015109
KM462882
Viridiplantae
Fusochloris perforata (KM462882)
75404
75477
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810015420
KM504956
Viridiplantae
Diospyros glaucifolia (KM504956)
32068
31992
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810015448
KM522849
Viridiplantae
Diospyros lotus (KM522849)
32039
31963
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016141
KP015032
Viridiplantae
Corymbia henryi (KP015032)
32295
32222
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016169
KP015033
Viridiplantae
Corymbia torelliana (KP015033)
32348
32275
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016432
KP119739
Viridiplantae
Orthotrichum rogeri (KP119739)
46257
46330
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016652
KP176438
Viridiplantae
Sporobolus maritimus (KP176438)
16125
16198
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016707
KP189363
Viridiplantae
Cyrtomium falcatum (KP189363)
27397
27472
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016784
KP205432
Viridiplantae
Masdevallia coccinea (KP205432)
30626
30549
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810016896
KP221925
Viridiplantae
Gossypium nelsonii (KP221925)
31964
31888
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810017991
KP765733
Viridiplantae
Nyholmiella obtusifolia (KP765733)
46480
46553
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810019241
KR584659
Viridiplantae
Eutrema salsugineum (KR584659)
30035
29959
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810020316
KT223565
Viridiplantae
Diospyros kaki (KT223565)
32124
32048
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021441
KT591465
Viridiplantae
Dendrobium nobile (KT591465)
30316
30241
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021474
KT599100
Viridiplantae
Cyrtomium devexiscapulae (KT599100)
27259
27334
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021497
KT599101
Viridiplantae
Woodwardia unigemmata (KT599101)
27433
27508
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021549
KT625410
Viridiplantae
Treubaria triappendiculata (KT625410)
68621
68694
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021602
KT625412
Viridiplantae
Oogamochlamys gigantea (KT625412)
95571
95646
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021682
KT625414
Viridiplantae
Jenufa minuta (KT625414)
74252
74179
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021728
KT625418
Viridiplantae
Characiochloris acuminata (KT625418)
178546
178621
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021759
KT625420
Viridiplantae
Carteria cerasiformis (KT625420)
91051
90978
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810021800
KT625422
Viridiplantae
Phacotus lenticularis (KT625422)
157716
157789
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810022462
KT727929
Viridiplantae
Lychnis wilfordii (KT727929)
28722
28646
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810022489
KT727930
Viridiplantae
Silene capitata (KT727930)
28719
28643
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810022518
KT734618
Viridiplantae
Burmannia coelestis (KT734618)
28670
28595
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810022547
KT734619
Viridiplantae
Burmannia disticha (KT734619)
27637
27562
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810022620
KT737383
Viridiplantae
Colobanthus quitensis (KT737383)
29371
29295
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810023677
KT962846
Viridiplantae
Eutrema halophilum (KT962846)
29941
29865
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810023705
KT962847
Viridiplantae
Eutrema botschantzevii (KT962847)
29916
29840
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810026203
KU318111
Viridiplantae
Plinia trunciflora (KU318111)
32539
32463
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810027157
KU666545
Viridiplantae
Leptaspis banksii (KU666545)
17444
17517
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810027186
KU666546
Viridiplantae
Leptaspis zeylanica (KU666546)
16850
16923
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810027520
KU726621
Viridiplantae
Sphagnum palustre (KU726621)
55569
55644
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810027768
KU833246
Viridiplantae
Eleusine indica (KU833246)
15976
16049
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810028036
KU900232
Viridiplantae
Scopolia parviflora (KU900232)
31627
31551
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810032706
KX279888
Viridiplantae
Amaranthus hypochondriacus (KX279888)
30316
30240
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810032865
KX342848
Viridiplantae
Sinalliaria limprichtiana (KX342848)
29290
29214
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810033117
KX354692
Viridiplantae
Lilium cernuum (KX354692)
29147
29072
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810033200
KX364403
Viridiplantae
Psidium guajava (KX364403)
32388
32312
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810033494
KX426071
Viridiplantae
Huperzia serrata (KX426071)
59164
59239
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810033565
KX426216
Viridiplantae
Diospyros blancoi (KX426216)
32163
32087
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810033647
KX437771
Viridiplantae
Persea americana (KX437771)
32471
32394
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810035281
KX765278
Viridiplantae
Chloris truncata (KX765278)
16001
16074
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810035310
KX765279
Viridiplantae
Chloris virgata (KX765279)
15992
16065
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036350
KX822776
Viridiplantae
Cordyline indivisa (KX822776)
31364
31289
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036462
KX826819
Viridiplantae
Allomaieta villosa (KX826819)
30680
30607
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036490
KX826820
Viridiplantae
Bertolonia acuminata (KX826820)
30604
30531
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036518
KX826821
Viridiplantae
Blakea schlimii (KX826821)
30668
30595
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036546
KX826822
Viridiplantae
Eriocnema fulva (KX826822)
30503
30430
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036574
KX826823
Viridiplantae
Graffenrieda moritziana (KX826823)
30238
30165
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036602
KX826824
Viridiplantae
Henriettea barkeri (KX826824)
30745
30672
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036630
KX826825
Viridiplantae
Merianthera pulchra (KX826825)
30997
30924
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036658
KX826826
Viridiplantae
Miconia dodecandra (KX826826)
31049
30976
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036714
KX826828
Viridiplantae
Opisthocentra clidemioides (KX826828)
31035
30962
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036742
KX826829
Viridiplantae
Pterogastra divaricata (KX826829)
29881
29808
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036770
KX826830
Viridiplantae
Rhexia virginica (KX826830)
30927
30854
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036798
KX826831
Viridiplantae
Rhynchanthera bracteata (KX826831)
31104
31031
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036854
KX826833
Viridiplantae
Tibouchina longifolia (KX826833)
31525
31452
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810036882
KX826834
Viridiplantae
Triolena amazonica (KX826834)
31096
31023
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810037044
KX852427
Viridiplantae
Lagerstroemia intermedia (KX852427)
29827
29751
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810037467
KX871233
Viridiplantae
Gastrochilus fuscopunctatus (KX871233)
31771
31696
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810037751
KX886353
Viridiplantae
Lepidium meyenii (KX886353)
29669
29593
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810038089
KX931448
Viridiplantae
Albuca kirkii (KX931448)
31853
31778
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810038693
KY009938
Viridiplantae
Lilium taliense (KY009938)
29333
29258
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810038753
KY024482
Viridiplantae
Cynodon dactylon (KY024482)
15938
16011
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810039822
KY126308
Viridiplantae
Physcomitrella patens (KY126308)
45753
45826
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810040256
KY346511
Viridiplantae
Phoebe chekiangensis (KY346511)
32458
32381
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810040283
KY346512
Viridiplantae
Phoebe bournei (KY346512)
32462
32385
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810040311
KY352315
Viridiplantae
Przewalskia tangutica (KY352315)
31761
31685
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041014
KY419703
Viridiplantae
Athyrium anisopterum (KY419703)
27312
27387
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041037
KY419704
Viridiplantae
Lepisorus clathratus (KY419704)
26136
26211
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041083
KY419706
Viridiplantae
Chenopodium quinoa (KY419706)
29482
29406
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041111
KY419707
Viridiplantae
Chenopodium album (KY419707)
29568
29492
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041144
KY427329
Viridiplantae
Ampelopteris prolifera (KY427329)
27438
27514
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041167
KY427330
Viridiplantae
Athyrium sheareri (KY427330)
27281
27356
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041213
KY427332
Viridiplantae
Asplenium prolongatum (KY427332)
26932
27008
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041236
KY427333
Viridiplantae
Athyrium sinense (KY427333)
27327
27402
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041259
KY427334
Viridiplantae
Austroblechnum melanocaulon (KY427334)
27372
27447
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041282
KY427335
Viridiplantae
Athyrium opacum (KY427335)
27319
27394
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041327
KY427337
Viridiplantae
Cystopteris chinensis (KY427337)
27421
27496
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041350
KY427338
Viridiplantae
Deparia lancea (KY427338)
27000
27075
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041373
KY427339
Viridiplantae
Deparia pycnosora (KY427339)
27270
27345
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041396
KY427340
Viridiplantae
Deparia viridifrons (KY427340)
27316
27391
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041419
KY427341
Viridiplantae
Diplaziopsis cavaleriana (KY427341)
27428
27503
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041442
KY427342
Viridiplantae
Diplaziopsis javanica (KY427342)
27494
27569
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041465
KY427343
Viridiplantae
Diplazium bellum (KY427343)
27274
27349
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041488
KY427344
Viridiplantae
Diplazium dilatatum (KY427344)
27120
27195
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041557
KY427347
Viridiplantae
Diplazium unilobum (KY427347)
27280
27355
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041577
KY427348
Viridiplantae
Dryopteris decipiens (KY427348)
27141
27216
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041600
KY427349
Viridiplantae
Homalosorus pycnocarpos (KY427349)
27472
27547
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041623
KY427350
Viridiplantae
Hymenasplenium unilaterale (KY427350)
27393
27468
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041646
KY427351
Viridiplantae
Hypodematium crenatum (KY427351)
27129
27204
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041669
KY427352
Viridiplantae
Macrothelypteris torresiana (KY427352)
27412
27487
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041692
KY427353
Viridiplantae
Matteuccia struthiopteris (KY427353)
27517
27592
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041715
KY427354
Viridiplantae
Onoclea sensibilis (KY427354)
27340
27415
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041761
KY427356
Viridiplantae
Rhachidosorus consimilis (KY427356)
27453
27528
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041784
KY427357
Viridiplantae
Stegnogramma sagittifolia (KY427357)
27344
27420
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041806
KY427358
Viridiplantae
Woodsia macrochlaena (KY427358)
27260
27335
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041854
KY432777
Viridiplantae
Eustachys glauca (KY432777)
16031
16104
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810041941
KY432780
Viridiplantae
Halopyrum mucronatum (KY432780)
15972
16045
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042055
KY432784
Viridiplantae
Leptochloa virgata (KY432784)
15831
15904
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042113
KY432786
Viridiplantae
Melanocenchris abyssinica (KY432786)
15899
15972
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042200
KY432789
Viridiplantae
Oropetium aristatum (KY432789)
15413
15486
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042489
KY432800
Viridiplantae
Trichoneura grandiglumis (KY432800)
16007
16080
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042547
KY432802
Viridiplantae
Uniola paniculata (KY432802)
15600
15673
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042576
KY432803
Viridiplantae
Vaseyochloa multinervosa (KY432803)
15801
15874
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042692
KY432807
Viridiplantae
Dactyloctenium aegyptium (KY432807)
15976
16049
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810042779
KY432811
Viridiplantae
Enneapogon oblongus (KY432811)
15162
15235
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810044965
KY679200
Viridiplantae
Aldrovanda vesiculosa (KY679200)
28925
28849
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810045243
KY745894
Viridiplantae
Melastoma candidum (KY745894)
31243
31170
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810045969
KY828469
Viridiplantae
Spondias mombin (KY828469)
33922
33846
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810046167
KY873324
Viridiplantae
Barthea barthei (KY873324)
30666
30593
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810046252
KY912026
Viridiplantae
Hesperis matronalis (KY912026)
30016
29940
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810046280
KY912027
Viridiplantae
Hesperis sylvestris (KY912027)
30057
29981
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810047714
LC193515
Viridiplantae
Dendrobium jenkinsii (LC193515)
30933
30858
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810048780
LN877378
Viridiplantae
Bunias orientalis (LN877378)
29642
29566
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810049557
MF035992
Viridiplantae
Nematopoa longipes (MF035992)
15596
15669
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810050966
MF135598
Viridiplantae
Piliostigma thonningii (MF135598)
30265
30190
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810052107
MF286764
Viridiplantae
Lessertia frutescens (MF286764)
31032
31107
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810052491
MF460970
Viridiplantae
Triodia stipoides (MF460970)
15347
15420
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810052520
MF460971
Viridiplantae
Oxychloris scariosa (MF460971)
15922
15995
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810052607
MF460975
Viridiplantae
Triodia wiseana (MF460975)
16005
16078
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810052839
MF460983
Viridiplantae
Leptochloa pluriflora (MF460983)
15810
15883
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810054276
MF663760
Viridiplantae
Tigridiopalma magnifica (MF663760)
30592
30519
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810054386
MF687919
Viridiplantae
Colobanthus apetalus (MF687919)
88290
88214
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810054585
MF795140
Viridiplantae
Gymnocarpos przewalskii (MF795140)
29601
29525
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810056075
MG200070
Viridiplantae
Fritillaria yuminensis (MG200070)
28342
28267
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810056161
MG211819
Viridiplantae
Fritillaria tortifolia (MG211819)
28317
28242
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810058376
MG593047
Viridiplantae
Dysosma majoensis (MG593047)
31571
31494
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810058921
MG677935
Viridiplantae
Haematococcus lacustris UTEX 2505 (MG677935)
1044251
1044178
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810058988
MG710385
Viridiplantae
Talinum paniculatum (MG710385)
30609
30533
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810060141
MG913607
Viridiplantae
Cyrtomium fortunei (MG913607)
27187
27262
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810060219
MG925366
Viridiplantae
Cremastra appendiculata (MG925366)
31938
31863
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810060633
MH105066
Viridiplantae
Cibotium barometz (MH105066)
28177
28252
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL1810060877
MH191392
Viridiplantae
Myriophyllum spicatum (MH191392)
29417
29493
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>C181030486
CP018092
Cyanobacteriota
Thermostichus lividus PCC 6715 [CP018092]
1580748
1580673
-
Asp
GTC
-
¡û
>C191001220
AP018202
Cyanobacteriota
Thermostichus vulcanus NIES-2134 [AP018202]
1799714
1799639
-
Asp
GTC
-
¡û
>C191085222
CP032152
Cyanobacteriota
Thermosynechococcus vestitus E542 [CP032152]
2192364
2192439
+
Asp
GTC
-
¡û
>C191099577
CP033061
Cyanobacteriota
Synechococcus elongatus UTEX 3055 [CP033061]
1224015
1223940
-
Asp
GTC
-
¡û
>C191165414
CP039373
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. CB0101 [CP039373]
1056308
1056383
+
Asp
GTC
-
¡û
>W141712561
JMRP01000005
Cyanobacteriota
Cyanobium sp. CACIAM 14 [JMRP]
106127
106202
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W09101113
AADZ01000001
Cyanobacteriota
Synechococcus elongatus PCC 7942 [AADZ]
1911712
1911787
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1910067375
BEYQ01000017
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa NIES-298 [BEYQ]
62773
62698
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>C141007948
CP006735
Cyanobacteriota
Thermosynechococcus sp. NK55a [CP006735]
1239535
1239458
-
Asp
GTC
-
¡û
>W1911071048
NMQJ01000333
Cyanobacteriota
Fischerella thermalis CCMEE 5205 [NMQJ]
234
307
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1911176918
NQKX01000008
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. MW101C3 [NQKX]
22396
22321
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1911176935
NQKY01000001
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. BO 8801 [NQKY]
54587
54512
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1911177020
NQLA01000002
Cyanobacteriota
Vulcanococcus limneticus LL [NQLA]
168681
168755
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090100130
AB197035
Viridiplantae
Selaginella uncinata
115856
115782
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090100475
AJ316582
Viridiplantae
Atropa belladonna
31785
31709
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090100692
AM711639
Viridiplantae
Cuscuta gronovii
10155
10082
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090100815
AP005672
Viridiplantae
Physcomitrella patens subsp. patens
45754
45827
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090101287
AP009374
Viridiplantae
Lepidium virginicum
29618
29542
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090101550
AY660566
Viridiplantae
Huperzia lucidula
59071
59146
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090101647
AY780259
Viridiplantae
Eucalyptus globulus subsp. Globulus
32902
32829
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090102353
DQ821119
Viridiplantae
Angiopteris evecta
38083
38158
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090102469
DQ886273
Viridiplantae
Phaseolus vulgaris cultivar Negro Jamapa
33817
33892
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090102519
DQ887676
Viridiplantae
Drimys granadensis
32608
32533
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090102886
EF380351
Viridiplantae
Buxus microphylla
32606
32530
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090103106
EU196765
Viridiplantae
Phaseolus vulgaris
46006
45931
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>CHL090103146
U30821
Glaucocystophyceae
Cyanophora paradoxa
86270
86197
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1911638511
PVWP01000009
Cyanobacteriota
Aphanothece minutissima minutissima CCALA 015 [PVWP]
62770
62695
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>SRA1005388
SRR006907.232954
metagenomic water samples (SRP000427)
9
84
+
Asp
GTC
[SRA]
>C151009181
CP006471
Cyanobacteriota
Synechococcus elongatus UTEX 2973 [CP006471]
641144
641069
-
Asp
GTC
[Ensembl]
¡û
>C151080687
CP011339
Cyanobacteriota
Microcystis panniformis FACHB-1757 [CP011339]
1105656
1105731
+
Asp
GTC
-
¡û
>W10120544
ADXL01000068
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. CB0101 [ADXL]
25223
25298
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W11127288
ADXL01000068
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. CB0101 [ADXL]
25223
25298
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1511679500
LFEK01000125
Cyanobacteriota
Synechococcus sp. GFB01 [LFEK]
195
270
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>C131003899
CP003495
Cyanobacteriota
Cyanobium gracile PCC 6307 [CP003495]
1108883
1108958
+
Asp
GTC
[Ensembl]
¡û
>W1610550820
JXYX01000003
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa NIES-88 [JXYX]
449136
449061
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1610749227
LNAA01000005
Cyanobacteriota
Oscillatoriales cyanobacterium MTP1 [LNAA]
6672
6599
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1710005107
AJUT01000147
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa FCY-28 [AJUT]
1287
1212
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>W1710660697
JXYX01000003
Cyanobacteriota
Microcystis aeruginosa NIES-88 [JXYX]
449136
449061
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
BACK