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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
61 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV170296467
CESE01007267
165001
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV170296566
CESE01020736
306609
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296571
CESE01021299
306609
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170297331
CESE01140376
306609
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296596
CESE01026301
163866
Bacteroidota
TCG
Arg
>WENV170296906
CESE01065686
126691
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170297251
CESE01129798
126691
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296450
CESE01005519
430187
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV170296804
CESE01052502
430187
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV170297123
CESE01107095
309582
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV170297273
CESE01132204
309582
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV170297422
CESE01148357
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296650
CESE01032125
179643
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296419
CESE01001474
172532
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296420
CESE01001534
172532
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296441
CESE01003684
172532
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296965
CESE01075961
172532
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170297384
CESE01145623
103881
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296834
CESE01054865
103881
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296497
CESE01011543
147106
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV170296694
CESE01037698
243344
Bacteroidota
TCC
Gly
>WENV170296991
CESE01079348
100198
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296711
CESE01040558
154388
Bacteroidota
GTG
His
>WENV170297287
CESE01135068
154388
Bacteroidota
GTG
His
>WENV170296586
CESE01025028
364423
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV170296582
CESE01024732
241347
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV170297170
CESE01115177
349438
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV170297567
CESE01219772
96678
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170297256
CESE01130421
369129
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV170296627
CESE01029421
273242
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296751
CESE01047867
45519
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV170296748
CESE01047372
150103
Bacteroidota
GTG
His
>WENV170296463
CESE01006884
127288
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296589
CESE01025631
127288
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296603
CESE01027222
127288
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296982
CESE01078416
127414
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170297381
CESE01145131
127414
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170297417
CESE01148092
127414
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296947
CESE01070997
412944
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV170296619
CESE01028783
238764
Bacteroidota
>WENV170296506
CESE01012824
190649
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV170296489
CESE01009983
145271
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV170296598
CESE01026560
145271
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV170296667
CESE01034903
290994
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV170297262
CESE01131042
235802
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV170296416
CESE01001328
341187
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV170297005
CESE01081679
341187
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV170296972
CESE01076289
59930
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV170296429
CESE01002393
341421
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296530
CESE01015875
341421
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296475
CESE01008647
150454
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV170297168
CESE01115177
113694
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV170296412
CESE01000783
145555
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170297318
CESE01139301
347866
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV170296480
CESE01009136
235746
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170297217
CESE01124311
49675
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV170296417
CESE01001436
127449
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV170297103
CESE01100892
103368
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV170297060
CESE01092369
193473
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296443
CESE01004303
101289
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV170296533
CESE01016027
101289
Bacteroidota
GTA
Tyr
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
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