This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
121 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180487861
OBZQ01000242
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180487907
OBZQ01000315
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180487951
OBZQ01000392
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180487968
OBZQ01000450
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180488018
OBZQ01000670
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180488118
OBZQ01001420
243647
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180487995
OBZQ01000585
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488136
OBZQ01001679
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488181
OBZQ01002809
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488190
OBZQ01003120
16842
Bacillota
CGA
Ser
>WENV180488252
OBZQ01005211
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180488186
OBZQ01003049
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180487960
OBZQ01000418
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488083
OBZQ01001155
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488085
OBZQ01001155
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488419
OBZQ01030790
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488151
OBZQ01002165
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180488216
OBZQ01003798
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180487878
OBZQ01000268
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180487992
OBZQ01000584
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180488073
OBZQ01001122
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180488159
OBZQ01002348
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180487959
OBZQ01000414
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180488425
OBZQ01033081
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180488135
OBZQ01001679
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180488137
OBZQ01001679
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180488156
OBZQ01002271
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180488179
OBZQ01002809
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180487821
OBZQ01000171
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488353
OBZQ01017701
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488391
OBZQ01026235
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488334
OBZQ01013756
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488056
OBZQ01000944
155273
Bacillota
CAT
Met
>WENV180488298
OBZQ01007832
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488300
OBZQ01008054
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488361
OBZQ01019459
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488406
OBZQ01027839
391536
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180487857
OBZQ01000236
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180488418
OBZQ01030790
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488016
OBZQ01000670
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180487944
OBZQ01000384
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180488041
OBZQ01000826
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180488239
OBZQ01004566
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180487751
OBZQ01000098
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180487802
OBZQ01000145
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488147
OBZQ01001906
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488152
OBZQ01002196
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180488163
OBZQ01002422
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180488113
OBZQ01001369
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180488180
OBZQ01002809
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488434
OBZQ01038714
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV180488134
OBZQ01001679
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488155
OBZQ01002271
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488405
OBZQ01027839
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180488407
OBZQ01027839
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV180488095
OBZQ01001215
149041
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488106
OBZQ01001274
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180488124
OBZQ01001495
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180488370
OBZQ01022515
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180488202
OBZQ01003284
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180488386
OBZQ01024792
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180487991
OBZQ01000584
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180487724
OBZQ01000083
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180487801
OBZQ01000145
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180487973
OBZQ01000489
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180487975
OBZQ01000489
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180487726
OBZQ01000084
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180488311
OBZQ01009964
147135
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180487820
OBZQ01000171
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488352
OBZQ01017701
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180487823
OBZQ01000171
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180487920
OBZQ01000338
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180487856
OBZQ01000236
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180488074
OBZQ01001122
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180488201
OBZQ01003284
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180488367
OBZQ01021722
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180488160
OBZQ01002348
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180488105
OBZQ01001263
342895
Bacillota
CAT
Met
>WENV180488234
OBZQ01004540
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180488148
OBZQ01001906
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180488398
OBZQ01027040
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180487996
OBZQ01000585
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180488244
OBZQ01004929
194150
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180488316
OBZQ01010647
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180488040
OBZQ01000811
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180488123
OBZQ01001488
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180488178
OBZQ01002792
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180488241
OBZQ01004585
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180487887
OBZQ01000285
256380
Bacillota
>WENV180488264
OBZQ01005574
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488266
OBZQ01005574
368876
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180488014
OBZQ01000670
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180488451
OBZQ01056472
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180488363
OBZQ01019668
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180488116
OBZQ01001420
243613
Bacillota
GTG
His
>WENV180488381
OBZQ01023503
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180488445
OBZQ01050230
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180488289
OBZQ01007214
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180487994
OBZQ01000585
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180487825
OBZQ01000171
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180487922
OBZQ01000338
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488125
OBZQ01001495
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180488313
OBZQ01010181
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180488357
OBZQ01018763
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180488295
OBZQ01007778
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180488196
OBZQ01003186
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180488345
OBZQ01015843
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180488371
OBZQ01022515
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180488107
OBZQ01001274
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180488377
OBZQ01023087
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180487855
OBZQ01000236
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180487903
OBZQ01000315
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180488228
OBZQ01004372
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180488168
OBZQ01002478
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180488296
OBZQ01007790
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180487725
OBZQ01000083
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180488064
OBZQ01001055
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180487964
OBZQ01000446
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180487909
OBZQ01000315
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV180488117
OBZQ01001420
343027
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180488102
OBZQ01001220
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK