This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
189 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180918222
ODTG01000032
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918314
ODTG01000101
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918316
ODTG01000103
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918731
ODTG01001863
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918765
ODTG01002196
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918808
ODTG01002773
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180919580
ODTG01171769
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918624
ODTG01000960
235102
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180919282
ODTG01047776
235102
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180918183
ODTG01000005
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918246
ODTG01000053
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918249
ODTG01000053
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918341
ODTG01000126
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918859
ODTG01003595
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918988
ODTG01008901
146761
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180918598
ODTG01000842
144657
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180918979
ODTG01008515
144657
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180918534
ODTG01000486
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918709
ODTG01001655
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918856
ODTG01003549
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918282
ODTG01000079
126966
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918283
ODTG01000079
126966
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918284
ODTG01000079
126966
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918356
ODTG01000140
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180918408
ODTG01000214
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180918435
ODTG01000253
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180918310
ODTG01000101
126965
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918563
ODTG01000660
150845
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180918897
ODTG01004606
150845
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180919138
ODTG01019480
153993
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180919183
ODTG01026173
153993
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180918325
ODTG01000109
339341
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919575
ODTG01171356
343138
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180918621
ODTG01000943
58715
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180918769
ODTG01002238
58715
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180918427
ODTG01000244
46165
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180919069
ODTG01013385
46165
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918673
ODTG01001229
17323
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180918392
ODTG01000189
95618
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180918644
ODTG01000988
24174
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV180918394
ODTG01000192
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918395
ODTG01000192
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918651
ODTG01001012
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918687
ODTG01001392
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918337
ODTG01000124
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918463
ODTG01000322
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918478
ODTG01000369
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918614
ODTG01000904
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918701
ODTG01001538
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918751
ODTG01002048
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918756
ODTG01002077
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918771
ODTG01002303
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918860
ODTG01003614
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918865
ODTG01003696
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918963
ODTG01006960
48053
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918229
ODTG01000041
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918431
ODTG01000247
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918437
ODTG01000257
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918591
ODTG01000825
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918758
ODTG01002079
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918917
ODTG01005220
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918962
ODTG01006920
411543
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180918995
ODTG01009148
411543
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180918449
ODTG01000283
59689
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180918620
ODTG01000943
59689
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180918475
ODTG01000364
80835
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180919592
ODTG01172045
155123
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180918877
ODTG01004019
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919039
ODTG01010854
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180918783
ODTG01002409
341950
Bacteroidota
>WENV180919055
ODTG01012271
341950
Bacteroidota
>WENV180918445
ODTG01000272
338124
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV180918221
ODTG01000030
146800
Bacteroidota
>WENV180918934
ODTG01005955
168744
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180918911
ODTG01005032
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918956
ODTG01006851
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180919042
ODTG01011053
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180919568
ODTG01169388
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180919599
ODTG01172147
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918364
ODTG01000147
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180918428
ODTG01000244
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180918429
ODTG01000244
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180918382
ODTG01000175
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918383
ODTG01000175
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918828
ODTG01003073
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918927
ODTG01005763
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180919048
ODTG01011828
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180918233
ODTG01000045
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918321
ODTG01000108
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918357
ODTG01000141
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918439
ODTG01000265
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918556
ODTG01000612
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918837
ODTG01003338
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180919567
ODTG01169101
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180918430
ODTG01000244
45423
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180918829
ODTG01003131
58714
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180918930
ODTG01005816
235165
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180918433
ODTG01000251
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918523
ODTG01000460
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918565
ODTG01000671
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918711
ODTG01001672
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918841
ODTG01003370
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918245
ODTG01000051
144656
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180918265
ODTG01000065
144656
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180918388
ODTG01000181
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918470
ODTG01000360
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918541
ODTG01000526
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918576
ODTG01000746
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918777
ODTG01002363
144659
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180918853
ODTG01003522
144659
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180918791
ODTG01002537
235180
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180918980
ODTG01008515
235180
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180918471
ODTG01000363
144596
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180918278
ODTG01000072
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180918570
ODTG01000719
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180919040
ODTG01011041
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180919566
ODTG01168784
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180919577
ODTG01171563
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180919442
ODTG01109367
113604
Bacteroidota
>WENV180918324
ODTG01000109
80614
Bacteroidota
>WENV180918514
ODTG01000433
80614
Bacteroidota
>WENV180918579
ODTG01000756
80614
Bacteroidota
>WENV180919578
ODTG01171683
80614
Bacteroidota
>WENV180918480
ODTG01000377
154643
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180918816
ODTG01002871
154643
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180919267
ODTG01044140
144590
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180919585
ODTG01171946
144590
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180918605
ODTG01000880
95559
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180918351
ODTG01000136
419272
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180918367
ODTG01000153
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180919012
ODTG01009676
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180918712
ODTG01001681
144639
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180918716
ODTG01001717
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180918717
ODTG01001717
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180919070
ODTG01013474
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180918660
ODTG01001103
95875
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180918786
ODTG01002443
95875
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180918399
ODTG01000200
240012
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV180918727
ODTG01001801
240012
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV180918184
ODTG01000005
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180918204
ODTG01000019
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180918347
ODTG01000129
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180918485
ODTG01000391
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918976
ODTG01008433
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180919341
ODTG01065278
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180918849
ODTG01003486
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180919584
ODTG01171909
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180919126
ODTG01017906
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180919127
ODTG01017906
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180919128
ODTG01017906
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180919010
ODTG01009506
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919088
ODTG01014953
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919332
ODTG01062505
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919333
ODTG01062899
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180919420
ODTG01092998
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180918191
ODTG01000010
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918296
ODTG01000086
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918353
ODTG01000136
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918536
ODTG01000490
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918615
ODTG01000921
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918749
ODTG01002044
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180919593
ODTG01172046
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180918230
ODTG01000042
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918648
ODTG01000990
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918772
ODTG01002312
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180919404
ODTG01086006
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180918327
ODTG01000112
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180918328
ODTG01000112
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180918425
ODTG01000243
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180919108
ODTG01016420
146530
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV180918434
ODTG01000253
23696
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV180918446
ODTG01000277
414426
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180918623
ODTG01000953
414426
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180918531
ODTG01000475
59498
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180918606
ODTG01000881
16224
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180918743
ODTG01001961
16224
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180919169
ODTG01023154
151960
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180918352
ODTG01000136
16220
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180918213
ODTG01000023
338125
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180918254
ODTG01000056
338125
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180918577
ODTG01000748
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918595
ODTG01000833
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918619
ODTG01000943
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918767
ODTG01002238
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180919091
ODTG01015078
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180919093
ODTG01015078
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180919206
ODTG01030433
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180918181
ODTG01000003
411629
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180918542
ODTG01000531
411629
Bacteroidota
TTG
Gln
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK