This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
168 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV181466280
OGEQ01003640
243647
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181465977
OGEQ01001077
16842
Bacillota
CGA
Ser
>WENV181466511
OGEQ01010000
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181465821
OGEQ01000525
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181466089
OGEQ01001804
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181466425
OGEQ01006795
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181466430
OGEQ01007113
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181466478
OGEQ01008540
146699
Bacillota
TCG
Arg
>WENV181465642
OGEQ01000149
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181466001
OGEQ01001227
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181465786
OGEQ01000434
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV181465733
OGEQ01000332
18465
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466229
OGEQ01002860
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV181466312
OGEQ01004071
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV181466409
OGEQ01006226
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV181465611
OGEQ01000110
80838
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181466663
OGEQ01021754
340263
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181466144
OGEQ01002157
37089
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181465792
OGEQ01000453
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181465805
OGEQ01000489
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181465911
OGEQ01000829
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181466343
OGEQ01004653
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181466420
OGEQ01006624
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181465734
OGEQ01000332
146697
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181465610
OGEQ01000110
237285
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181466014
OGEQ01001259
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181465661
OGEQ01000169
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181466285
OGEQ01003670
237286
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181466483
OGEQ01008890
295019
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181465538
OGEQ01000039
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181466620
OGEQ01015814
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181466160
OGEQ01002360
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181465499
OGEQ01000002
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181465790
OGEQ01000449
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181465904
OGEQ01000784
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466099
OGEQ01001857
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466754
OGEQ01039461
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181466633
OGEQ01018052
152047
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181466664
OGEQ01021754
241761
Bacillota
TAC
Val
>WENV181465565
OGEQ01000064
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181465742
OGEQ01000338
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181466284
OGEQ01003670
412107
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181466533
OGEQ01010767
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV181465507
OGEQ01000011
80839
Bacillota
GAG
Leu
>WENV181465536
OGEQ01000039
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181465537
OGEQ01000039
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181466390
OGEQ01005667
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466542
OGEQ01011255
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466358
OGEQ01004846
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181466387
OGEQ01005638
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181466244
OGEQ01003185
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV181466145
OGEQ01002181
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181466378
OGEQ01005308
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181466499
OGEQ01009527
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181466695
OGEQ01026164
338550
Bacillota
>WENV181466322
OGEQ01004235
37437
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181466013
OGEQ01001259
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181466225
OGEQ01002812
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466449
OGEQ01007653
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466564
OGEQ01012596
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466583
OGEQ01013066
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466143
OGEQ01002157
146698
Bacillota
CAT
Met
>WENV181466227
OGEQ01002812
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV181466451
OGEQ01007653
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV181466566
OGEQ01012596
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV181466585
OGEQ01013066
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV181466301
OGEQ01003961
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466319
OGEQ01004207
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466427
OGEQ01006834
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466517
OGEQ01010372
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181466589
OGEQ01013409
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181465825
OGEQ01000526
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181466175
OGEQ01002454
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181466254
OGEQ01003342
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181465748
OGEQ01000354
39475
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181465879
OGEQ01000708
258936
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181466658
OGEQ01021344
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181466700
OGEQ01027176
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181466800
OGEQ01056162
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181466423
OGEQ01006653
147135
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181466288
OGEQ01003670
339364
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466521
OGEQ01010429
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181465563
OGEQ01000064
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV181465824
OGEQ01000526
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181466038
OGEQ01001461
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181466074
OGEQ01001687
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181466174
OGEQ01002454
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181466253
OGEQ01003342
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181466372
OGEQ01005210
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181465806
OGEQ01000489
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181465912
OGEQ01000829
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466344
OGEQ01004653
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466421
OGEQ01006624
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181466165
OGEQ01002392
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV181466247
OGEQ01003255
342895
Bacillota
CAT
Met
>WENV181466402
OGEQ01006117
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181465609
OGEQ01000110
339362
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466416
OGEQ01006511
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181466452
OGEQ01007669
194150
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181466351
OGEQ01004809
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181465999
OGEQ01001216
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466128
OGEQ01002044
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466215
OGEQ01002659
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466410
OGEQ01006325
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466011
OGEQ01001243
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181466283
OGEQ01003670
339363
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181466234
OGEQ01002981
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181466105
OGEQ01001926
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181466273
OGEQ01003615
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181466383
OGEQ01005485
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181466328
OGEQ01004406
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181466047
OGEQ01001503
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181466224
OGEQ01002812
368876
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181465762
OGEQ01000388
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181466287
OGEQ01003670
237287
Bacillota
GTG
His
>WENV181465913
OGEQ01000840
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181466239
OGEQ01003100
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181465767
OGEQ01000397
59079
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181466067
OGEQ01001654
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181466341
OGEQ01004619
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181466278
OGEQ01003640
243613
Bacillota
GTG
His
>WENV181465765
OGEQ01000390
292519
Bacillota
CAT
Met
>WENV181465987
OGEQ01001155
292519
Bacillota
CAT
Met
>WENV181465736
OGEQ01000332
23575
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181466114
OGEQ01001967
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181466562
OGEQ01012530
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181465995
OGEQ01001197
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466302
OGEQ01003961
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466320
OGEQ01004207
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466428
OGEQ01006834
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466518
OGEQ01010372
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181466590
OGEQ01013409
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181465580
OGEQ01000077
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181465741
OGEQ01000338
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181465529
OGEQ01000033
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV181466286
OGEQ01003670
145469
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181466471
OGEQ01008159
152491
Bacillota
CAT
Met
>WENV181465704
OGEQ01000268
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181465550
OGEQ01000049
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181465768
OGEQ01000401
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181466338
OGEQ01004543
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181466216
OGEQ01002668
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181466507
OGEQ01009869
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181465706
OGEQ01000271
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181466467
OGEQ01008159
273029
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181465557
OGEQ01000060
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181466470
OGEQ01008159
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181466204
OGEQ01002587
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181466454
OGEQ01007669
178024
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181465732
OGEQ01000332
16361
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181465612
OGEQ01000110
237288
Bacillota
CCA
Trp
>WENV181465735
OGEQ01000332
339361
Bacillota
CCT
Arg
>WENV181466240
OGEQ01003129
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV181466316
OGEQ01004132
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV181466329
OGEQ01004411
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV181465739
OGEQ01000338
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181466057
OGEQ01001544
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181466353
OGEQ01004814
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181466354
OGEQ01004816
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181465598
OGEQ01000095
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181466360
OGEQ01004959
376360
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181466279
OGEQ01003640
343027
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181466171
OGEQ01002443
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181466220
OGEQ01002710
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181466252
OGEQ01003320
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181466595
OGEQ01013847
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181466205
OGEQ01002587
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181466289
OGEQ01003670
237283
Bacillota
TTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK