This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
56 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV182059473
OHEQ01034375
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182058957
OHEQ01000184
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182059229
OHEQ01002876
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV182059192
OHEQ01001885
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182059137
OHEQ01001251
340263
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182059191
OHEQ01001885
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182059232
OHEQ01002907
148348
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182059320
OHEQ01007563
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182059421
OHEQ01019972
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182059304
OHEQ01006434
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182058983
OHEQ01000219
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182059095
OHEQ01000874
239080
Bacillota
CTG
Gln
>WENV182059384
OHEQ01014479
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182058909
OHEQ01000112
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182058981
OHEQ01000218
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059005
OHEQ01000286
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059110
OHEQ01000967
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059461
OHEQ01031454
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182059383
OHEQ01014296
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182059230
OHEQ01002876
338143
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059436
OHEQ01022391
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059358
OHEQ01012182
388249
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182059059
OHEQ01000582
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182059339
OHEQ01009647
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182058982
OHEQ01000219
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV182059233
OHEQ01002907
239076
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182059075
OHEQ01000688
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV182059210
OHEQ01002326
340265
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182059437
OHEQ01023232
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182059020
OHEQ01000343
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182059224
OHEQ01002738
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV182059181
OHEQ01001756
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182059044
OHEQ01000463
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV182059420
OHEQ01019972
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182059116
OHEQ01001047
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV182059470
OHEQ01033939
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV182059178
OHEQ01001686
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182059138
OHEQ01001251
239079
Bacillota
TAC
Val
>WENV182059471
OHEQ01034232
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182059022
OHEQ01000348
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182059222
OHEQ01002734
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV182058996
OHEQ01000253
237846
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182059438
OHEQ01023908
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182059271
OHEQ01004360
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182059212
OHEQ01002366
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182058895
OHEQ01000090
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182059266
OHEQ01004008
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182059128
OHEQ01001205
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182059211
OHEQ01002340
21693
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182059442
OHEQ01023936
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182059136
OHEQ01001251
239078
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182059321
OHEQ01007574
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182059308
OHEQ01006698
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182058908
OHEQ01000112
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182059156
OHEQ01001405
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182059309
OHEQ01006698
245344
Bacillota
GAA
Phe
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK