This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
122 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV182674898
OJNQ01000454
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675691
OJNQ01014792
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675732
OJNQ01016345
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675407
OJNQ01006312
235102
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV182675787
OJNQ01018847
235102
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV182675292
OJNQ01004172
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV182675350
OJNQ01005264
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV182674905
OJNQ01000486
144657
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182674893
OJNQ01000423
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV182675025
OJNQ01001055
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV182675521
OJNQ01009518
339341
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV182675082
OJNQ01001422
343138
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV182674882
OJNQ01000396
58715
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV182674785
OJNQ01000155
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV182675366
OJNQ01005426
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV182674881
OJNQ01000396
59689
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV182675145
OJNQ01002020
436206
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV182675190
OJNQ01002778
436206
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV182675509
OJNQ01009245
436206
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV182675653
OJNQ01013421
436206
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV182675796
OJNQ01019565
436206
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV182674915
OJNQ01000526
20893
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV182675295
OJNQ01004238
20893
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV182675562
OJNQ01010534
128251
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV182676294
OJNQ01074802
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV182674694
OJNQ01000054
145504
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV182674852
OJNQ01000289
338124
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV182675561
OJNQ01010467
338124
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV182675301
OJNQ01004366
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675527
OJNQ01009679
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675550
OJNQ01010089
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182674824
OJNQ01000211
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV182674825
OJNQ01000211
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV182675001
OJNQ01000939
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV182675039
OJNQ01001114
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV182674750
OJNQ01000102
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182674821
OJNQ01000206
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182674879
OJNQ01000391
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182675196
OJNQ01002889
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182675288
OJNQ01004053
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182675422
OJNQ01006683
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182675532
OJNQ01009763
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV182674826
OJNQ01000211
45423
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182674853
OJNQ01000290
58714
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV182675004
OJNQ01000942
235165
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV182675168
OJNQ01002385
280660
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV182675068
OJNQ01001286
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182675101
OJNQ01001535
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182675250
OJNQ01003515
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182675281
OJNQ01003962
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182675486
OJNQ01008594
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182676127
OJNQ01047196
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV182674762
OJNQ01000120
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182674978
OJNQ01000812
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182675159
OJNQ01002211
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182675595
OJNQ01011326
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182675016
OJNQ01001018
303954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV182675937
OJNQ01028797
144656
Bacteroidota
GTG
His
>WENV182674934
OJNQ01000585
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV182674906
OJNQ01000486
235180
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV182675083
OJNQ01001425
144596
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182675392
OJNQ01005827
144596
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182674920
OJNQ01000555
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV182675161
OJNQ01002266
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV182674974
OJNQ01000795
80614
Bacteroidota
>WENV182674977
OJNQ01000807
80614
Bacteroidota
>WENV182675235
OJNQ01003332
80614
Bacteroidota
>WENV182675298
OJNQ01004310
80614
Bacteroidota
>WENV182674874
OJNQ01000371
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182675254
OJNQ01003583
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182675388
OJNQ01005754
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182675458
OJNQ01007655
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182675652
OJNQ01013403
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182676016
OJNQ01036283
144590
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV182676017
OJNQ01036283
144590
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV182675861
OJNQ01023037
95559
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV182675187
OJNQ01002680
419272
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675165
OJNQ01002341
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182676038
OJNQ01038771
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182674775
OJNQ01000138
144639
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182675658
OJNQ01013647
263771
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV182675080
OJNQ01001422
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV182675081
OJNQ01001422
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV182674759
OJNQ01000119
95875
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV182674758
OJNQ01000117
139743
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV182674885
OJNQ01000412
139743
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV182675294
OJNQ01004191
139743
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV182674703
OJNQ01000061
240012
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV182675579
OJNQ01010906
240012
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV182674958
OJNQ01000724
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV182675071
OJNQ01001304
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV182675412
OJNQ01006416
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV182675619
OJNQ01012021
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV182674686
OJNQ01000041
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182675859
OJNQ01022961
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV182675300
OJNQ01004353
280513
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182674652
OJNQ01000006
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV182674653
OJNQ01000006
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV182675827
OJNQ01021202
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV182674753
OJNQ01000112
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182674754
OJNQ01000112
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675918
OJNQ01026910
50727
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV182675795
OJNQ01019414
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV182674916
OJNQ01000534
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675166
OJNQ01002348
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675167
OJNQ01002353
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675656
OJNQ01013631
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV182675115
OJNQ01001686
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV182675504
OJNQ01009159
19317
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV182675505
OJNQ01009162
19317
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV182674669
OJNQ01000022
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV182674670
OJNQ01000022
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV182674845
OJNQ01000269
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV182674846
OJNQ01000269
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV182675036
OJNQ01001113
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV182674823
OJNQ01000206
23696
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV182674892
OJNQ01000423
23696
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV182675943
OJNQ01028950
151960
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV182676215
OJNQ01058976
338125
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV182674880
OJNQ01000396
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV182675548
OJNQ01010052
313363
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV182675898
OJNQ01025709
411629
Bacteroidota
TTG
Gln
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK