This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
107 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180818141
ODJQ01009623
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180818635
ODJQ01048951
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818827
ODJQ01093511
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818839
ODJQ01096552
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818924
ODJQ01127296
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818685
ODJQ01055321
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180819167
ODJQ01300446
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818686
ODJQ01055321
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180819151
ODJQ01297185
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818546
ODJQ01034184
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180817894
ODJQ01003988
229015
Bacillota
GTG
His
>WENV180818799
ODJQ01084982
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV180817945
ODJQ01004778
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV180818655
ODJQ01051371
302145
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818835
ODJQ01096235
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818691
ODJQ01055792
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180818811
ODJQ01089051
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV180818804
ODJQ01086510
236579
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818423
ODJQ01022691
348419
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180818185
ODJQ01010838
179563
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818906
ODJQ01120114
295166
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180817992
ODJQ01005731
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV180817845
ODJQ01003279
82124
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180818122
ODJQ01009073
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180819157
ODJQ01298851
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV180818433
ODJQ01023683
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV180818120
ODJQ01009066
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180817952
ODJQ01004880
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180818193
ODJQ01011071
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818640
ODJQ01049543
175825
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180817790
ODJQ01002759
280427
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817523
ODJQ01000948
280427
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818946
ODJQ01141952
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818868
ODJQ01110947
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818905
ODJQ01120112
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817874
ODJQ01003671
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180818950
ODJQ01144586
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818826
ODJQ01093269
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818555
ODJQ01035904
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818387
ODJQ01020557
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818455
ODJQ01026249
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180818639
ODJQ01049543
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818296
ODJQ01015490
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180819081
ODJQ01239451
175847
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180819075
ODJQ01234475
175847
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818786
ODJQ01080260
290325
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180819135
ODJQ01296124
290325
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818719
ODJQ01061191
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180818184
ODJQ01010838
353153
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180817930
ODJQ01004480
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180819033
ODJQ01201843
179810
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180817893
ODJQ01003988
179810
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180817477
ODJQ01000789
179810
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180818658
ODJQ01051374
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818300
ODJQ01015531
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180817431
ODJQ01000630
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818194
ODJQ01011071
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818952
ODJQ01144935
183957
Bacillota
CCT
Arg
>WENV180817505
ODJQ01000904
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180817457
ODJQ01000749
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180818420
ODJQ01022586
484885
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180818843
ODJQ01098336
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180818181
ODJQ01010807
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180818091
ODJQ01007900
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180818762
ODJQ01073227
314834
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818860
ODJQ01103948
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180819145
ODJQ01296798
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180818585
ODJQ01040785
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180818215
ODJQ01011846
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180818043
ODJQ01006964
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180819020
ODJQ01194643
175899
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818457
ODJQ01026294
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180818801
ODJQ01086080
332891
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818409
ODJQ01022177
323864
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180819119
ODJQ01284557
432453
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818789
ODJQ01080657
186051
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818288
ODJQ01015370
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180817868
ODJQ01003560
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818333
ODJQ01017495
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180818163
ODJQ01010375
342104
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817557
ODJQ01001071
342104
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817469
ODJQ01000778
223045
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818192
ODJQ01010982
223045
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818620
ODJQ01045822
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180819077
ODJQ01234899
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180818346
ODJQ01018140
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180817993
ODJQ01005731
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180817392
ODJQ01000532
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180817730
ODJQ01002334
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180818945
ODJQ01141952
175915
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180817747
ODJQ01002412
52748
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180819120
ODJQ01284557
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817998
ODJQ01005960
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180817878
ODJQ01003684
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180817877
ODJQ01003684
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180817933
ODJQ01004480
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180818480
ODJQ01028408
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV180817478
ODJQ01000789
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV180818662
ODJQ01052059
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180818836
ODJQ01096235
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818684
ODJQ01055321
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818332
ODJQ01017495
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818754
ODJQ01070436
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818195
ODJQ01011071
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180817382
ODJQ01000516
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818119
ODJQ01009066
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180817808
ODJQ01002806
280473
Bacillota
TGG
Pro
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK