This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
140 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180993415
ODVQ01002508
285360
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993621
ODVQ01005118
117741
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180993658
ODVQ01006015
117741
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180993217
ODVQ01001129
398829
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180993741
ODVQ01008307
398829
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180993742
ODVQ01008310
398829
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180993205
ODVQ01001069
175838
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180994751
ODVQ01267127
175838
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180992713
ODVQ01000023
175904
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993818
ODVQ01010982
289031
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993683
ODVQ01006556
289031
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993638
ODVQ01005501
289031
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993011
ODVQ01000372
289031
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993941
ODVQ01016332
280557
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993622
ODVQ01005208
280557
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180992895
ODVQ01000167
280557
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180992847
ODVQ01000101
280557
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993103
ODVQ01000606
20492
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180994426
ODVQ01088668
20206
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180993784
ODVQ01009594
483416
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180992885
ODVQ01000156
483416
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180993406
ODVQ01002413
398871
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180993405
ODVQ01002413
398871
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180994519
ODVQ01124672
201819
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993637
ODVQ01005446
56493
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180992742
ODVQ01000036
56493
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180993318
ODVQ01001654
175903
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180993301
ODVQ01001569
175903
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180992682
ODVQ01000007
175903
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180994761
ODVQ01267342
351598
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993601
ODVQ01004772
351598
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993456
ODVQ01002881
351598
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993374
ODVQ01002127
351598
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993075
ODVQ01000463
351598
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180993268
ODVQ01001399
291612
Bacteroidota
>WENV180993086
ODVQ01000534
291612
Bacteroidota
>WENV180992796
ODVQ01000058
156068
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180992666
ODVQ01000002
118089
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180992829
ODVQ01000088
203954
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180992707
ODVQ01000019
203954
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180993636
ODVQ01005426
178907
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180994759
ODVQ01267277
172085
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180994617
ODVQ01179434
29791
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV180992760
ODVQ01000043
182267
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180992900
ODVQ01000177
20449
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180994468
ODVQ01102684
178133
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180993855
ODVQ01012260
21127
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180994513
ODVQ01120021
56072
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180993686
ODVQ01006626
56072
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180993168
ODVQ01000883
56072
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180992748
ODVQ01000037
175886
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180994000
ODVQ01019940
175902
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180993039
ODVQ01000401
179697
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV180994618
ODVQ01179434
398860
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180994195
ODVQ01038861
480404
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180993915
ODVQ01014755
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180993438
ODVQ01002791
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180993296
ODVQ01001534
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180993169
ODVQ01000886
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180992897
ODVQ01000171
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180992805
ODVQ01000064
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180992799
ODVQ01000060
174201
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180993876
ODVQ01013249
280451
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180992727
ODVQ01000028
280451
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180992840
ODVQ01000095
418894
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180992839
ODVQ01000095
418894
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180994748
ODVQ01266373
99847
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180993513
ODVQ01003531
99847
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180993109
ODVQ01000619
99847
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180993009
ODVQ01000366
99847
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180992918
ODVQ01000197
399200
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180992862
ODVQ01000136
399200
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180994385
ODVQ01077863
186874
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993113
ODVQ01000651
186874
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180993819
ODVQ01011000
488746
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180992803
ODVQ01000064
488746
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180993579
ODVQ01004462
280478
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180993019
ODVQ01000384
280478
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180993017
ODVQ01000384
280478
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180992804
ODVQ01000064
27524
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180993093
ODVQ01000591
186108
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180992822
ODVQ01000079
187400
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180992821
ODVQ01000079
187400
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180993344
ODVQ01001929
175844
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180992984
ODVQ01000322
175844
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180992756
ODVQ01000042
175844
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180992877
ODVQ01000151
280515
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180993680
ODVQ01006430
183889
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180993618
ODVQ01005016
183889
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180993752
ODVQ01008574
480318
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180994094
ODVQ01028953
186142
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180993521
ODVQ01003631
398828
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV180993245
ODVQ01001258
398828
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV180992744
ODVQ01000036
398828
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV180994007
ODVQ01020152
159415
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180994006
ODVQ01020152
159415
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180993442
ODVQ01002802
140771
Bacteroidota
>WENV180993792
ODVQ01009861
176192
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180992753
ODVQ01000039
176192
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180992904
ODVQ01000177
400088
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180994745
ODVQ01266154
69204
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180994502
ODVQ01115626
69204
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180993799
ODVQ01010526
69204
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180993486
ODVQ01003170
69204
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180993211
ODVQ01001084
69204
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180994341
ODVQ01067289
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993755
ODVQ01008628
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993510
ODVQ01003510
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993417
ODVQ01002548
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993224
ODVQ01001182
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180992974
ODVQ01000305
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180992726
ODVQ01000027
280446
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993465
ODVQ01002989
484496
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180993052
ODVQ01000440
484496
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180992894
ODVQ01000166
484496
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180994309
ODVQ01059550
27502
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180993632
ODVQ01005346
27502
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180993289
ODVQ01001458
27502
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180992690
ODVQ01000011
27502
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180992752
ODVQ01000039
285750
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV180994765
ODVQ01267424
373714
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180993080
ODVQ01000484
373714
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180992941
ODVQ01000237
188555
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180994095
ODVQ01028953
186143
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV180993412
ODVQ01002467
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993276
ODVQ01001434
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993199
ODVQ01001004
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993111
ODVQ01000636
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993013
ODVQ01000375
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180992843
ODVQ01000098
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180992830
ODVQ01000089
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180992709
ODVQ01000020
365112
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180993623
ODVQ01005216
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180993563
ODVQ01004253
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180993372
ODVQ01002114
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180993331
ODVQ01001783
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180993056
ODVQ01000443
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180992939
ODVQ01000221
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180992792
ODVQ01000056
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180992787
ODVQ01000054
398836
Bacteroidota
GCA
Cys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK