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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
1
, Akira Muto
6
, Yo Kikuchi
1
, Hachiro Inokuchi
1
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA gene List
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
HIT:
93 sequence(s).
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The reliable tRNA genes
All candidate tRNA genes
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
>WENV180845174
ODKS01001915
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
73
1
-
Asn
GTT
[ENA]
¡û
>WENV180845167
ODKS01000109
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
109
35
-
Leu
CAA
[ENA]
¡û
>WENV180845173
ODKS01000756
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
119
45
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV180845172
ODKS01000376
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
186
111
-
Ala
TGC
[ENA]
¡û
>WENV180845137
ODKS01000017
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
204
132
-
Thr
CGT
[ENA]
¡û
>WENV180845171
ODKS01000376
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
295
222
-
Ile
GAT
[ENA]
¡û
>WENV180845166
ODKS01000109
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
348
421
+
Arg
TCT
[ENA]
¡û
>WENV180845152
ODKS01000041
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
1570
1496
-
Lys
CTT
[ENA]
¡û
>WENV180845133
ODKS01000017
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
2420
2493
+
Gln
TTG
[ENA]
¡û
>WENV180845156
ODKS01000050
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
2430
2505
+
His
GTG
[ENA]
¡û
>WENV180845170
ODKS01000133
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3034
3119
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>WENV180845094
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3137
3211
+
Val
TAC
[ENA]
¡û
>WENV180845158
ODKS01000065
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3212
3138
-
Pro
CGG
[ENA]
¡û
>WENV180845095
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3216
3290
+
Lys
TTT
[ENA]
¡û
>WENV180845096
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3304
3385
+
Leu
TAG
[ENA]
¡û
>WENV180845165
ODKS01000106
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3367
3286
-
Leu
TAG
[ENA]
¡û
>WENV180845097
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3415
3489
+
Thr
TGT
[ENA]
¡û
>WENV180845164
ODKS01000106
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3477
3404
-
Thr
CGT
[ENA]
¡û
>WENV180845126
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3482
3555
+
Gly
GCC
[ENA]
¡û
>WENV180845098
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3500
3571
+
Gly
GCC
[ENA]
¡û
>WENV180845134
ODKS01000017
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3542
3624
+
Tyr
GTA
[ENA]
¡û
>WENV180845127
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3583
3654
+
Cys
GCA
[ENA]
¡û
>WENV180845099
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3584
3670
+
Leu
TAA
[ENA]
¡û
>WENV180845162
ODKS01000097
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3595
3521
-
Met
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845135
ODKS01000017
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3629
3702
+
Gln
TTG
[ENA]
¡û
>WENV180845100
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3678
3753
+
Arg
ACG
[ENA]
¡û
>WENV180845128
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3685
3757
+
Val
GAC
[ENA]
¡û
>WENV180845161
ODKS01000097
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3754
3672
-
Tyr
GTA
[ENA]
¡û
>WENV180845101
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3756
3831
+
Pro
TGG
[ENA]
¡û
>WENV180845129
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3797
3870
+
Val
CAC
[ENA]
¡û
>WENV180845102
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3861
3936
+
Met
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845103
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3945
4020
+
Ile2
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845169
ODKS01000120
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
3998
3915
-
Leu
CAG
[ENA]
¡û
>WENV180845104
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4053
4128
+
fMet
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845105
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4130
4205
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV180845163
ODKS01000099
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4201
4128
-
Ala
GGC
[ENA]
¡û
>WENV180845106
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4211
4285
+
Phe
GAA
[ENA]
¡û
>WENV180845107
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4382
4457
+
Ile
GAT
[ENA]
¡û
>WENV180845108
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4459
4550
+
Ser
GCT
[ENA]
¡û
>WENV180845168
ODKS01000112
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
4912
4837
-
Arg
ACG
[ENA]
¡û
>WENV180845093
ODKS01000005
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
5321
5248
-
Gly
CCC
[ENA]
¡û
>WENV180845083
ODKS01000002
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
6551
6465
-
Ser
CGA
[ENA]
¡û
>WENV180845160
ODKS01000087
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
6674
6748
+
Val
TAC
[ENA]
¡û
>WENV180845155
ODKS01000048
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
6729
6657
-
Glu
TTC
[ENA]
¡û
>WENV180845159
ODKS01000086
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
6866
6791
-
Trp
CCA
[ENA]
¡û
>WENV180845140
ODKS01000023
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
6893
6821
-
Gln
CTG
[ENA]
¡û
>WENV180845139
ODKS01000023
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
7006
6933
-
Glu
CTC
[ENA]
¡û
>WENV180845132
ODKS01000013
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
7715
7789
+
fMet
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845154
ODKS01000048
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
8059
7985
-
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV180845109
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
8716
8787
+
Glu
TTC
[ENA]
¡û
>WENV180845110
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
8825
8915
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>WENV180845111
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
8923
8998
+
fMet
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845112
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9000
9075
+
Asp
GTC
[ENA]
¡û
>WENV180845113
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9081
9155
+
Phe
GAA
[ENA]
¡û
>WENV180845114
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9163
9246
+
Tyr
GTA
[ENA]
¡û
>WENV180845115
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9249
9321
+
Trp
CCA
[ENA]
¡û
>WENV180845116
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9334
9407
+
His
GTG
[ENA]
¡û
>WENV180845117
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9459
9529
+
Cys
GCA
[ENA]
¡û
>WENV180845150
ODKS01000040
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9508
9582
+
Pro
TGG
[ENA]
¡û
>WENV180845118
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9556
9641
+
Leu
CAA
[ENA]
¡û
>WENV180845151
ODKS01000041
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
9993
10066
+
Arg
CCT
[ENA]
¡û
>WENV180845092
ODKS01000005
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
11078
11005
-
Ala
TGC
[ENA]
¡û
>WENV180845091
ODKS01000005
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
11184
11110
-
Ile
GAT
[ENA]
¡û
>WENV180845149
ODKS01000036
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
12497
12582
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>WENV180845153
ODKS01000044
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
12779
12852
+
Arg
CCG
[ENA]
¡û
>WENV180845142
ODKS01000029
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
13379
13453
+
Arg
ACG
[ENA]
¡û
>WENV180845157
ODKS01000050
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
14952
15023
+
Gln
TTG
[ENA]
¡û
>WENV180845146
ODKS01000032
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
15062
14988
-
Ile2
CAT
[ENA]
¡û
>WENV180845141
ODKS01000026
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
16025
15950
-
Gly
GCC
[ENA]
¡û
>WENV180845136
ODKS01000017
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
17155
17242
+
Leu
AAG
[ENA]
¡û
>WENV180845147
ODKS01000033
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
17261
17334
+
Glu
CTC
[ENA]
¡û
>WENV180845148
ODKS01000033
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
17339
17411
+
Gln
CTG
[ENA]
¡û
>WENV180845138
ODKS01000018
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
21961
22044
+
Leu
CAG
[ENA]
¡û
>WENV180845121
ODKS01000008
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
24067
24141
+
Thr
AGT
[ENA]
¡û
>WENV180845145
ODKS01000031
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
27546
27472
-
Val
TAC
[ENA]
¡û
>WENV180845144
ODKS01000031
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
27623
27550
-
Glu
TTC
[ENA]
¡û
>WENV180845143
ODKS01000031
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
27800
27708
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>WENV180845125
ODKS01000010
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
40906
40820
-
Ser
CGA
[ENA]
¡û
>WENV180845120
ODKS01000007
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
43211
43136
-
Arg
CCT
[ENA]
¡û
>WENV180845130
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
57392
57476
+
Leu
TAA
[ENA]
¡û
>WENV180845123
ODKS01000008
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
61544
61471
-
Lys
CTT
[ENA]
¡û
>WENV180845131
ODKS01000011
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
62829
62754
-
Asn
GTT
[ENA]
¡û
>WENV180845122
ODKS01000008
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
64541
64468
-
Lys
CTT
[ENA]
¡û
>WENV180845119
ODKS01000006
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
68278
68354
+
Arg
TCT
[ENA]
¡û
>WENV180845088
ODKS01000003
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
69959
69887
-
Gly
GCC
[ENA]
¡û
>WENV180845087
ODKS01000003
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
70093
70018
-
Pro
CGG
[ENA]
¡û
>WENV180845086
ODKS01000003
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
70209
70135
-
Gly
GCC
[ENA]
¡û
>WENV180845124
ODKS01000010
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
70911
70824
-
Ser
GCT
[ENA]
¡û
>WENV180845090
ODKS01000005
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
72190
72116
-
Thr
TGT
[ENA]
¡û
>WENV180845089
ODKS01000005
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
93007
92934
-
Lys
TTT
[ENA]
¡û
>WENV180845084
ODKS01000003
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
138653
138723
+
Gly
CCC
[ENA]
¡û
>WENV180845085
ODKS01000003
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
146013
145941
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>WENV180845082
ODKS01000002
[ODKS] human metagenome; G_DNA_Posterior fornix
161622
161695
+
Arg
CCG
[ENA]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Download Sequence
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