This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes clustered and arranged according to each identical group
HIT:
1 Group(s).
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No.
Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Identical group No.12437 (220 seq.)
>W131044756
AMQX01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRHMDP3 [AMQX]
217793
217702
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710979145
LPNT01000036
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNT]
112148
112057
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710979210
LPNU01000052
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNU]
112496
112405
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710979321
LPNW01000062
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNW]
47706
47615
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711093152
LTET01000060
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC066G01 [LTET]
42
133
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711097153
LTIK01000030
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC078F07 [LTIK]
2881
2790
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711097409
LTIR01000048
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC077C11 [LTIR]
2866
2775
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711097835
LTJB01000014
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC064F12 [LTJB]
42
133
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711098129
LTJI01000033
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC068B07 [LTJI]
13270
13179
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711098500
LTJQ01000044
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC072E07 [LTJQ]
2872
2781
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711107574
LTSY01000026
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073D04 [LTSY]
435
526
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711109724
LTUW01000147
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC056D05 [LTUW]
42
133
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711109880
LTVA01000159
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC075D02 [LTVA]
121
212
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711110899
LTVY01000130
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073B09 [LTVY]
2900
2809
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711113122
LTXZ01000180
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC061B07 [LTXZ]
18456
18365
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711172109
LWBT01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
211513
211422
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W131204246
ATBI01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CRL1505 [ATBI]
341
432
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711299231
MAGA01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MAGA]
211
302
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711461613
MJHB01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MJHB]
28
119
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711517830
MLJZ01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLJZ]
431
522
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711517856
MLKA01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKA]
426
517
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711517908
MLKB01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKB]
424
515
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711517963
MLKC01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKC]
339
430
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711708076
MSTB01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTB]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711708163
MSTC01000070
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTC]
14
105
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711721938
MTJY01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MTJY]
116
207
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1711798476
MWVF01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MWVF]
233220
233129
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>C171030554
CP014201
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BFE5264 [CP014201]
3041525
3041616
+
Ser
GGA
-
¡û
>C171051615
CP016823
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRB [CP016823]
493307
493398
+
Ser
GGA
-
¡û
>C171108324
CP020464
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Pen [CP020464]
2278368
2278277
-
Ser
GGA
-
¡û
>C171118795
CP021426
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 4B15 [CP021426]
533393
533302
-
Ser
GGA
-
¡û
>WENV180136848
OATN01015610
[OATN] human gut metagenome; faeces
358
267
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180137710
OATP01000263
[OATP] human gut metagenome; faeces
34540
34449
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180172853
OAVY01000053
[OAVY] human gut metagenome; faeces
142
233
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180177653
OAWF01000333
[OAWF] human gut metagenome; faeces
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180181682
OAWN01000182
[OAWN] human gut metagenome; faeces
30703
30612
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180183998
OAWR01000163
[OAWR] human gut metagenome; faeces
19740
19649
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180409069
OBUT01016805
[OBUT] human gut metagenome; faeces
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180410269
OBUW01015519
[OBUW] human gut metagenome; faeces
142
233
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180420711
OBVO01040392
[OBVO] human gut metagenome; faeces
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180432699
OBWI01037552
[OBWI] human gut metagenome; faeces
118
27
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180439024
OBWS01004422
[OBWS] human gut metagenome; faeces
757
848
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180442440
OBWX01000011
[OBWX] human gut metagenome; faeces
236516
236425
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180444360
OBWZ01001782
[OBWZ] human gut metagenome; faeces
3036
2945
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180452744
OBXK01000239
[OBXK] human gut metagenome; faeces
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180475668
OBYV01005234
[OBYV] human gut metagenome; faeces
142
233
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180476540
OBYY01000029
[OBYY] human gut metagenome; faeces
43626
43535
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180481821
OBZF01002823
[OBZF] human gut metagenome; faeces
1186
1095
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV180483391
OBZH01000637
[OBZH] human gut metagenome; faeces
34540
34449
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>W141047289
AMQW01000018
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRHMDP2 [AMQW]
32539
32448
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W141202681
AZHJ01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR231 [AZHJ]
607
698
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>WENV182804502
OJUV01000107
[OJUV] human gut metagenome; human gut
142
233
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182808044
OJWB01000117
[OJWB] human gut metagenome; human gut
15508
15417
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182820033
OKAI01000110
[OKAI] human gut metagenome; human gut
142
233
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182831707
OKEG01000226
[OKEG] human gut metagenome; human gut
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182837789
OKGM01000089
[OKGM] human gut metagenome; human gut
15508
15417
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182855212
OKMY01000390
[OKMY] human gut metagenome; human gut
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182856712
OKNP01004122
[OKNP] human gut metagenome; human gut
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182858615
OKOF01000219
[OKOF] human gut metagenome; human gut
14307
14216
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182941236
OKVG01000850
[OKVG] human gut metagenome; human gut
214
305
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV182943763
OKVI01000775
[OKVI] human gut metagenome; human gut
164
255
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV183104591
OLNK01000734
[OLNK] human gut metagenome; faeces
33904
33813
-
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>WENV183121726
OLNV01002223
[OLNV] human gut metagenome; faeces
63
154
+
Ser
GGA
[ENA]
¢þ
>W141383423
JDFQ01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL5 [JDFQ]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W141383465
JDFR01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL6 [JDFR]
88
179
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W141400632
JDRW01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus E800 [JDRW]
303
394
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>C181005435
CP006804
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 14870 [CP006804]
2619810
2619901
+
Ser
GGA
-
¡û
>C181023015
CP017063
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR5 [CP017063]
784204
784295
+
Ser
GGA
-
¡û
>C181037358
CP019305
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus SCT-10-10-60 [CP019305]
838442
838533
+
Ser
GGA
-
¡û
>C181198798
CP031290
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [CP031290]
848314
848405
+
Ser
GGA
-
¡û
>C191019459
CP022109
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 11443 [CP022109]
838442
838533
+
Ser
GGA
-
¡û
>C191034452
CP025428
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B1 [CP025428]
848336
848427
+
Ser
GGA
-
¡û
>C191182658
CP040780
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 1.0320 [CP040780]
1292131
1292222
+
Ser
GGA
-
¡û
>C191206543
LR134322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13710 [LR134322]
837250
837341
+
Ser
GGA
-
¡û
>C191207097
LR134331
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13764 [LR134331]
838442
838533
+
Ser
GGA
-
¡û
>W09125988
ACIZ01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LMS2-1 [ACIZ]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W141739495
JNNV01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus K32 [JNNV]
70762
70671
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W141811539
JPZB01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JPZB]
190457
190366
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1910857300
NBVL01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus IBL027 [NBVL]
3215
3124
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911422898
NXEU01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus B1 [NXEU]
47985
48076
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911532130
OGTX02000202
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [OGTX]
58733
58642
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911587107
PJQS01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B2 [PJQS]
108
199
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911587138
PJQT01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-CVC [PJQT]
111295
111204
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911587178
PJQU01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-GG-MoProbi [PJQU]
200
291
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911587229
PJQV01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-S [PJQV]
110773
110682
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1911642765
PYRN01000020
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ARJD [PYRN]
165
256
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810084905
PESP01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GR-1 [PESP]
381115
381024
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810190499
PKJX01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus UMB0004 [PKJX]
973274
973183
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810195039
PKQF01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NRRL B-442 [PKQF]
525
616
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810452843
PZQM01000032
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR2 [PZQM]
27
118
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472489
QAGW01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS17_11 [QAGW]
1026035
1025944
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472541
QAGX01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS22_11 [QAGX]
135
226
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472649
QAGY01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS9_11 [QAGY]
10455
10364
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472681
QAGZ01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS15_11 [QAGZ]
40686
40595
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472737
QAHA01000020
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS14_11 [QAHA]
40686
40595
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810472792
QAHB01000018
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS12_11 [QAHB]
135
226
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810488334
QAZH01000017
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS18_11 [QAZH]
135
226
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810488367
QAZI01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS4_11 [QAZI]
111240
111149
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810488444
QAZJ01000018
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS3_11 [QAZJ]
135
226
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810488500
QAZK01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS13_11 [QAZK]
135
226
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810586851
QFFQ01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR863 [QFFQ]
525
616
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1810586906
QFFR01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus TMC3115 [QFFR]
525
616
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1510022483
CBZU010000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL15 [CBZU]
2994730
2994639
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>C10108862
FM179322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [FM179322]
848311
848402
+
Ser
GGA
-
¡û
>C10108918
AP011548
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG ATCC 53103 [AP011548]
845879
845970
+
Ser
GGA
-
¡û
>C10108976
FM179323
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lc 705 [FM179323]
842925
843016
+
Ser
GGA
[Ensembl]
¡û
>W1511397812
JTDC01000030
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 116 [JTDC]
35818
35727
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435023
JUIH01000057
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr108 [JUIH]
2572
2481
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435115
JUIJ01000235
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr053 [JUIJ]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435148
JUIK01000200
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr073 [JUIK]
5817
5726
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435185
JUIL01000068
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr071 [JUIL]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435248
JUIM01001276
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr044 [JUIM]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511435255
JUIN01000477
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr032 [JUIN]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511437335
JUKV01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 988_LRHA [JUKV]
42865
42774
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511437676
JULF01000201
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 979_LRHA [JULF]
1816
1725
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511438589
JUMO01000035
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 944_LRHA [JUMO]
1569
1478
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511438625
JUMP01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 943_LRHA [JUMP]
71
162
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511439932
JUON01000048
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 906_LRHA [JUON]
41970
41879
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511440295
JUPA01000052
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 893_LRHA [JUPA]
410
319
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511440955
JUPX01000074
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 870_LRHA [JUPX]
42862
42771
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511443519
JUTB01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 784_LRHA [JUTB]
410
319
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511444182
JUTS01000039
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 769_LRHA [JUTS]
42865
42774
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511445890
JUWG01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 708_LRHA [JUWG]
71
162
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511446161
JUWQ01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 699_LRHA [JUWQ]
62
153
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511451319
JVCX01000027
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 541_LRHA [JVCX]
250
341
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511451999
JVDP01000098
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 526_LRHA [JVDP]
170454
170363
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511458163
JVJA01000700
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 389_LRHA [JVJA]
7
98
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511460703
JVLT01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 319_LRHA [JVLT]
3448
3539
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511464244
JVPR01000126
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 214_LRHA [JVPR]
48
139
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511465393
JVQV01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 186_LRHA [JVQV]
37008
36917
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511478321
JWHC01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 308 [JWHC]
36743
36652
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511523867
JYCS01000023
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CLS17 [JYCS]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511586336
LAZE01000060
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CNCM-I-3698 [LAZE]
195
286
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511685011
LFNA01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 40f [LFNA]
19944
19853
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1511685046
LFNB01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 313 [LFNB]
111116
111025
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W11176916
AFYD01000114
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CASL [AFYD]
2890
2799
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>C121005633
CP003094
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 8530 [CP003094]
826255
826346
+
Ser
GGA
[Ensembl]
¡û
>C161075045
CP014645
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ASCC 290 [CP014645]
619171
619262
+
Ser
GGA
-
¡û
>C161108980
LT220504
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL5 [LT220504]
1432498
1432407
-
Ser
GGA
-
¡û
>W121007312
AFZY01000088
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 21052 [AFZY]
42
133
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W121011543
AGKC01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus R0011 [AGKC]
34423
34332
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610030471
AYTP01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
15359
15268
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610030499
AYTQ01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
17
108
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610030555
AYTR01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
17861
17770
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610033046
AZCQ01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
40645
40554
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>C131015424
CP005484
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK900 [CP005484]
776367
776458
+
Ser
GGA
[Ensembl]
¡û
>C131015482
CP005485
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK908 [CP005485]
837250
837341
+
Ser
GGA
[Ensembl]
¡û
>W1610543253
JTHQ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
111113
111022
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543303
JTHR01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
111114
111023
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543350
JTHS01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543425
JTHT01000062
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
15223
15132
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543464
JTHU01000057
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
2572
2481
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543545
JTHV01000187
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543558
JTHW01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
111115
111024
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543680
JTHY01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
392
483
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543745
JTHZ01000229
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
59751
59660
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543786
JTIA01000276
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
7671
7580
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543805
JTIB01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
47279
47188
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543894
JTIC01000051
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
11217
11126
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543899
JTID01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
88793
88702
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610543950
JTIE01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544007
JTIF01000160
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
32117
32026
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544099
JTIH01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
276
367
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544176
JTII01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
40566
40475
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544285
JTIK01000321
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
35304
35213
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544307
JTIL01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
88491
88400
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544356
JTIM01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
111116
111025
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544414
JTIN01000030
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544458
JTIO01000086
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
88
179
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544507
JTIP01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
40560
40469
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544540
JTIQ01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544586
JTIR01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
305
396
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544655
JTIS01000263
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
40570
40479
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544683
JTIT01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
395
486
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544780
JTIU01000046
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
35055
34964
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544799
JTIV01000071
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
1247
1156
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544833
JTIW01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
78196
78105
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610544914
JTIX01000140
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
41882
41791
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610547322
JUIP01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
392
483
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610547400
JUIQ01000416
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIQ]
3166
3075
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610547452
JUIS01000277
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1610980714
LWBT01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
211513
211422
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710027594
AYTP01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
15359
15268
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710027622
AYTQ01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
17
108
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710027678
AYTR01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
17861
17770
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710030318
AZCQ01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
40645
40554
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646384
JTHQ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
111113
111022
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646434
JTHR01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
111114
111023
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646481
JTHS01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646556
JTHT01000062
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
15223
15132
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646595
JTHU01000057
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
2572
2481
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646676
JTHV01000187
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646689
JTHW01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
111115
111024
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646811
JTHY01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
392
483
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646876
JTHZ01000229
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
59751
59660
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646917
JTIA01000276
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
7671
7580
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710646936
JTIB01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
47279
47188
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647025
JTIC01000051
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
11217
11126
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647030
JTID01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
88793
88702
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647081
JTIE01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647138
JTIF01000160
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
32117
32026
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647230
JTIH01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
276
367
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647307
JTII01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
40566
40475
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647416
JTIK01000321
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
35304
35213
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647438
JTIL01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
88491
88400
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647487
JTIM01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
111116
111025
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647545
JTIN01000030
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647589
JTIO01000086
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
88
179
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647638
JTIP01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
40560
40469
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647671
JTIQ01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647717
JTIR01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
305
396
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647786
JTIS01000263
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
40570
40479
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647814
JTIT01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
395
486
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647911
JTIU01000046
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
35055
34964
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647930
JTIV01000071
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
1247
1156
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710647964
JTIW01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
78196
78105
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710648045
JTIX01000140
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
41882
41791
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710650505
JUIP01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
392
483
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710650583
JUIQ01000416
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIQ]
3166
3075
-
Ser
GGA
[ENA]
¡û
>W1710650635
JUIS01000277
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
8
99
+
Ser
GGA
[ENA]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
BACK