This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes clustered and arranged according to each identical group
HIT:
1 Group(s).
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No.
Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Identical group No.456227 (270 seq.)
>W1710934755
LOJN01000061
Bacillota
Lacticaseibacillus casei [LOJN]
11947
12022
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710979157
LPNT01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNT]
52206
52281
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710979215
LPNU01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNU]
51703
51778
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710979262
LPNV01000038
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNV]
48550
48625
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710979328
LPNW01000065
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNW]
115669
115594
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711093165
LTET01000117
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC066G01 [LTET]
3682
3607
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711097164
LTIK01000086
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC078F07 [LTIK]
22629
22704
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711097405
LTIR01000028
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC077C11 [LTIR]
19024
18949
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711097839
LTJB01000050
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC064F12 [LTJB]
8085
8010
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711098179
LTJI01000160
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC068B07 [LTJI]
8085
8010
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711098508
LTJQ01000086
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC072E07 [LTJQ]
8714
8789
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711107575
LTSY01000033
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073D04 [LTSY]
22749
22824
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711109726
LTUW01000168
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC056D05 [LTUW]
1959
2034
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711109889
LTVA01000178
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC075D02 [LTVA]
8201
8126
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711110867
LTVY01000030
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073B09 [LTVY]
34624
34549
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711113098
LTXZ01000016
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC061B07 [LTXZ]
14942
15017
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711113389
LTYG01000128
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC068F07 [LTYG]
19668
19743
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711172126
LWBT01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
74304
74229
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711185634
LWNO01000061
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC17G08 [LWNO]
8698
8773
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711299238
MAGA01000067
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MAGA]
14034
14109
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711461617
MJHB01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MJHB]
51515
51590
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711517827
MLJZ01000018
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLJZ]
70387
70312
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711517881
MLKA01000023
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKA]
114448
114373
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711517933
MLKB01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKB]
114457
114382
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711517988
MLKC01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKC]
74599
74524
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711708081
MSTB01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTB]
61894
61819
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711708130
MSTC01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTC]
114133
114058
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711721960
MTJY01000051
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MTJY]
79578
79503
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1711798480
MWVF01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MWVF]
72108
72183
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C171030558
CP014201
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BFE5264 [CP014201]
1902879
1902804
-
Thr
GGT
-
¡û
>C171051626
CP016823
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRB [CP016823]
2327566
2327491
-
Thr
GGT
-
¡û
>C171056180
CP017065
Bacillota
Lacticaseibacillus casei LC5 [CP017065]
2712208
2712133
-
Thr
GGT
-
¡û
>C171108277
CP020464
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Pen [CP020464]
465619
465694
+
Thr
GGT
-
¡û
>C171118747
CP021426
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 4B15 [CP021426]
1703905
1703980
+
Thr
GGT
-
¡û
>W131044801
AMQX01000029
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRHMDP3 [AMQX]
935
860
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W131204271
ATBI01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CRL1505 [ATBI]
116049
115974
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>WENV180133106
OATI01005057
[OATI] human gut metagenome; faeces
163
91
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180136810
OATN01005716
[OATN] human gut metagenome; faeces
389
461
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180137518
OATP01000006
[OATP] human gut metagenome; faeces
140462
140534
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180172768
OAVY01000013
[OAVY] human gut metagenome; faeces
105865
105937
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180177765
OAWF01000618
[OAWF] human gut metagenome; faeces
8514
8442
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180181778
OAWN01000932
[OAWN] human gut metagenome; faeces
583
655
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180184036
OAWR01000296
[OAWR] human gut metagenome; faeces
9177
9105
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180408645
OBUT01000006
[OBUT] human gut metagenome; faeces
114317
114245
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180409815
OBUW01000001
[OBUW] human gut metagenome; faeces
607795
607867
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180419998
OBVO01000222
[OBVO] human gut metagenome; faeces
17793
17721
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180427986
OBWB01001800
[OBWB] human gut metagenome; faeces
3459
3387
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180431739
OBWH01004016
[OBWH] human gut metagenome; faeces
704
776
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180432037
OBWI01000158
[OBWI] human gut metagenome; faeces
57342
57414
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180439003
OBWS01003987
[OBWS] human gut metagenome; faeces
482
554
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180440598
OBWV01000864
[OBWV] human gut metagenome; faeces
18749
18821
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180442457
OBWX01000018
[OBWX] human gut metagenome; faeces
105866
105938
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180444287
OBWZ01000518
[OBWZ] human gut metagenome; faeces
2471
2543
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180448240
OBXE01002133
[OBXE] human gut metagenome; faeces
1703
1631
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180452810
OBXK01000406
[OBXK] human gut metagenome; faeces
8407
8335
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180475589
OBYV01000449
[OBYV] human gut metagenome; faeces
1024
952
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180476632
OBYY01001669
[OBYY] human gut metagenome; faeces
1756
1828
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180478424
OBZB01003092
[OBZB] human gut metagenome; faeces
744
816
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180481914
OBZF01014541
[OBZF] human gut metagenome; faeces
22
94
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV180482979
OBZH01000019
[OBZH] human gut metagenome; faeces
45796
45724
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>W141047296
AMQW01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRHMDP2 [AMQW]
13546
13621
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141096332
AVFG02000078
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 2166 [AVFG]
49923
49848
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141202705
AZHJ01000154
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR231 [AZHJ]
8299
8224
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141228158
BALS01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus casei JCM 1134 [BALS]
61379
61304
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141228205
BALT01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus JCM 1136 [BALT]
72091
72166
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>WENV182804447
OJUV01000017
[OJUV] human gut metagenome; human gut
114324
114252
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182807985
OJWB01000003
[OJWB] human gut metagenome; human gut
114427
114355
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182808303
OJWE01000705
[OJWE] human gut metagenome; human gut
411
483
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182819953
OKAI01000012
[OKAI] human gut metagenome; human gut
117830
117758
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182830544
OKDZ01000167
[OKDZ] human gut metagenome; human gut
8432
8360
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182831593
OKEG01000014
[OKEG] human gut metagenome; human gut
105865
105937
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182837761
OKGM01000036
[OKGM] human gut metagenome; human gut
51849
51921
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182838290
OKGQ01002149
[OKGQ] human gut metagenome; human gut
768
840
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182855087
OKMY01000001
[OKMY] human gut metagenome; human gut
46583
46511
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182856683
OKNP01001728
[OKNP] human gut metagenome; human gut
709
637
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182858581
OKOF01000087
[OKOF] human gut metagenome; human gut
5209
5137
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182942119
OKVG01032325
[OKVG] human gut metagenome; human gut
59
131
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV182944337
OKVI01017948
[OKVI] human gut metagenome; human gut
801
729
-
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>WENV183105036
OLNK01006411
[OLNK] human gut metagenome; faeces
385
457
+
Thr
GGT
[ENA]
¢þ
>W141383436
JDFQ01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL5 [JDFQ]
14960
15035
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141383461
JDFR01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL6 [JDFR]
114953
114878
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141400641
JDRW01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus E800 [JDRW]
18622
18697
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C181005445
CP006804
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 14870 [CP006804]
1431211
1431139
-
Thr
GGT
-
¡û
>C181023025
CP017063
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR5 [CP017063]
2644210
2644138
-
Thr
GGT
-
¡û
>C181037369
CP019305
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus SCT-10-10-60 [CP019305]
2681977
2681905
-
Thr
GGT
-
¡û
>W09110952
ABWJ01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus HN001 [ABWJ]
18625
18700
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C181198809
CP031290
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [CP031290]
2685450
2685378
-
Thr
GGT
-
¡û
>C181218067
LS991421
Bacillota
Lacticaseibacillus zeae [LS991421]
2585204
2585132
-
Thr
GGT
-
¡û
>W09125987
ACIZ01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LMS2-1 [ACIZ]
8564
8639
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C191019470
CP022109
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 11443 [CP022109]
2681988
2681916
-
Thr
GGT
-
¡û
>C191034463
CP025428
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B1 [CP025428]
2682867
2682795
-
Thr
GGT
-
¡û
>C191182679
CP040780
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 1.0320 [CP040780]
173860
173788
-
Thr
GGT
-
¡û
>C191206554
LR134322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13710 [LR134322]
2682814
2682742
-
Thr
GGT
-
¡û
>C191207108
LR134331
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13764 [LR134331]
2680153
2680081
-
Thr
GGT
-
¡û
>W141713197
JMSI01000003
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 51B [JMSI]
290883
290958
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141739474
JNNV01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus K32 [JNNV]
126687
126762
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W141811544
JPZB01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JPZB]
18634
18709
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1910500682
FXZN01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus zeae casei [FXZN]
66324
66252
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1910797102
MSSM01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus chiayiensis NCYUAS [MSSM]
74160
74088
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1910857345
NBVL01000054
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus IBL027 [NBVL]
34805
34733
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1910857352
NBVL01000121
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus IBL027 [NBVL]
2149
2221
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911138901
NOXN01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus chiayiensis NRIC 1947 [NOXN]
27690
27762
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911422889
NXEU01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus B1 [NXEU]
334161
334089
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911422952
NXEV01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P5 [NXEV]
18920
18992
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911423007
NXEW01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P4 [NXEW]
19621
19693
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911423060
NXEX01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P3 [NXEX]
19816
19888
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911423177
NXEZ01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P1 [NXEZ]
20849
20921
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911532124
OGTX02000098
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [OGTX]
12817
12745
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911587114
PJQS01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B2 [PJQS]
52005
52077
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911587133
PJQT01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-CVC [PJQT]
51465
51537
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911587181
PJQU01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-GG-MoProbi [PJQU]
51630
51702
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911587255
PJQV01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-S [PJQV]
51023
51095
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911642762
PYRN01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ARJD [PYRN]
29419
29491
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1911718204
QQWF01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NRRL B-442 [QQWF]
72234
72306
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810084911
PESP01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GR-1 [PESP]
197236
197308
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810190512
PKJX01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus UMB0004 [PKJX]
114587
114515
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810195031
PKQF01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NRRL B-442 [PKQF]
72234
72306
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810452796
PZQM01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR2 [PZQM]
224402
224474
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472500
QAGW01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS17_11 [QAGW]
114399
114327
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472557
QAGX01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS22_11 [QAGX]
114399
114327
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472620
QAGY01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS9_11 [QAGY]
29469
29541
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472666
QAGZ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS15_11 [QAGZ]
114390
114318
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472722
QAHA01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS14_11 [QAHA]
72234
72306
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810472788
QAHB01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS12_11 [QAHB]
29469
29541
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488084
QAZD01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus casei DS1_13 [QAZD]
6825
6897
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488137
QAZE01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus casei DS13_13 [QAZE]
6775
6847
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488330
QAZH01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS18_11 [QAZH]
70421
70349
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488364
QAZI01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS4_11 [QAZI]
115080
115008
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488440
QAZJ01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS3_11 [QAZJ]
70421
70349
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810488485
QAZK01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS13_11 [QAZK]
72234
72306
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810586858
QFFQ01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR863 [QFFQ]
47994
48066
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1810586913
QFFR01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus TMC3115 [QFFR]
47994
48066
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C151000869
AP012544
Bacillota
Lacticaseibacillus casei DSM 20011 = JCM 1134 = ATCC 393 [AP012544]
2581144
2581069
-
Thr
GGT
[Ensembl]
¡û
>W1510022471
CBZU010000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL15 [CBZU]
1121017
1121092
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C10108873
FM179322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [FM179322]
2685445
2685370
-
Thr
GGT
-
¡û
>C10108929
AP011548
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG ATCC 53103 [AP011548]
2680415
2680340
-
Thr
GGT
-
¡û
>C10108987
FM179323
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lc 705 [FM179323]
2664331
2664256
-
Thr
GGT
[Ensembl]
¡û
>W1511397814
JTDC01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 116 [JTDC]
18271
18346
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435021
JUIH01000043
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr108 [JUIH]
940
865
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435075
JUII01000225
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr138 [JUII]
3681
3606
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435110
JUIJ01000161
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr053 [JUIJ]
763
688
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435150
JUIK01000260
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr073 [JUIK]
3821
3896
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435208
JUIL01000437
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr071 [JUIL]
5276
5201
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435214
JUIM01000354
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr044 [JUIM]
3693
3618
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435277
JUIN01000683
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr032 [JUIN]
635
560
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511435285
JUIO01000110
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr140 [JUIO]
3563
3488
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511437336
JUKV01000039
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 988_LRHA [JUKV]
19441
19516
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511437673
JULF01000173
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 979_LRHA [JULF]
2020
2095
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511438595
JUMO01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 944_LRHA [JUMO]
16780
16705
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511438629
JUMP01000063
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 943_LRHA [JUMP]
19441
19516
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511439955
JUON01000119
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 906_LRHA [JUON]
8437
8362
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511440322
JUPA01000189
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 893_LRHA [JUPA]
8114
8039
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511440947
JUPX01000050
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 870_LRHA [JUPX]
8437
8362
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511441022
JUPZ01000102
Bacillota
Lacticaseibacillus casei 867_LCAS [JUPZ]
8648
8723
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511443525
JUTB01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 784_LRHA [JUTB]
18418
18493
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511444183
JUTS01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 769_LRHA [JUTS]
19441
19516
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511445907
JUWG01000092
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 708_LRHA [JUWG]
8235
8160
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511446172
JUWQ01000058
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 699_LRHA [JUWQ]
8226
8151
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511451348
JVCX01000073
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 541_LRHA [JVCX]
25777
25852
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511451995
JVDP01000093
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 526_LRHA [JVDP]
77806
77731
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511458139
JVIZ01000205
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 390_LRHA [JVIZ]
3471
3396
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511460699
JVLT01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 319_LRHA [JVLT]
106189
106264
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511464259
JVPR01000245
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 214_LRHA [JVPR]
18662
18737
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511465395
JVQV01000044
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 186_LRHA [JVQV]
29444
29519
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511478311
JWHC01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 308 [JWHC]
69512
69437
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511499020
JWZV01000016
Bacillota
Lactobacillus sp. FMNP02 [JWZV]
7099
7174
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511523863
JYCS01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CLS17 [JYCS]
29341
29416
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511586342
LAZE01000069
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CNCM-I-3698 [LAZE]
161662
161587
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511621147
LCUN01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus casei N87 [LCUN]
678571
678646
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W11152575
AEYM01001020
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus MTCC 5462 [AEYM]
874
799
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511684991
LFNA01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 40f [LFNA]
74306
74231
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1511685041
LFNB01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 313 [LFNB]
114953
114878
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W11176947
AFYD01000371
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CASL [AFYD]
8528
8603
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W11184941
BACQ01000036
Bacillota
Lacticaseibacillus zeae KCTC 3804 [BACQ]
95552
95627
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C121005644
CP003094
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 8530 [CP003094]
2656235
2656160
-
Thr
GGT
[Ensembl]
¡û
>C161075056
CP014645
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ASCC 290 [CP014645]
2398600
2398525
-
Thr
GGT
-
¡û
>C161108942
LT220504
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL5 [LT220504]
2569236
2569311
+
Thr
GGT
-
¡û
>W1610030498
AYTP01000038
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
23376
23451
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610030521
AYTQ01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
43288
43213
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610030586
AYTR01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
38954
38879
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610032436
AYZQ01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus brantae DSM 23927 [AYZQ]
106482
106410
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610033030
AZCQ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
72193
72268
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610033198
AZCT01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus zeae DSM 20178 = KCTC 3804 [AZCT]
72806
72731
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W121007318
AFZY01000117
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 21052 [AFZY]
44569
44494
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W121011531
AGKC01000002
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus R0011 [AGKC]
114047
113972
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>C131015435
CP005484
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK900 [CP005484]
2587537
2587462
-
Thr
GGT
[Ensembl]
¡û
>C131015493
CP005485
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK908 [CP005485]
2682667
2682592
-
Thr
GGT
[Ensembl]
¡û
>W1610543295
JTHQ01000059
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
3017
3092
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543310
JTHR01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
14956
15031
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543373
JTHS01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
14961
15036
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543417
JTHT01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
5988
5913
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543462
JTHU01000043
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
940
865
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543538
JTHV01000105
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
5989
5914
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543555
JTHW01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
14965
15040
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543621
JTHX01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHX]
71752
71677
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543675
JTHY01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
14877
14952
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543759
JTHZ01000289
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
18814
18889
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543761
JTIA01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
3587
3512
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543798
JTIB01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
18625
18700
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543861
JTIC01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
18174
18249
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543907
JTID01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
22184
22109
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610543946
JTIE01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
35825
35750
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544008
JTIF01000193
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
14878
14953
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544051
JTIG01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIG]
14877
14952
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544106
JTIH01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
14751
14826
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544172
JTII01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
49920
49845
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544216
JTIJ01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIJ]
114388
114313
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544274
JTIK01000200
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
19001
18926
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544322
JTIL01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
930
855
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544359
JTIM01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
51443
51518
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544400
JTIN01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
83992
83917
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544454
JTIO01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
14982
15057
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544501
JTIP01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
49679
49604
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544559
JTIQ01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
14963
15038
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544606
JTIR01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
18625
18700
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544671
JTIS01000325
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
27399
27324
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544694
JTIT01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
114711
114636
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544768
JTIU01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
70294
70219
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544801
JTIV01000202
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
2783
2858
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544846
JTIW01000050
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
18338
18413
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610544880
JTIX01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
955
880
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610547336
JUIP01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
14878
14953
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610547409
JUIQ01000423
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIQ]
5742
5817
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610547427
JUIR01000203
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIR]
3711
3636
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610547471
JUIS01000926
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
3789
3864
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1610980731
LWBT01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
74304
74229
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710027621
AYTP01000038
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
23376
23451
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710027644
AYTQ01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
43288
43213
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710027709
AYTR01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
38954
38879
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710029258
AYZQ01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus brantae DSM 23927 [AYZQ]
106482
106410
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710030302
AZCQ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
72193
72268
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710030470
AZCT01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus zeae DSM 20178 = KCTC 3804 [AZCT]
72806
72731
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646426
JTHQ01000059
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
3017
3092
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646441
JTHR01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
14956
15031
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646504
JTHS01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
14961
15036
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646548
JTHT01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
5988
5913
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646593
JTHU01000043
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
940
865
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646669
JTHV01000105
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
5989
5914
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646686
JTHW01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
14965
15040
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646752
JTHX01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHX]
71752
71677
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646806
JTHY01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
14877
14952
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646890
JTHZ01000289
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
18814
18889
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646892
JTIA01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
3587
3512
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646929
JTIB01000006
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
18625
18700
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710646992
JTIC01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
18174
18249
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647038
JTID01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
22184
22109
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647077
JTIE01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
35825
35750
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647139
JTIF01000193
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
14878
14953
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647182
JTIG01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIG]
14877
14952
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647237
JTIH01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
14751
14826
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647303
JTII01000015
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
49920
49845
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647347
JTIJ01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIJ]
114388
114313
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647405
JTIK01000200
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
19001
18926
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647453
JTIL01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
930
855
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647490
JTIM01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
51443
51518
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647531
JTIN01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
83992
83917
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647585
JTIO01000014
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
14982
15057
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647632
JTIP01000007
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
49679
49604
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647690
JTIQ01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
14963
15038
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647737
JTIR01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
18625
18700
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647802
JTIS01000325
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
27399
27324
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647825
JTIT01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
114711
114636
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647899
JTIU01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
70294
70219
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647932
JTIV01000202
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
2783
2858
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710647977
JTIW01000050
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
18338
18413
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710648011
JTIX01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
955
880
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710650519
JUIP01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
14878
14953
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710650592
JUIQ01000423
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIQ]
5742
5817
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710650610
JUIR01000203
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIR]
3711
3636
-
Thr
GGT
[ENA]
¡û
>W1710650654
JUIS01000926
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
3789
3864
+
Thr
GGT
[ENA]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
BACK