This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes clustered and arranged according to each identical group
HIT:
1 Group(s).
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No.
Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Identical group No.5787 (227 seq.)
>W1710979132
LPNT01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNT]
14304
14213
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710979193
LPNU01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNU]
1526
1617
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710979247
LPNV01000029
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNV]
2371
2462
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710979307
LPNW01000055
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LPNW]
1732
1823
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711093185
LTET01000170
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC066G01 [LTET]
13517
13426
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711097148
LTIK01000009
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC078F07 [LTIK]
411
320
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711097423
LTIR01000058
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC077C11 [LTIR]
43
134
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711097875
LTJB01000120
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC064F12 [LTJB]
132
41
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711098157
LTJI01000102
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC068B07 [LTJI]
1311
1402
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711098530
LTJQ01000119
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC072E07 [LTJQ]
1311
1402
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711107612
LTSY01000125
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073D04 [LTSY]
411
320
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711109707
LTUW01000092
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC056D05 [LTUW]
1466
1557
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711109865
LTVA01000005
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC075D02 [LTVA]
411
320
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711110897
LTVY01000113
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC073B09 [LTVY]
132
41
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711113086
LTXZ01000003
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC061B07 [LTXZ]
13502
13411
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711172148
LWBT01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
13471
13380
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711185663
LWNO01000120
Bacillota
Lactobacillus sp. HMSC17G08 [LWNO]
1311
1402
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711299208
MAGA01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MAGA]
1519
1610
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711461651
MJHB01000058
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MJHB]
13497
13406
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711517794
MLJZ01000004
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLJZ]
1742
1833
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711517845
MLKA01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKA]
1532
1623
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711517897
MLKB01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKB]
1554
1645
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711517952
MLKC01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MLKC]
1737
1828
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711708091
MSTB01000017
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTB]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711708153
MSTC01000062
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MSTC]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1711798507
MWVF01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [MWVF]
1656
1747
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C171030543
CP014201
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BFE5264 [CP014201]
3022836
3022927
+
Ser
TGA
-
¡û
>C171051604
CP016823
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRB [CP016823]
474621
474712
+
Ser
TGA
-
¡û
>C171108313
CP020464
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Pen [CP020464]
2297166
2297075
-
Ser
TGA
-
¡û
>C171118784
CP021426
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 4B15 [CP021426]
552089
551998
-
Ser
TGA
-
¡û
>W131044791
AMQX01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LRHMDP3 [AMQX]
13477
13386
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W131204290
ATBI01000022
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CRL1505 [ATBI]
4586
4677
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>WENV180133168
OATI01009927
[OATI] human gut metagenome; faeces
653
562
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180136842
OATN01014433
[OATN] human gut metagenome; faeces
83
174
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180137852
OATP01000869
[OATP] human gut metagenome; faeces
1487
1578
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180172957
OAVY01000177
[OAVY] human gut metagenome; faeces
13581
13490
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180177927
OAWF01003337
[OAWF] human gut metagenome; faeces
1488
1579
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180181814
OAWN01003207
[OAWN] human gut metagenome; faeces
466
557
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180184127
OAWR01001317
[OAWR] human gut metagenome; faeces
1994
2085
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180408913
OBUT01000273
[OBUT] human gut metagenome; faeces
2653
2744
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180410273
OBUW01017522
[OBUW] human gut metagenome; faeces
153
62
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180420191
OBVO01000908
[OBVO] human gut metagenome; faeces
1488
1579
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180428090
OBWB01008431
[OBWB] human gut metagenome; faeces
439
348
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180432302
OBWI01000812
[OBWI] human gut metagenome; faeces
1519
1610
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180439129
OBWS01007949
[OBWS] human gut metagenome; faeces
1487
1578
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180442559
OBWX01000193
[OBWX] human gut metagenome; faeces
14233
14142
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180444246
OBWZ01000373
[OBWZ] human gut metagenome; faeces
1488
1579
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180448327
OBXE01010498
[OBXE] human gut metagenome; faeces
175
84
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180452828
OBXK01000426
[OBXK] human gut metagenome; faeces
2323
2414
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180475653
OBYV01003905
[OBYV] human gut metagenome; faeces
424
333
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180476772
OBYY01029822
[OBYY] human gut metagenome; faeces
64
155
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180478463
OBZB01013601
[OBZB] human gut metagenome; faeces
173
82
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180484086
OBZH01015934
[OBZH] human gut metagenome; faeces
153
62
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180494033
OBZZ01003277
[OBZZ] human gut metagenome; faeces
511
602
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>W141202670
AZHJ01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR231 [AZHJ]
1815
1906
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W141228229
BALT01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus JCM 1136 [BALT]
1281
1372
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>WENV182804577
OJUV01002811
[OJUV] human gut metagenome; human gut
65
156
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182820065
OKAI01002653
[OKAI] human gut metagenome; human gut
65
156
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182838299
OKGQ01003100
[OKGQ] human gut metagenome; human gut
511
602
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182856725
OKNP01006833
[OKNP] human gut metagenome; human gut
153
62
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182941279
OKVG01000947
[OKVG] human gut metagenome; human gut
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182943803
OKVI01000870
[OKVI] human gut metagenome; human gut
13558
13467
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>W141383449
JDFQ01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL5 [JDFQ]
1279
1370
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W141383497
JDFR01000039
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus PEL6 [JDFR]
13656
13565
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W141400670
JDRW01000043
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus E800 [JDRW]
1447
1538
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C181005424
CP006804
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 14870 [CP006804]
2601112
2601203
+
Ser
TGA
-
¡û
>C181023004
CP017063
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR5 [CP017063]
765432
765523
+
Ser
TGA
-
¡û
>C181037347
CP019305
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus SCT-10-10-60 [CP019305]
819676
819767
+
Ser
TGA
-
¡û
>C181198787
CP031290
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [CP031290]
829618
829709
+
Ser
TGA
-
¡û
>C191019448
CP022109
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 11443 [CP022109]
819676
819767
+
Ser
TGA
-
¡û
>C191034441
CP025428
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B1 [CP025428]
829640
829731
+
Ser
TGA
-
¡û
>W09110983
ABWJ01000048
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus HN001 [ABWJ]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C191182647
CP040780
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 1.0320 [CP040780]
1273359
1273450
+
Ser
TGA
-
¡û
>C191206532
LR134322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13710 [LR134322]
818484
818575
+
Ser
TGA
-
¡û
>C191207086
LR134331
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NCTC13764 [LR134331]
819676
819767
+
Ser
TGA
-
¡û
>W09125976
ACIZ01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LMS2-1 [ACIZ]
13471
13380
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W141713230
JMSI01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 51B [JMSI]
13470
13379
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W141811575
JPZB01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JPZB]
1598
1689
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1910857325
NBVL01000034
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus IBL027 [NBVL]
812
903
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911422916
NXEU01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus B1 [NXEU]
13939
13848
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911422969
NXEV01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P5 [NXEV]
14070
13979
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911423024
NXEW01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P4 [NXEW]
14070
13979
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911423079
NXEX01000036
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P3 [NXEX]
14070
13979
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911423194
NXEZ01000038
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus P1 [NXEZ]
14070
13979
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911587096
PJQS01000005
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-B2 [PJQS]
1380
1471
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911587166
PJQT01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-CVC [PJQT]
13677
13586
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911587213
PJQU01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-GG-MoProbi [PJQU]
13677
13586
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911587245
PJQV01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR-S [PJQV]
13677
13586
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911642773
PYRN01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ARJD [PYRN]
616
707
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1911718233
QQWF01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NRRL B-442 [QQWF]
13650
13559
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810084936
PESP01000012
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GR-1 [PESP]
13622
13531
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810190535
PKJX01000013
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus UMB0004 [PKJX]
1361
1452
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810195055
PKQF01000027
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus NRRL B-442 [PKQF]
13650
13559
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810452833
PZQM01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR2 [PZQM]
1296
1387
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472527
QAGW01000010
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS17_11 [QAGW]
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472584
QAGX01000011
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS22_11 [QAGX]
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472638
QAGY01000023
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS9_11 [QAGY]
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472696
QAGZ01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS15_11 [QAGZ]
13597
13506
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472752
QAHA01000024
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS14_11 [QAHA]
13597
13506
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810472807
QAHB01000021
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS12_11 [QAHB]
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810488349
QAZH01000023
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS18_11 [QAZH]
1404
1495
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810488404
QAZI01000035
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS4_11 [QAZI]
13608
13517
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810488459
QAZJ01000023
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS3_11 [QAZJ]
13715
13624
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810488515
QAZK01000025
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DS13_11 [QAZK]
13597
13506
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810586887
QFFQ01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LR863 [QFFQ]
1770
1861
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1810586942
QFFR01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus TMC3115 [QFFR]
1758
1849
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1510022506
CBZU010000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL15 [CBZU]
13470
13379
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C10108851
FM179322
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG [FM179322]
829615
829706
+
Ser
TGA
-
¡û
>C10108907
AP011548
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus GG ATCC 53103 [AP011548]
827183
827274
+
Ser
TGA
-
¡û
>C10108965
FM179323
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lc 705 [FM179323]
824159
824250
+
Ser
TGA
[Ensembl]
¡û
>W1511397834
JTDC01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 116 [JTDC]
1658
1749
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435046
JUIH01000117
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr108 [JUIH]
302
211
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435099
JUII01000514
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr138 [JUII]
457
548
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435131
JUIJ01000300
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr053 [JUIJ]
1130
1221
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435168
JUIK01000533
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr073 [JUIK]
6822
6731
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435233
JUIM01000908
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr044 [JUIM]
849
758
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511435302
JUIO01001222
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus Lr140 [JUIO]
322
413
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511437330
JUKV01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 988_LRHA [JUKV]
72
163
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511437653
JULF01000071
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 979_LRHA [JULF]
161
70
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511438605
JUMO01000082
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 944_LRHA [JUMO]
73
164
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511438627
JUMP01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 943_LRHA [JUMP]
161
70
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511439938
JUON01000062
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 906_LRHA [JUON]
158
67
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511440313
JUPA01000127
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 893_LRHA [JUPA]
73
164
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511440957
JUPX01000092
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 870_LRHA [JUPX]
158
67
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511443535
JUTB01000086
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 784_LRHA [JUTB]
73
164
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511444181
JUTS01000034
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 769_LRHA [JUTS]
161
70
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511445886
JUWG01000001
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 708_LRHA [JUWG]
72
163
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511446189
JUWQ01000190
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 699_LRHA [JUWQ]
63
154
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511451306
JVCX01000008
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 541_LRHA [JVCX]
152
61
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511451978
JVDP01000074
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 526_LRHA [JVDP]
258
167
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511458158
JVJA01000351
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 389_LRHA [JVJA]
67
158
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511460732
JVLT01000027
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 319_LRHA [JVLT]
13536
13445
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511465379
JVQV01000030
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 186_LRHA [JVQV]
519
610
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511478339
JWHC01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 308 [JWHC]
1652
1743
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511523886
JYCS01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CLS17 [JYCS]
13641
13550
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511586326
LAZE01000055
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CNCM-I-3698 [LAZE]
13491
13400
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511685027
LFNA01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 40f [LFNA]
941
850
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1511685082
LFNB01000038
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus 313 [LFNB]
1433
1524
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W11176952
AFYD01000385
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus CASL [AFYD]
302
211
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C121005622
CP003094
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 8530 [CP003094]
807489
807580
+
Ser
TGA
[Ensembl]
¡û
>C161075034
CP014645
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ASCC 290 [CP014645]
598184
598275
+
Ser
TGA
-
¡û
>C161108969
LT220504
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus BPL5 [LT220504]
1451264
1451173
-
Ser
TGA
-
¡û
>W1610030485
AYTP01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
13648
13557
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610030537
AYTQ01000066
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610030569
AYTR01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
13598
13507
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610033068
AZCQ01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
542
633
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W121007330
AFZY01000122
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 21052 [AFZY]
132
41
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W121011559
AGKC01000009
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus R0011 [AGKC]
3111
3202
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>C131015413
CP005484
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK900 [CP005484]
757565
757656
+
Ser
TGA
[Ensembl]
¡û
>C131015471
CP005485
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus LOCK908 [CP005485]
818484
818575
+
Ser
TGA
[Ensembl]
¡û
>W1610543285
JTHQ01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543335
JTHR01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543389
JTHS01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
13541
13450
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543441
JTHT01000065
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
1448
1539
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543487
JTHU01000117
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
302
211
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543528
JTHV01000103
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
1602
1693
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543594
JTHW01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
13661
13570
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543649
JTHX01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHX]
13519
13428
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543704
JTHY01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
13472
13381
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543756
JTHZ01000249
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543781
JTIA01000200
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543835
JTIB01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
13663
13572
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543882
JTIC01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543938
JTID01000091
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
457
548
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610543973
JTIE01000058
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
1281
1372
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544025
JTIF01000220
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
7156
7065
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544083
JTIG01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIG]
13523
13432
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544134
JTIH01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544196
JTII01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
1601
1692
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544246
JTIJ01000034
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIJ]
1650
1741
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544293
JTIK01000345
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544337
JTIL01000052
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
13477
13386
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544388
JTIM01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544433
JTIN01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
922
1013
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544473
JTIO01000092
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
905
996
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544520
JTIP01000066
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
445
536
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544573
JTIQ01000044
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
13480
13389
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544628
JTIR01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
1598
1689
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544672
JTIS01000335
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
13519
13428
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544726
JTIT01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
1653
1744
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544758
JTIU01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544821
JTIV01000465
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544863
JTIW01000057
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
1475
1566
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610544901
JTIX01000137
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
46181
46090
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610547353
JUIP01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
13469
13378
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610547476
JUIS01000930
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
258
167
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1610980753
LWBT01000040
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [LWBT]
13471
13380
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710027608
AYTP01000026
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L35 [AYTP]
13648
13557
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710027660
AYTQ01000066
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L31 [AYTQ]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710027692
AYTR01000016
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus L34 [AYTR]
13598
13507
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710030340
AZCQ01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus DSM 20021 = JCM 1136 = NBRC 3425 [AZCQ]
542
633
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646416
JTHQ01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHQ]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646466
JTHR01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHR]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646520
JTHS01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHS]
13541
13450
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646572
JTHT01000065
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHT]
1448
1539
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646618
JTHU01000117
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHU]
302
211
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646659
JTHV01000103
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHV]
1602
1693
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646725
JTHW01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHW]
13661
13570
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646780
JTHX01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHX]
13519
13428
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646835
JTHY01000045
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHY]
13472
13381
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646887
JTHZ01000249
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTHZ]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646912
JTIA01000200
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIA]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710646966
JTIB01000049
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIB]
13663
13572
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647013
JTIC01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIC]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647069
JTID01000091
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTID]
457
548
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647104
JTIE01000058
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIE]
1281
1372
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647156
JTIF01000220
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIF]
7156
7065
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647214
JTIG01000037
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIG]
13523
13432
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647265
JTIH01000033
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIH]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647327
JTII01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTII]
1601
1692
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647377
JTIJ01000034
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIJ]
1650
1741
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647424
JTIK01000345
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIK]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647468
JTIL01000052
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIL]
13477
13386
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647519
JTIM01000042
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIM]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647564
JTIN01000056
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIN]
922
1013
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647604
JTIO01000092
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIO]
905
996
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647651
JTIP01000066
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIP]
445
536
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647704
JTIQ01000044
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIQ]
13480
13389
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647759
JTIR01000047
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIR]
1598
1689
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647803
JTIS01000335
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIS]
13519
13428
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647857
JTIT01000028
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIT]
1653
1744
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647889
JTIU01000031
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIU]
1277
1368
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647952
JTIV01000465
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIV]
454
545
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710647994
JTIW01000057
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIW]
1475
1566
+
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710648032
JTIX01000137
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JTIX]
46181
46090
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710650536
JUIP01000041
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIP]
13469
13378
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>W1710650659
JUIS01000930
Bacillota
Lacticaseibacillus rhamnosus [JUIS]
258
167
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
BACK