This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
50 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180259497
OBEQ011108229
339292
Alphaproteobacteria
TTG
Gln
>WENV180271489
OBEQ012282011
146578
Alphaproteobacteria
CGG
Pro
>WENV180264371
OBEQ011565133
95686
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV180252401
OBEQ010447050
99726
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV180248142
OBEQ010087685
339303
Alphaproteobacteria
TGT
Thr
>WENV180252788
OBEQ010478187
248021
Alphaproteobacteria
CTT
Lys
>WENV180253996
OBEQ010592563
59361
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV180271066
OBEQ012232803
241021
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180259782
OBEQ011138672
241021
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180251277
OBEQ010354866
241021
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180247186
OBEQ010003852
241021
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180265565
OBEQ011670450
338524
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV180265161
OBEQ011636185
338524
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV180258837
OBEQ011047403
338524
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV180267478
OBEQ011859175
199776
Alphaproteobacteria
CGG
Pro
>WENV180256003
OBEQ010774822
199776
Alphaproteobacteria
CGG
Pro
>WENV180272596
OBEQ012395300
203135
Alphaproteobacteria
TCT
Arg
>WENV180254277
OBEQ010617285
435239
Alphaproteobacteria
CTG
Gln
>WENV180248808
OBEQ010142956
96897
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV180255822
OBEQ010760088
340956
Alphaproteobacteria
TTG
Gln
>WENV180256771
OBEQ010851011
77433
Alphaproteobacteria
CAG
Leu
>WENV180255281
OBEQ010710570
247224
Alphaproteobacteria
CGT
Thr
>WENV180269234
OBEQ012042931
338496
Alphaproteobacteria
CAT
Met
>WENV180269918
OBEQ012114735
430732
Alphaproteobacteria
CCC
Gly
>WENV180265535
OBEQ011667379
148300
Alphaproteobacteria
CCA
Trp
>WENV180257044
OBEQ010875247
148300
Alphaproteobacteria
CCA
Trp
>WENV180266068
OBEQ011717729
163397
Alphaproteobacteria
TGG
Pro
>WENV180268087
OBEQ011928811
148429
Alphaproteobacteria
CCT
Arg
>WENV180250676
OBEQ010303928
148429
Alphaproteobacteria
CCT
Arg
>WENV180269814
OBEQ012101592
131431
Alphaproteobacteria
GGG
Pro
>WENV180256776
OBEQ010851992
131431
Alphaproteobacteria
GGG
Pro
>WENV180254615
OBEQ010646079
131431
Alphaproteobacteria
GGG
Pro
>WENV180272602
OBEQ012395781
342876
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV180259134
OBEQ011075465
342876
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV180254377
OBEQ010625398
342876
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV180255981
OBEQ010772032
164825
Alphaproteobacteria
GAT
Ile
>WENV180254822
OBEQ010669151
257082
Alphaproteobacteria
TAC
Val
>WENV180252724
OBEQ010473739
289655
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180252723
OBEQ010473739
289655
Alphaproteobacteria
GGC
Ala
>WENV180258411
OBEQ011005051
59164
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV180261936
OBEQ011340838
310237
Alphaproteobacteria
CTT
Lys
>WENV180264870
OBEQ011610392
152773
Alphaproteobacteria
GTG
His
>WENV180263516
OBEQ011482695
303842
Alphaproteobacteria
TAC
Val
>WENV180254081
OBEQ010601636
30071
Alphaproteobacteria
CGA
Ser
>WENV180258394
OBEQ011003785
237474
Alphaproteobacteria
CCA
Trp
>WENV180266504
OBEQ011761686
259072
Alphaproteobacteria
CGC
Ala
>WENV180265087
OBEQ011629402
259072
Alphaproteobacteria
CGC
Ala
>WENV180269847
OBEQ012104739
345469
Alphaproteobacteria
TGT
Thr
>WENV180261478
OBEQ011298079
316120
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV180250900
OBEQ010322632
237198
Alphaproteobacteria
CGC
Ala
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK