This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
134 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180307146
OBJQ01000001
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307148
OBJQ01000001
368876
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180307150
OBJQ01000001
37437
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307151
OBJQ01000001
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV180307152
OBJQ01000001
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180307155
OBJQ01000002
273029
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180307158
OBJQ01000002
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180307159
OBJQ01000002
152491
Bacillota
CAT
Met
>WENV180307160
OBJQ01000002
287034
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180307162
OBJQ01000002
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307164
OBJQ01000005
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180307165
OBJQ01000005
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307218
OBJQ01000013
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180307222
OBJQ01000014
147135
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307226
OBJQ01000014
342895
Bacillota
CAT
Met
>WENV180307236
OBJQ01000019
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307237
OBJQ01000019
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307238
OBJQ01000019
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180307241
OBJQ01000020
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180307246
OBJQ01000023
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180307247
OBJQ01000023
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307248
OBJQ01000023
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307256
OBJQ01000030
338143
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180307263
OBJQ01000033
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180307265
OBJQ01000035
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180307268
OBJQ01000038
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180307278
OBJQ01000043
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180307281
OBJQ01000043
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180307292
OBJQ01000056
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180307300
OBJQ01000065
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180307304
OBJQ01000068
243613
Bacillota
GTG
His
>WENV180307305
OBJQ01000068
343027
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180307306
OBJQ01000068
243647
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180307307
OBJQ01000070
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307309
OBJQ01000070
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307328
OBJQ01000084
338143
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180307329
OBJQ01000084
338143
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180307339
OBJQ01000092
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180307340
OBJQ01000092
339151
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180307341
OBJQ01000092
241761
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307358
OBJQ01000107
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180307365
OBJQ01000119
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180307378
OBJQ01000135
16842
Bacillota
CGA
Ser
>WENV180307379
OBJQ01000135
194150
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180307381
OBJQ01000135
178024
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180307383
OBJQ01000137
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180307414
OBJQ01000174
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180307417
OBJQ01000177
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307429
OBJQ01000198
152046
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180307433
OBJQ01000203
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180307440
OBJQ01000213
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180307449
OBJQ01000219
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307456
OBJQ01000237
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307458
OBJQ01000237
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307490
OBJQ01000362
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180307494
OBJQ01000362
241761
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307496
OBJQ01000362
342736
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180307538
OBJQ01000521
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180307554
OBJQ01000539
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180307560
OBJQ01000583
368876
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180307561
OBJQ01000583
287034
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180307572
OBJQ01000634
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180307585
OBJQ01000674
152047
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180307622
OBJQ01000841
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180307623
OBJQ01000841
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180307627
OBJQ01000866
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180307647
OBJQ01001007
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180307651
OBJQ01001059
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307656
OBJQ01001112
114440
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180307662
OBJQ01001153
152051
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307663
OBJQ01001153
148268
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180307665
OBJQ01001155
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307671
OBJQ01001155
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180307689
OBJQ01001267
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180307710
OBJQ01001431
185292
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180307719
OBJQ01001520
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180307720
OBJQ01001520
152045
Bacillota
CAT
Met
>WENV180307721
OBJQ01001521
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180307723
OBJQ01001547
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180307727
OBJQ01001550
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180307741
OBJQ01001692
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307796
OBJQ01002609
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180307813
OBJQ01003052
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180307819
OBJQ01003248
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180307821
OBJQ01003248
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307822
OBJQ01003254
37551
Bacillota
CGA
Ser
>WENV180307833
OBJQ01003584
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180307862
OBJQ01004466
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307873
OBJQ01004775
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180307915
OBJQ01006534
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180307921
OBJQ01006639
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180307925
OBJQ01006741
419945
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180307926
OBJQ01006741
37549
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180307927
OBJQ01006841
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180307942
OBJQ01007382
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180307948
OBJQ01007823
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180307976
OBJQ01010393
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180308002
OBJQ01013335
247057
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308008
OBJQ01013881
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180308014
OBJQ01014505
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180308038
OBJQ01017131
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180308041
OBJQ01017899
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180308043
OBJQ01017899
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180308058
OBJQ01020431
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308060
OBJQ01020631
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180308061
OBJQ01020977
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180308062
OBJQ01020977
10680
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180308071
OBJQ01023092
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180308073
OBJQ01023092
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180308085
OBJQ01024498
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180308091
OBJQ01026845
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV180308116
OBJQ01035082
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308130
OBJQ01037267
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308141
OBJQ01039048
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180308156
OBJQ01045047
198250
Bacillota
CAT
Met
>WENV180308160
OBJQ01046292
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180308171
OBJQ01052919
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180308181
OBJQ01056833
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180308191
OBJQ01060794
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180308192
OBJQ01060794
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180308209
OBJQ01064772
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180308211
OBJQ01065471
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180308216
OBJQ01068847
344183
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180308224
OBJQ01070987
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180308259
OBJQ01091566
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308281
OBJQ01103016
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180308293
OBJQ01114418
235287
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180308306
OBJQ01125112
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180308316
OBJQ01136557
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV180308324
OBJQ01145360
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180308330
OBJQ01145856
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180308347
OBJQ01147393
384950
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180308353
OBJQ01147421
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180308354
OBJQ01147422
287000
Bacillota
GTT
Asn
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK