This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
137 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180328914
OBKV01000062
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180328972
OBKV01000094
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180328973
OBKV01000096
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180328998
OBKV01000122
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329025
OBKV01000144
184539
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329037
OBKV01000155
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329061
OBKV01000179
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329066
OBKV01000185
280462
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329093
OBKV01000206
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329091
OBKV01000206
280427
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329119
OBKV01000236
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV180329121
OBKV01000236
280463
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329129
OBKV01000252
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180329137
OBKV01000277
175899
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329140
OBKV01000277
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329142
OBKV01000277
280462
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329143
OBKV01000277
280463
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329167
OBKV01000308
281445
Bacillota
GTG
His
>WENV180329170
OBKV01000316
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180329169
OBKV01000316
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180329180
OBKV01000346
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329183
OBKV01000350
444314
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180329186
OBKV01000355
294020
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329190
OBKV01000359
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180329191
OBKV01000359
330433
Bacillota
GTG
His
>WENV180329206
OBKV01000404
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329207
OBKV01000404
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329208
OBKV01000405
285601
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180329209
OBKV01000405
285601
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180329219
OBKV01000412
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329271
OBKV01000599
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329299
OBKV01000694
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180329314
OBKV01000770
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329315
OBKV01000770
302145
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329317
OBKV01000776
46643
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180329405
OBKV01001062
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329412
OBKV01001107
399272
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180329449
OBKV01001355
204381
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180329474
OBKV01001477
328987
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180329484
OBKV01001563
295166
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180329490
OBKV01001619
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329496
OBKV01001676
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329497
OBKV01001676
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329498
OBKV01001676
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329529
OBKV01001950
399266
Bacillota
>WENV180329530
OBKV01001950
399266
Bacillota
>WENV180329531
OBKV01001950
399266
Bacillota
>WENV180329537
OBKV01002055
280483
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329538
OBKV01002055
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329569
OBKV01002296
120584
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329574
OBKV01002332
449573
Bacillota
>WENV180329640
OBKV01003254
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180329638
OBKV01003254
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329735
OBKV01005232
344985
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329781
OBKV01006168
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329783
OBKV01006168
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329794
OBKV01006444
483485
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180329817
OBKV01007201
223045
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180329818
OBKV01007269
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329828
OBKV01007478
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180329826
OBKV01007478
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180329825
OBKV01007478
354380
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329824
OBKV01007478
203851
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329829
OBKV01007478
203851
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329837
OBKV01007735
343590
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329838
OBKV01007735
343590
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329913
OBKV01010383
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180329924
OBKV01010694
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180329923
OBKV01010694
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV180329942
OBKV01011572
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180329943
OBKV01011775
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180329948
OBKV01012011
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329947
OBKV01012011
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180329995
OBKV01014119
344985
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330001
OBKV01014317
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330003
OBKV01014413
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330010
OBKV01014648
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330018
OBKV01014826
362245
Bacillota
TAC
Val
>WENV180330029
OBKV01014826
176018
Bacillota
CAT
Met
>WENV180330016
OBKV01014826
398915
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330024
OBKV01014826
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180330023
OBKV01014826
398916
Bacillota
>WENV180330050
OBKV01015725
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180330066
OBKV01016083
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330109
OBKV01018850
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180330108
OBKV01018850
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330144
OBKV01021268
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180330147
OBKV01021293
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180330146
OBKV01021293
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180330158
OBKV01021888
82124
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180330166
OBKV01022325
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330171
OBKV01023160
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180330177
OBKV01023523
280427
Bacillota
TAC
Val
>WENV180330234
OBKV01030813
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV180330237
OBKV01031126
280646
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330243
OBKV01032073
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330242
OBKV01032073
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180330251
OBKV01033612
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180330266
OBKV01034472
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330267
OBKV01034505
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330280
OBKV01036587
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180330297
OBKV01038269
332891
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330298
OBKV01038271
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330307
OBKV01039145
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180330309
OBKV01039188
175825
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330329
OBKV01042090
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180330330
OBKV01042123
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330353
OBKV01045694
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180330376
OBKV01051415
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330386
OBKV01053139
348419
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330391
OBKV01053139
294020
Bacillota
TAC
Val
>WENV180330387
OBKV01053139
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330417
OBKV01056726
280483
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330418
OBKV01056726
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180330433
OBKV01061369
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180330435
OBKV01062671
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330463
OBKV01070340
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180330476
OBKV01073444
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180330483
OBKV01074319
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330481
OBKV01074319
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV180330482
OBKV01074319
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330491
OBKV01075022
175915
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330543
OBKV01092833
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330585
OBKV01111279
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180330587
OBKV01112621
290325
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180330600
OBKV01121361
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV180330601
OBKV01121361
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330650
OBKV01146254
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180330688
OBKV01168157
280639
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180330689
OBKV01168157
480360
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180330705
OBKV01186940
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330718
OBKV01207655
282867
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330741
OBKV01236835
195133
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330772
OBKV01273042
234991
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330776
OBKV01273488
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180330778
OBKV01273636
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180330797
OBKV01279023
280500
Bacillota
TGC
Ala
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK