This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
138 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180508205
OCAT01041119
398916
Bacillota
>WENV180507502
OCAT01001309
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180507715
OCAT01003567
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180507071
OCAT01000071
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507862
OCAT01007048
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507950
OCAT01011557
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507546
OCAT01001529
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV180507555
OCAT01001587
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV180507256
OCAT01000336
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507515
OCAT01001396
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507552
OCAT01001579
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507662
OCAT01002451
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507921
OCAT01009354
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV180507509
OCAT01001337
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV180507623
OCAT01002112
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV180507186
OCAT01000262
187589
Bacillota
CAT
Met
>WENV180508178
OCAT01037890
280644
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180507728
OCAT01003736
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180507872
OCAT01007592
483485
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180507994
OCAT01014319
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180507415
OCAT01000888
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180507325
OCAT01000495
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180507935
OCAT01010596
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180507867
OCAT01007440
406186
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180508315
OCAT01087439
407726
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507347
OCAT01000582
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507414
OCAT01000888
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507776
OCAT01004526
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180508307
OCAT01080273
400979
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507839
OCAT01005860
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180507925
OCAT01009671
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180507585
OCAT01001768
330413
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180507020
OCAT01000036
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507900
OCAT01008653
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507105
OCAT01000129
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507187
OCAT01000262
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507352
OCAT01000612
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507444
OCAT01001050
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507519
OCAT01001414
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507565
OCAT01001651
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507742
OCAT01004032
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507496
OCAT01001245
280483
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507816
OCAT01005576
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV180508173
OCAT01037690
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV180507461
OCAT01001081
175825
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180508333
OCAT01106874
198522
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180508107
OCAT01025863
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180507904
OCAT01008653
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180508038
OCAT01018559
480360
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180507848
OCAT01006206
398835
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507497
OCAT01001245
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507664
OCAT01002451
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180507807
OCAT01005323
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180508094
OCAT01023628
13228
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180506974
OCAT01000009
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180507632
OCAT01002163
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180507522
OCAT01001417
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507524
OCAT01001417
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507821
OCAT01005635
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507824
OCAT01005635
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507543
OCAT01001521
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507739
OCAT01003947
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180508287
OCAT01068675
124757
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507529
OCAT01001452
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180508317
OCAT01088280
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507441
OCAT01001050
118359
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180508344
OCAT01109273
175847
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180508204
OCAT01041119
195133
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507135
OCAT01000168
180688
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507295
OCAT01000446
180688
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180508343
OCAT01109261
175915
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507019
OCAT01000036
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507523
OCAT01001417
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507823
OCAT01005635
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507902
OCAT01008653
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507455
OCAT01001077
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV180507242
OCAT01000315
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180507326
OCAT01000495
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180508292
OCAT01069678
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180508164
OCAT01036991
332651
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180507530
OCAT01001452
82124
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180508151
OCAT01034296
82124
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180507622
OCAT01002108
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180507124
OCAT01000152
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507136
OCAT01000168
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507296
OCAT01000446
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507018
OCAT01000036
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507116
OCAT01000143
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507278
OCAT01000387
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507378
OCAT01000747
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507380
OCAT01000747
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507383
OCAT01000748
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507733
OCAT01003823
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507735
OCAT01003823
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180508064
OCAT01021095
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV180508084
OCAT01023136
317820
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507211
OCAT01000298
228119
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507217
OCAT01000298
228119
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507224
OCAT01000298
228119
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180508206
OCAT01041119
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507244
OCAT01000316
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180508251
OCAT01055533
179166
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507663
OCAT01002451
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180507806
OCAT01005323
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180508025
OCAT01017214
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508282
OCAT01065405
280646
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507460
OCAT01001081
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507909
OCAT01008750
295350
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508321
OCAT01094830
332891
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508235
OCAT01048378
292374
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507913
OCAT01008899
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508077
OCAT01022367
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508167
OCAT01037060
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507637
OCAT01002201
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180507756
OCAT01004241
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180508286
OCAT01068675
418726
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180508277
OCAT01064012
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507809
OCAT01005344
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507133
OCAT01000168
285556
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507297
OCAT01000446
285556
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180508143
OCAT01032274
398915
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507617
OCAT01002108
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507942
OCAT01010907
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180508157
OCAT01034914
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507510
OCAT01001337
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507624
OCAT01002112
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507251
OCAT01000326
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507456
OCAT01001077
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507413
OCAT01000888
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507604
OCAT01002035
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507188
OCAT01000262
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507205
OCAT01000298
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507207
OCAT01000298
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507213
OCAT01000298
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507220
OCAT01000298
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507226
OCAT01000298
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507445
OCAT01001050
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507644
OCAT01002286
280476
Bacillota
TTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK