This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
220 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180755399
ODHV01000002
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180755397
ODHV01000002
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180755409
ODHV01000008
37071
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180755407
ODHV01000008
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180755410
ODHV01000008
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180755406
ODHV01000008
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180755421
ODHV01000014
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180755420
ODHV01000014
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180755456
ODHV01000022
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180755453
ODHV01000022
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180755467
ODHV01000031
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180755505
ODHV01000052
37071
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180755508
ODHV01000052
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180755537
ODHV01000077
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180755596
ODHV01000151
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180755595
ODHV01000151
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180755639
ODHV01000220
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180755678
ODHV01000285
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180755700
ODHV01000326
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180755701
ODHV01000326
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180755821
ODHV01000645
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180755826
ODHV01000677
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180755837
ODHV01000725
256380
Bacillota
>WENV180755863
ODHV01000819
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180755871
ODHV01000839
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180755885
ODHV01000894
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180755914
ODHV01001072
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180755958
ODHV01001373
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180755963
ODHV01001384
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180755964
ODHV01001384
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180755962
ODHV01001384
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180755980
ODHV01001457
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180755982
ODHV01001466
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180755984
ODHV01001523
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180755985
ODHV01001529
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180755987
ODHV01001538
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180756006
ODHV01001668
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180756021
ODHV01001747
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180756019
ODHV01001747
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180756023
ODHV01001790
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180756035
ODHV01001887
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756040
ODHV01001950
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180756047
ODHV01002029
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756052
ODHV01002066
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756059
ODHV01002135
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180756063
ODHV01002180
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180756074
ODHV01002261
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756086
ODHV01002410
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756089
ODHV01002427
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180756090
ODHV01002428
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756091
ODHV01002436
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756098
ODHV01002475
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756104
ODHV01002661
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180756109
ODHV01002684
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756110
ODHV01002684
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756112
ODHV01002778
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180756120
ODHV01002810
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180756125
ODHV01002913
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756126
ODHV01002919
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756128
ODHV01002939
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180756135
ODHV01003038
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756137
ODHV01003054
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756139
ODHV01003072
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180756141
ODHV01003114
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180756144
ODHV01003193
256380
Bacillota
>WENV180756146
ODHV01003237
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180756163
ODHV01003537
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756174
ODHV01003718
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756178
ODHV01003787
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756179
ODHV01003804
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756180
ODHV01003814
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180756185
ODHV01003827
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180756187
ODHV01003838
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756186
ODHV01003838
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180756193
ODHV01004068
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180756197
ODHV01004171
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756199
ODHV01004214
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180756203
ODHV01004361
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756207
ODHV01004465
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756211
ODHV01004472
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180756214
ODHV01004539
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756218
ODHV01004595
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756220
ODHV01004646
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756221
ODHV01004646
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756225
ODHV01004758
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180756227
ODHV01004845
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180756231
ODHV01004956
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756236
ODHV01005120
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756240
ODHV01005252
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180756243
ODHV01005264
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756244
ODHV01005264
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756246
ODHV01005286
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180756247
ODHV01005347
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756248
ODHV01005347
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756249
ODHV01005364
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180756251
ODHV01005417
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756254
ODHV01005534
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756265
ODHV01005845
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756266
ODHV01005849
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756267
ODHV01005859
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756272
ODHV01005918
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180756279
ODHV01006059
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756278
ODHV01006059
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756281
ODHV01006059
185292
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180756282
ODHV01006062
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180756288
ODHV01006357
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180756292
ODHV01006489
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756296
ODHV01006620
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756303
ODHV01006681
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180756297
ODHV01006681
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756302
ODHV01006681
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756300
ODHV01006681
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756306
ODHV01006974
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756313
ODHV01007163
173314
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180756316
ODHV01007531
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180756320
ODHV01007763
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756324
ODHV01008120
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756343
ODHV01009007
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180756344
ODHV01009038
313104
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756347
ODHV01009067
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756359
ODHV01009463
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180756363
ODHV01009545
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756364
ODHV01009545
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756367
ODHV01009771
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756368
ODHV01009771
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756378
ODHV01010256
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756380
ODHV01010256
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756377
ODHV01010256
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756379
ODHV01010256
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756392
ODHV01010753
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756393
ODHV01010753
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756395
ODHV01010974
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756396
ODHV01010974
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756415
ODHV01011570
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756416
ODHV01011570
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756419
ODHV01011843
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756430
ODHV01012841
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180756431
ODHV01013196
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756432
ODHV01013209
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180756434
ODHV01013339
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180756435
ODHV01013339
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180756450
ODHV01014972
21693
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180756457
ODHV01015812
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180756462
ODHV01016176
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180756468
ODHV01016727
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756474
ODHV01017097
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180756479
ODHV01017789
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180756478
ODHV01017789
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756493
ODHV01019965
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180756498
ODHV01020569
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756499
ODHV01020598
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756500
ODHV01020598
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756507
ODHV01021346
247057
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756508
ODHV01021575
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180756510
ODHV01022002
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756518
ODHV01023114
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756520
ODHV01023114
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180756548
ODHV01026454
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756550
ODHV01027214
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180756573
ODHV01031146
345329
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180756595
ODHV01034509
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180756608
ODHV01037566
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756609
ODHV01037700
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756624
ODHV01042100
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180756637
ODHV01045856
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756638
ODHV01045856
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756657
ODHV01051961
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756660
ODHV01052464
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180756664
ODHV01053867
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756670
ODHV01057466
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756671
ODHV01057466
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756683
ODHV01059317
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756685
ODHV01059659
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180756684
ODHV01059659
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756700
ODHV01064244
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180756704
ODHV01065743
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180756714
ODHV01068152
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756720
ODHV01068993
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756727
ODHV01070310
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180756747
ODHV01076729
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756746
ODHV01076729
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756748
ODHV01077001
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180756771
ODHV01087619
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180756774
ODHV01089330
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756778
ODHV01089848
292012
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756784
ODHV01094532
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180756788
ODHV01096554
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756789
ODHV01096554
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756790
ODHV01097678
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756798
ODHV01099975
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756799
ODHV01099975
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756805
ODHV01101780
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756814
ODHV01106084
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756819
ODHV01107612
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756826
ODHV01111349
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180756825
ODHV01111349
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180756827
ODHV01112500
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180756833
ODHV01116203
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756835
ODHV01117384
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756839
ODHV01118586
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756840
ODHV01118586
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756863
ODHV01135148
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180756894
ODHV01163172
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180756911
ODHV01181615
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180756914
ODHV01185621
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180756915
ODHV01185621
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180756922
ODHV01189918
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180756927
ODHV01190470
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180756929
ODHV01190495
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756930
ODHV01190590
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756932
ODHV01190676
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180756934
ODHV01190817
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180756936
ODHV01190868
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756937
ODHV01191112
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180756939
ODHV01191246
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756945
ODHV01192862
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180756947
ODHV01193581
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180756953
ODHV01194035
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180756957
ODHV01194079
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180756964
ODHV01194211
411547
Bacillota
CTG
Gln
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK