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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
140 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV181516512
OGGZ01000018
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181516522
OGGZ01000024
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181516528
OGGZ01000033
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181516537
OGGZ01000038
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181516606
OGGZ01000105
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181516619
OGGZ01000131
175899
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181516649
OGGZ01000182
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181516648
OGGZ01000182
483485
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181516664
OGGZ01000209
283739
Bacillota
AGT
Thr
>WENV181516680
OGGZ01000224
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181516694
OGGZ01000251
400600
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181516725
OGGZ01000280
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181516738
OGGZ01000307
280462
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181516739
OGGZ01000307
280463
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181516743
OGGZ01000314
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181516749
OGGZ01000323
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181516773
OGGZ01000378
74057
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181516785
OGGZ01000410
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181516784
OGGZ01000410
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181516796
OGGZ01000448
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181516795
OGGZ01000448
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181516798
OGGZ01000450
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181516797
OGGZ01000450
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181516814
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175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181516821
OGGZ01000539
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181516841
OGGZ01000609
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV181516842
OGGZ01000609
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181516845
OGGZ01000613
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181516860
OGGZ01000659
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181516894
OGGZ01000747
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181516893
OGGZ01000747
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181516913
OGGZ01000842
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181516919
OGGZ01000886
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV181516930
OGGZ01000925
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV181516926
OGGZ01000925
280463
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181516938
OGGZ01000944
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181516941
OGGZ01000953
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181516970
OGGZ01001081
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181516974
OGGZ01001084
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181516972
OGGZ01001084
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV181516973
OGGZ01001084
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181516985
OGGZ01001167
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181516990
OGGZ01001198
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV181517005
OGGZ01001284
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181517015
OGGZ01001347
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181517024
OGGZ01001380
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181517027
OGGZ01001419
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181517026
OGGZ01001419
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181517029
OGGZ01001432
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181517043
OGGZ01001490
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181517047
OGGZ01001543
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181517046
OGGZ01001543
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181517075
OGGZ01001768
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181517074
OGGZ01001768
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181517079
OGGZ01001797
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181517080
OGGZ01001817
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181517090
OGGZ01001864
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181517102
OGGZ01001955
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181517111
OGGZ01002032
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV181517112
OGGZ01002032
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181517125
OGGZ01002098
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181517130
OGGZ01002108
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181517129
OGGZ01002108
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181517128
OGGZ01002108
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181517199
OGGZ01002889
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV181517202
OGGZ01002930
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181517204
OGGZ01002954
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV181517211
OGGZ01003001
480337
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181517210
OGGZ01003001
208539
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181517215
OGGZ01003012
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181517224
OGGZ01003078
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181517244
OGGZ01003405
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181517254
OGGZ01003495
487072
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181517255
OGGZ01003495
56397
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181517249
OGGZ01003495
283738
Bacillota
CGT
Thr
>WENV181517252
OGGZ01003495
285949
Bacillota
GTG
His
>WENV181517253
OGGZ01003495
400606
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181517286
OGGZ01003847
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181517288
OGGZ01003859
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181517296
OGGZ01004010
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181517317
OGGZ01004576
156219
Bacillota
GTG
His
>WENV181517320
OGGZ01004593
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV181517322
OGGZ01004633
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Bacillota
CGG
Pro
>WENV181517327
OGGZ01004744
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181517334
OGGZ01004915
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181517333
OGGZ01004915
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181517340
OGGZ01005028
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181517344
OGGZ01005109
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181517375
OGGZ01005572
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181517377
OGGZ01005599
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181517397
OGGZ01006288
280463
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181517400
OGGZ01006436
288728
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181517437
OGGZ01007120
178962
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181517440
OGGZ01007216
20932
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181517447
OGGZ01007288
48505
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181517452
OGGZ01007531
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV181517476
OGGZ01008299
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181517491
OGGZ01008728
20648
Bacillota
CGA
Ser
>WENV181517495
OGGZ01008864
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181517501
OGGZ01009089
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181517500
OGGZ01009089
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181517510
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291553
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181517513
OGGZ01009390
432453
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181517509
OGGZ01009390
280547
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181517514
OGGZ01009390
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV181517517
OGGZ01009454
20942
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181517533
OGGZ01009809
284101
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181517585
OGGZ01011959
296855
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181517586
OGGZ01011959
184495
Bacillota
CAT
Met
>WENV181517593
OGGZ01012778
482593
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181517595
OGGZ01013084
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181517615
OGGZ01014016
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV181517616
OGGZ01014016
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181517617
OGGZ01014236
187364
Bacillota
CAT
Met
>WENV181517623
OGGZ01014556
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181517624
OGGZ01014621
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181517648
OGGZ01016433
74129
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181517677
OGGZ01019913
180992
Bacillota
CCT
Arg
>WENV181517679
OGGZ01019947
404091
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181517678
OGGZ01019947
289716
Bacillota
GTG
His
>WENV181517680
OGGZ01019947
289761
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181517681
OGGZ01020077
163373
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181517692
OGGZ01021113
184537
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181517695
OGGZ01021495
180991
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181517714
OGGZ01022498
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181517720
OGGZ01022498
398915
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181517732
OGGZ01023730
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181517737
OGGZ01024425
141202
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181517744
OGGZ01026288
119459
Bacillota
TAG
Leu
>WENV181517747
OGGZ01026762
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV181517750
OGGZ01028910
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181517751
OGGZ01028919
481771
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181517765
OGGZ01030300
104114
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181517771
OGGZ01030972
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181517787
OGGZ01035635
46953
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181517794
OGGZ01037473
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181517799
OGGZ01038449
186051
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181517800
OGGZ01038502
285946
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181517813
OGGZ01042033
281017
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181517823
OGGZ01045574
285948
Bacillota
CGT
Thr
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
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