This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
130 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183524015
ONZT01000004
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183524021
ONZT01000004
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183524017
ONZT01000004
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524019
ONZT01000004
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524231
ONZT01000200
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524235
ONZT01000200
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524989
ONZT01022685
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183524020
ONZT01000004
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183525002
ONZT01028419
184537
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183524171
ONZT01000130
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524425
ONZT01000721
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524016
ONZT01000004
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183524234
ONZT01000200
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183524895
ONZT01013284
408526
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183524980
ONZT01022588
296855
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183524887
ONZT01013030
48505
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183524232
ONZT01000200
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524076
ONZT01000036
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183524633
ONZT01002609
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183524531
ONZT01001382
348419
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183524389
ONZT01000590
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183524959
ONZT01020537
291553
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183524831
ONZT01009264
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183524323
ONZT01000387
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183524709
ONZT01004023
339995
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183524814
ONZT01008038
20942
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183524925
ONZT01015794
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183524182
ONZT01000136
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183524297
ONZT01000317
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183524133
ONZT01000086
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183524772
ONZT01005766
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183524418
ONZT01000719
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524435
ONZT01000770
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524816
ONZT01008156
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524750
ONZT01004839
175825
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183524014
ONZT01000004
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183524075
ONZT01000036
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183524705
ONZT01003991
481217
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183524987
ONZT01022685
283502
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524597
ONZT01001977
407726
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183524079
ONZT01000036
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183524115
ONZT01000067
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183524478
ONZT01000890
398835
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524749
ONZT01004839
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183524985
ONZT01022685
330433
Bacillota
GTG
His
>WENV183524065
ONZT01000031
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183524981
ONZT01022588
184495
Bacillota
CAT
Met
>WENV183524741
ONZT01004597
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183524419
ONZT01000719
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183524436
ONZT01000770
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183524219
ONZT01000187
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524610
ONZT01002189
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524977
ONZT01022588
289713
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183525017
ONZT01033184
404091
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183524078
ONZT01000036
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183524197
ONZT01000144
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183524704
ONZT01003989
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183524188
ONZT01000138
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183524057
ONZT01000028
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183524170
ONZT01000129
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183524552
ONZT01001606
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183525016
ONZT01033184
289716
Bacillota
GTG
His
>WENV183524168
ONZT01000129
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183524169
ONZT01000129
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183524238
ONZT01000208
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183524361
ONZT01000495
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183524077
ONZT01000036
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183524479
ONZT01000893
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183524769
ONZT01005689
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183524786
ONZT01006175
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183524789
ONZT01006323
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183524424
ONZT01000721
180688
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524897
ONZT01013489
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183524759
ONZT01005301
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524888
ONZT01013284
432453
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183524892
ONZT01013284
432453
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183524828
ONZT01008968
480337
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183524854
ONZT01010967
292374
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183524532
ONZT01001382
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183524773
ONZT01005791
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183524287
ONZT01000309
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183524288
ONZT01000309
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183524363
ONZT01000523
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183525026
ONZT01035184
291597
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183525027
ONZT01036297
291597
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183524891
ONZT01013284
333281
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183524325
ONZT01000387
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183524614
ONZT01002254
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183524958
ONZT01020537
280547
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524149
ONZT01000105
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183524890
ONZT01013284
445407
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524894
ONZT01013284
445407
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183525018
ONZT01033184
289761
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524139
ONZT01000095
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183524388
ONZT01000590
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183524324
ONZT01000387
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183524983
ONZT01022685
203851
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183524968
ONZT01021178
175915
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524889
ONZT01013284
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524893
ONZT01013284
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524577
ONZT01001802
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524864
ONZT01011674
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524974
ONZT01022119
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183524767
ONZT01005530
20943
Bacillota
CGA
Ser
>WENV183524862
ONZT01011475
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183524853
ONZT01010967
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183524744
ONZT01004597
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183524827
ONZT01008968
208539
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183524350
ONZT01000438
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524352
ONZT01000438
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524627
ONZT01002429
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524644
ONZT01002771
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524770
ONZT01005703
321248
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524187
ONZT01000138
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV183524087
ONZT01000044
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183524669
ONZT01003187
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183524266
ONZT01000286
285556
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183524018
ONZT01000004
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524233
ONZT01000200
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524286
ONZT01000309
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183524780
ONZT01006003
317820
Bacillota
TAC
Val
>WENV183524574
ONZT01001802
179166
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183524923
ONZT01015103
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183525010
ONZT01030713
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183524204
ONZT01000158
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524420
ONZT01000719
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524817
ONZT01008156
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183524132
ONZT01000086
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183524183
ONZT01000136
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183524521
ONZT01001288
280473
Bacillota
TGG
Pro
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK