This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
151 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183537003
OOAG01028066
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183536307
OOAG01002586
510477
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183537273
OOAG01072970
57121
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183536473
OOAG01004900
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183537081
OOAG01034338
356775
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183536953
OOAG01024063
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183537030
OOAG01029291
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183536331
OOAG01002792
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536364
OOAG01003236
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536368
OOAG01003236
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536570
OOAG01006368
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536685
OOAG01009167
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536825
OOAG01016119
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183537059
OOAG01032291
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536571
OOAG01006368
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183536171
OOAG01001677
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV183536062
OOAG01000986
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183536367
OOAG01003236
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183536441
OOAG01004309
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183536646
OOAG01008362
229015
Bacillota
GTG
His
>WENV183536365
OOAG01003236
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV183537245
OOAG01058571
284746
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536111
OOAG01001240
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183536657
OOAG01008569
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183536684
OOAG01009152
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183537015
OOAG01028066
280639
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183535654
OOAG01000063
291629
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183536102
OOAG01001178
287289
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536876
OOAG01018855
236579
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183536604
OOAG01007347
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183537161
OOAG01045110
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183537014
OOAG01028066
459011
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183537011
OOAG01028066
298270
Bacillota
TAC
Val
>WENV183537018
OOAG01028066
176018
Bacillota
CAT
Met
>WENV183537009
OOAG01028066
398915
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183535681
OOAG01000086
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183535907
OOAG01000444
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536326
OOAG01002710
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536881
OOAG01018898
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536872
OOAG01018505
312230
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536686
OOAG01009288
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536394
OOAG01003518
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183536411
OOAG01003905
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183536523
OOAG01005562
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183536592
OOAG01006939
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183536599
OOAG01007182
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183536677
OOAG01008986
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183535939
OOAG01000527
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183536533
OOAG01005740
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183536547
OOAG01005959
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183535652
OOAG01000063
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183535724
OOAG01000129
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183536108
OOAG01001210
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183537231
OOAG01055068
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183536202
OOAG01001887
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183536734
OOAG01011418
481217
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183535908
OOAG01000444
460732
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183536056
OOAG01000968
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183535986
OOAG01000716
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183536288
OOAG01002434
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183536957
OOAG01024126
175847
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183537013
OOAG01028066
280641
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183536442
OOAG01004309
290325
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536669
OOAG01008830
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183535601
OOAG01000032
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183536645
OOAG01008362
179810
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183535725
OOAG01000129
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183535617
OOAG01000040
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183535647
OOAG01000061
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183537118
OOAG01038583
295350
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183537084
OOAG01034493
27216
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183536771
OOAG01013402
484885
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183537074
OOAG01033705
484885
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183535813
OOAG01000248
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183535846
OOAG01000320
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536055
OOAG01000968
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536115
OOAG01001274
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536184
OOAG01001729
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536227
OOAG01002020
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536355
OOAG01003117
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536706
OOAG01009814
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183536914
OOAG01021350
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183537202
OOAG01052532
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183537281
OOAG01077798
187364
Bacillota
CAT
Met
>WENV183536496
OOAG01005340
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536319
OOAG01002657
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183536375
OOAG01003332
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183536613
OOAG01007688
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183536318
OOAG01002657
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183536612
OOAG01007688
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183536448
OOAG01004418
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183536700
OOAG01009657
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183536916
OOAG01021588
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183536137
OOAG01001448
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536149
OOAG01001524
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536180
OOAG01001709
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536183
OOAG01001729
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536561
OOAG01006281
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183536515
OOAG01005471
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183536840
OOAG01017477
175899
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183535762
OOAG01000162
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183536995
OOAG01027245
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183537182
OOAG01048940
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183536750
OOAG01012170
323864
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183535787
OOAG01000204
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183536616
OOAG01007721
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183537097
OOAG01035511
292374
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183536760
OOAG01012771
186051
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183536780
OOAG01013954
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183536854
OOAG01017951
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183536025
OOAG01000851
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183536520
OOAG01005528
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183536761
OOAG01012772
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183536948
OOAG01023410
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183536955
OOAG01024064
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183537025
OOAG01028278
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183537254
OOAG01065272
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183535761
OOAG01000162
321753
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183535951
OOAG01000580
321753
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183536516
OOAG01005472
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183536672
OOAG01008910
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183537068
OOAG01033045
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183537123
OOAG01039710
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183536947
OOAG01023334
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183536598
OOAG01007174
330413
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183537229
OOAG01054938
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183535989
OOAG01000721
52748
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183536209
OOAG01001927
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183536775
OOAG01013402
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183537170
OOAG01046499
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183537257
OOAG01065991
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183536690
OOAG01009366
309916
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183537096
OOAG01035511
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183535604
OOAG01000032
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183536495
OOAG01005340
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV183537053
OOAG01031789
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV183536246
OOAG01002181
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183536376
OOAG01003337
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183537100
OOAG01035831
285556
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183536366
OOAG01003236
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183535596
OOAG01000029
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183535653
OOAG01000063
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183535715
OOAG01000121
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183535797
OOAG01000216
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183537190
OOAG01049887
284680
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183535938
OOAG01000527
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183536532
OOAG01005740
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183536153
OOAG01001543
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183536339
OOAG01002950
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183536465
OOAG01004713
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183536887
OOAG01019217
280473
Bacillota
TGG
Pro
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK