This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
111 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183546342
OOAT01001084
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183546381
OOAT01001679
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183546607
OOAT01017548
343590
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546621
OOAT01021160
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183546670
OOAT01032709
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183546373
OOAT01001516
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545999
OOAT01000044
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546314
OOAT01000966
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546382
OOAT01001691
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546415
OOAT01002486
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546680
OOAT01034572
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546302
OOAT01000908
229015
Bacillota
GTG
His
>WENV183546077
OOAT01000116
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV183546280
OOAT01000755
302145
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545997
OOAT01000044
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV183546326
OOAT01001018
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183546450
OOAT01003482
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183546459
OOAT01003787
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183546595
OOAT01015635
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183546493
OOAT01005768
179563
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183546492
OOAT01005768
295166
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183546452
OOAT01003565
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183546047
OOAT01000072
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183546139
OOAT01000252
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183546417
OOAT01002517
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183546661
OOAT01030127
82124
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183546227
OOAT01000533
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546259
OOAT01000649
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546305
OOAT01000916
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546432
OOAT01003001
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546489
OOAT01005573
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546520
OOAT01007390
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183546215
OOAT01000483
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183546292
OOAT01000806
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183546340
OOAT01001075
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183546451
OOAT01003558
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183546509
OOAT01006532
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546074
OOAT01000116
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183546238
OOAT01000562
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183546411
OOAT01002376
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183546082
OOAT01000122
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546207
OOAT01000432
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546296
OOAT01000843
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546354
OOAT01001292
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546494
OOAT01005829
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546518
OOAT01007255
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183546225
OOAT01000529
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183546399
OOAT01002135
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183546046
OOAT01000072
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183546301
OOAT01000908
179810
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183546510
OOAT01006532
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546669
OOAT01032709
175916
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183546159
OOAT01000319
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546224
OOAT01000529
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546398
OOAT01002135
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546462
OOAT01003935
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546468
OOAT01004096
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546469
OOAT01004128
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183546457
OOAT01003663
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183546467
OOAT01004077
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183545992
OOAT01000044
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183546093
OOAT01000133
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183546311
OOAT01000951
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183546343
OOAT01001103
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183546091
OOAT01000133
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183546464
OOAT01003971
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183546650
OOAT01027863
322848
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183546092
OOAT01000133
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546310
OOAT01000951
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546456
OOAT01003663
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546466
OOAT01004077
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546649
OOAT01027863
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546258
OOAT01000641
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183546336
OOAT01001060
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183546203
OOAT01000407
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183546226
OOAT01000529
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183546334
OOAT01001052
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183546626
OOAT01022666
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183546579
OOAT01013718
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183546600
OOAT01016321
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546614
OOAT01019166
186051
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183546056
OOAT01000086
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183546194
OOAT01000394
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183546197
OOAT01000394
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183546436
OOAT01003090
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183546523
OOAT01007437
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183546644
OOAT01027040
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183546138
OOAT01000252
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183546465
OOAT01003993
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183546630
OOAT01023324
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183546447
OOAT01003399
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183546048
OOAT01000072
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183546140
OOAT01000252
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183546418
OOAT01002517
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183546684
OOAT01035994
283367
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546245
OOAT01000578
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183546341
OOAT01001084
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183546379
OOAT01001581
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545998
OOAT01000044
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546196
OOAT01000394
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546435
OOAT01003090
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546522
OOAT01007437
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546618
OOAT01019953
280486
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183546511
OOAT01006532
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546214
OOAT01000483
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183546291
OOAT01000806
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183546339
OOAT01001075
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183546315
OOAT01000971
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183546430
OOAT01002934
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183546433
OOAT01003067
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183546564
OOAT01011739
280473
Bacillota
TGG
Pro
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK