This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
217 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180848922
ODKV01000009
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180848956
ODKV01000019
411629
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180848976
ODKV01000029
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180849008
ODKV01000042
19317
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849023
ODKV01000051
411543
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849061
ODKV01000060
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180849077
ODKV01000067
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180849091
ODKV01000072
263771
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180849128
ODKV01000087
97336
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180849129
ODKV01000087
59498
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180849146
ODKV01000106
341950
Bacteroidota
>WENV180849145
ODKV01000106
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180849179
ODKV01000125
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180849181
ODKV01000127
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180849180
ODKV01000127
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180849186
ODKV01000131
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180849189
ODKV01000134
412479
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180849195
ODKV01000137
155123
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180849253
ODKV01000183
128251
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV180849280
ODKV01000220
95618
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180849288
ODKV01000243
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180849320
ODKV01000277
146530
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV180849331
ODKV01000288
37076
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180849346
ODKV01000311
414426
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849361
ODKV01000331
17323
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849404
ODKV01000387
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180849403
ODKV01000387
19528
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849408
ODKV01000394
145504
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV180849418
ODKV01000400
144596
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180849422
ODKV01000406
144656
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180849426
ODKV01000411
46165
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180849427
ODKV01000411
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180849434
ODKV01000426
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849433
ODKV01000426
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849441
ODKV01000438
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849450
ODKV01000444
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849449
ODKV01000444
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849452
ODKV01000445
411629
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180849457
ODKV01000454
412479
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180849455
ODKV01000454
37076
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180849478
ODKV01000476
302002
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180849490
ODKV01000497
354570
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849489
ODKV01000497
354570
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849497
ODKV01000515
147147
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180849513
ODKV01000537
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180849553
ODKV01000590
151960
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180849576
ODKV01000664
150485
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180849583
ODKV01000690
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180849586
ODKV01000702
419272
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849590
ODKV01000708
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180849596
ODKV01000721
136207
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849600
ODKV01000733
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180849615
ODKV01000772
44852
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180849644
ODKV01000813
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849643
ODKV01000813
338164
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849648
ODKV01000820
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180849663
ODKV01000855
104003
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180849683
ODKV01000908
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180849685
ODKV01000914
193809
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849688
ODKV01000923
344769
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180849697
ODKV01000943
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849748
ODKV01001112
95559
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180849756
ODKV01001151
235207
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849765
ODKV01001199
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180849766
ODKV01001208
235203
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180849773
ODKV01001251
419272
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849777
ODKV01001285
412479
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180849791
ODKV01001313
338124
Bacteroidota
CCG
Arg
>WENV180849797
ODKV01001331
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180849798
ODKV01001331
19317
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849799
ODKV01001343
338125
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180849802
ODKV01001349
147147
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180849808
ODKV01001361
280513
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180849859
ODKV01001481
59498
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180849866
ODKV01001511
413663
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849865
ODKV01001511
413663
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180849873
ODKV01001542
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180849879
ODKV01001576
16220
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849882
ODKV01001588
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849884
ODKV01001619
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849887
ODKV01001630
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849901
ODKV01001684
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180849904
ODKV01001703
80614
Bacteroidota
>WENV180849918
ODKV01001767
20893
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180849928
ODKV01001783
80614
Bacteroidota
>WENV180849929
ODKV01001792
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180849932
ODKV01001794
95987
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180849937
ODKV01001815
412479
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180849948
ODKV01001859
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180849952
ODKV01001870
354570
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180849958
ODKV01001921
132360
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV180849990
ODKV01002180
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180849996
ODKV01002185
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180849995
ODKV01002185
23696
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV180850002
ODKV01002236
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180850003
ODKV01002250
95987
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180850021
ODKV01002367
353927
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180850026
ODKV01002409
151960
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180850034
ODKV01002462
341950
Bacteroidota
>WENV180850045
ODKV01002539
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180850050
ODKV01002561
97336
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180850054
ODKV01002603
344692
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180850060
ODKV01002675
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850079
ODKV01002825
136244
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180850104
ODKV01002958
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850109
ODKV01003003
16224
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180850130
ODKV01003156
413663
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180850139
ODKV01003195
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180850157
ODKV01003257
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180850158
ODKV01003257
144590
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180850174
ODKV01003365
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180850189
ODKV01003491
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180850194
ODKV01003520
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180850225
ODKV01003752
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180850239
ODKV01003783
235165
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180850247
ODKV01003957
338486
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850257
ODKV01004068
412236
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV180850262
ODKV01004093
23696
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV180850275
ODKV01004213
235102
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180850341
ODKV01004966
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180850344
ODKV01004981
412479
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180850369
ODKV01005197
144657
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180850388
ODKV01005361
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180850402
ODKV01005568
338132
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV180850436
ODKV01005963
136207
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180850449
ODKV01006120
37076
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180850483
ODKV01006480
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850484
ODKV01006507
95875
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV180850486
ODKV01006513
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850489
ODKV01006582
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850528
ODKV01007058
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180850543
ODKV01007327
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180850546
ODKV01007356
58715
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV180850544
ODKV01007356
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180850559
ODKV01007552
144657
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180850581
ODKV01008056
144695
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850589
ODKV01008170
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180850594
ODKV01008217
147148
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850604
ODKV01008454
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180850626
ODKV01008654
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850651
ODKV01009044
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850694
ODKV01010026
155123
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180850700
ODKV01010149
37076
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180850708
ODKV01010363
95987
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180850710
ODKV01010387
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180850713
ODKV01010392
97336
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180850743
ODKV01010864
415558
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180850775
ODKV01011577
154643
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850794
ODKV01012186
144695
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850805
ODKV01012405
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180850836
ODKV01013129
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180850847
ODKV01013481
413663
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180850853
ODKV01013648
193809
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180850862
ODKV01014010
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850882
ODKV01015065
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180850883
ODKV01015101
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180850907
ODKV01016105
144933
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180850926
ODKV01017114
343138
Bacteroidota
CCT
Arg
>WENV180850936
ODKV01017670
95987
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180850937
ODKV01017713
237796
Bacteroidota
CGT
Thr
>WENV180850979
ODKV01019022
425638
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180851000
ODKV01019660
243025
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180851014
ODKV01020320
240012
Bacteroidota
CCC
Gly
>WENV180851030
ODKV01021415
147147
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180851065
ODKV01023427
19528
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180851076
ODKV01024062
20893
Bacteroidota
GGA
Ser
>WENV180851078
ODKV01024146
344769
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180851080
ODKV01024423
144655
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180851082
ODKV01024609
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180851088
ODKV01024884
95987
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV180851114
ODKV01027310
185921
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180851151
ODKV01030358
46165
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180851157
ODKV01031129
235129
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180851163
ODKV01032070
415410
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180851179
ODKV01033191
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180851186
ODKV01033559
415558
Bacteroidota
TTG
Gln
>WENV180851202
ODKV01034910
411550
Bacteroidota
CTG
Gln
>WENV180851219
ODKV01035947
126966
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180851218
ODKV01035947
127277
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180851238
ODKV01039289
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180851275
ODKV01044286
239647
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180851285
ODKV01045065
154643
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180851302
ODKV01048423
59689
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180851338
ODKV01054906
238121
Bacteroidota
CTT
Lys
>WENV180851421
ODKV01069662
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180851457
ODKV01076278
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180851570
ODKV01108882
171336
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV180851578
ODKV01111748
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180851619
ODKV01124132
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180851623
ODKV01124554
144659
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180851645
ODKV01134300
193809
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV180851679
ODKV01147948
147439
Bacteroidota
TCT
Arg
>WENV180851700
ODKV01153530
280513
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180851745
ODKV01185757
153993
Bacteroidota
GAT
Ile
>WENV180851760
ODKV01196968
237797
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV180851847
ODKV01244361
97336
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180851862
ODKV01255809
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180851877
ODKV01263690
175704
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV180851960
ODKV01339993
301449
Bacteroidota
CGG
Pro
>WENV180851975
ODKV01341736
196394
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV180851977
ODKV01341805
136207
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180851978
ODKV01341838
59689
Bacteroidota
CAG
Leu
>WENV180851985
ODKV01342669
338165
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180851986
ODKV01342725
347866
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV180851992
ODKV01343681
80607
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV180851996
ODKV01344614
339341
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180852002
ODKV01349486
37076
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV180852004
ODKV01349753
52358
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV180852009
ODKV01350090
267954
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV180852015
ODKV01350638
235097
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV180852017
ODKV01350738
147147
Bacteroidota
GTG
His
>WENV180852024
ODKV01351071
339412
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV180852025
ODKV01351177
344769
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180852027
ODKV01351201
126641
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV180852034
ODKV01351298
155123
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV180852041
ODKV01351337
338155
Bacteroidota
CTC
Glu
>WENV180852048
ODKV01351583
344769
Bacteroidota
CTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK