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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
1
, Akira Muto
6
, Yo Kikuchi
1
, Hachiro Inokuchi
1
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
61 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV170296443
CESE01004303
117444
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV170296533
CESE01016027
117444
Bacteroidota
GTA
Tyr
>WENV170296667
CESE01034903
257688
Bacteroidota
>WENV170297103
CESE01100892
109317
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV170296573
CESE01021846
105453
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296834
CESE01054865
105453
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170297384
CESE01145623
105453
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296819
CESE01054358
213847
Bacteroidota
GTT
Asn
>WENV170296694
CESE01037698
258741
Bacteroidota
TCC
Gly
>WENV170296650
CESE01032125
184180
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170297262
CESE01131042
314601
Bacteroidota
>WENV170297113
CESE01105096
265680
Bacteroidota
>WENV170296417
CESE01001436
139505
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV170297630
CESE01255268
139505
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV170297123
CESE01107095
258742
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV170297273
CESE01132204
258742
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV170296497
CESE01011543
159104
Bacteroidota
>WENV170296730
CESE01044776
148074
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV170297312
CESE01138170
188934
Bacteroidota
>WENV170297217
CESE01124311
61365
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV170296947
CESE01070997
448470
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV170296747
CESE01047308
385890
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV170297274
CESE01133122
448301
Bacteroidota
>WENV170297209
CESE01121912
310696
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296671
CESE01035074
229004
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV170296906
CESE01065686
153255
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170297251
CESE01129798
153255
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296463
CESE01006884
138967
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296589
CESE01025631
138967
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296603
CESE01027222
138967
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296735
CESE01045083
51032
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV170296539
CESE01016736
119207
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296712
CESE01040904
119207
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170297319
CESE01139311
119207
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296982
CESE01078416
144149
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV170296566
CESE01020736
321470
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296571
CESE01021299
321470
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170297331
CESE01140376
321470
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170297314
CESE01138679
267059
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296445
CESE01004303
373542
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV170296535
CESE01016027
373542
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV170297170
CESE01115177
373542
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV170297422
CESE01148357
328225
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296416
CESE01001328
369841
Bacteroidota
>WENV170297005
CESE01081679
369841
Bacteroidota
>WENV170296972
CESE01076289
71400
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV170297256
CESE01130421
410435
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV170296429
CESE01002393
412268
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296530
CESE01015875
412268
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170297289
CESE01135155
160133
Bacteroidota
TCG
Arg
>WENV170296464
CESE01006924
310118
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV170296991
CESE01079348
114734
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV170296480
CESE01009136
259269
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV170296923
CESE01068433
111503
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV170296419
CESE01001474
158985
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296420
CESE01001534
158985
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296441
CESE01003684
158985
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170296965
CESE01075961
158985
Bacteroidota
GTC
Asp
>WENV170297235
CESE01127695
179763
Bacteroidota
GTG
His
>WENV170297616
CESE01250782
172819
Bacteroidota
>WENV170297644
CESE01260970
169560
Bacteroidota
GTG
His
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
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