This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
122 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180466486
OBYG01001136
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180466591
OBYG01002677
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180466904
OBYG01021710
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180467067
OBYG01063225
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180466099
OBYG01000112
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180466823
OBYG01012303
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180466771
OBYG01008589
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180467069
OBYG01064141
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180466572
OBYG01002411
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180467020
OBYG01047364
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180466891
OBYG01019142
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180466796
OBYG01010324
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180467005
OBYG01041902
10560
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180466532
OBYG01001679
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180467105
OBYG01094632
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180466205
OBYG01000208
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180466334
OBYG01000439
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180467082
OBYG01075420
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180466504
OBYG01001365
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180466986
OBYG01034912
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466527
OBYG01001637
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466674
OBYG01004406
359540
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466905
OBYG01021710
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180466488
OBYG01001136
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180466484
OBYG01001136
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180466738
OBYG01006995
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180467063
OBYG01059557
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180466623
OBYG01003486
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180466625
OBYG01003486
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180467026
OBYG01048812
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180466965
OBYG01029621
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180467096
OBYG01089745
391536
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180467037
OBYG01050720
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180466758
OBYG01008217
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180467090
OBYG01082720
16235
Bacillota
>WENV180466979
OBYG01032059
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180466803
OBYG01010595
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466748
OBYG01007442
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466337
OBYG01000468
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466282
OBYG01000328
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466237
OBYG01000227
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466152
OBYG01000157
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466067
OBYG01000091
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180465960
OBYG01000026
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180466913
OBYG01022704
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466420
OBYG01000789
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466271
OBYG01000303
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466197
OBYG01000205
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466191
OBYG01000202
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466149
OBYG01000157
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466369
OBYG01000568
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180466210
OBYG01000208
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180466641
OBYG01003688
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180466485
OBYG01001136
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180467051
OBYG01057297
444721
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180466487
OBYG01001136
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180467097
OBYG01089745
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV180467080
OBYG01073250
149041
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180466554
OBYG01002049
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180466567
OBYG01002322
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180466385
OBYG01000639
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180465966
OBYG01000029
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180466358
OBYG01000530
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV180466357
OBYG01000530
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV180466736
OBYG01006995
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466204
OBYG01000208
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180465910
OBYG01000002
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180465908
OBYG01000002
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180467062
OBYG01059557
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180466683
OBYG01004592
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180466043
OBYG01000067
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180465985
OBYG01000042
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180465962
OBYG01000026
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180465913
OBYG01000004
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180467030
OBYG01049208
411585
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180467121
OBYG01095806
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466931
OBYG01024975
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466890
OBYG01019142
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466800
OBYG01010582
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466215
OBYG01000208
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466160
OBYG01000163
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180466566
OBYG01002322
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180466462
OBYG01000973
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180466377
OBYG01000594
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180466370
OBYG01000568
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180466332
OBYG01000439
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180466505
OBYG01001365
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180467053
OBYG01057297
193665
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180466386
OBYG01000639
10680
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180466757
OBYG01008080
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180466010
OBYG01000060
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180466008
OBYG01000060
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180466808
OBYG01011007
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180466410
OBYG01000719
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180466038
OBYG01000066
314670
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466681
OBYG01004539
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180466592
OBYG01002677
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180467122
OBYG01095873
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180466863
OBYG01015272
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180467028
OBYG01049208
144767
Bacillota
GTG
His
>WENV180466865
OBYG01015394
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180466627
OBYG01003486
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466710
OBYG01006042
256380
Bacillota
>WENV180466797
OBYG01010324
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180467027
OBYG01049208
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180466583
OBYG01002565
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180466474
OBYG01001077
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180466575
OBYG01002470
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180466642
OBYG01003725
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466555
OBYG01002049
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180466509
OBYG01001409
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180466684
OBYG01004606
21693
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180466501
OBYG01001314
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180466636
OBYG01003597
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180466930
OBYG01024975
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180466508
OBYG01001407
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180466214
OBYG01000208
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180466159
OBYG01000163
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180466582
OBYG01002538
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180466418
OBYG01000774
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180466495
OBYG01001188
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180466610
OBYG01003230
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK