tRNA genes clustered and arranged according to each identical group

HIT: 1 Group(s).
Download Sequence Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No. Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species Start End Direction AA Anticodon Genome/Seq. Info. Decision
Identical group No.12283 (95 seq.)
>WENV180045101 MOXS02079712 [MOXS] marine metagenome; 60 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 231 320 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180045911 MPLT02031414 [MPLT] marine metagenome; 70 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 1010 921 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180047456 MPLT02223396 [MPLT] marine metagenome; 70 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 1091 1002 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180052556 MPLU02307882 [MPLU] marine metagenome; 90 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 5 94 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180053866 MPLV02050203 [MPLV] marine metagenome; 100 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 248 337 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180057293 MPLW02093724 [MPLW] marine metagenome; 110 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 168 257 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180063113 MPLX02332102 [MPLX] marine metagenome; 120 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 22224 22313 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180065872 MPLY02093076 [MPLY] marine metagenome; 140 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 853 764 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180068772 MPLZ02067103 [MPLZ] marine metagenome; 160 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 164 253 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180073490 MPMA02084343 [MPMA] marine metagenome; 180 m water sample filtered on 0.2 um supor filter 1406 1317 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180091115 MPMF02175764 [MPMF] marine metagenome; 120 m water sample prefiltered with 30 um filter, filtered on to 0.2 um supor filter 128607 128518 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180111904 OAPO01013431 [OAPO] marine metagenome; ENVO:00002010 276 187 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180386881 OBPD01011216 [OBPD] marine metagenome; Sea Water 416 327 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV180689251 OCZA010680043 [OCZA] marine metagenome; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 58 147 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV182565003 OJEF01025985 [OJEF] seawater metagenome; Sea water 133 222 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV183629791 OOGQ01009266 [OOGQ] marine metagenome; seawater 535 446 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170113279 CENF01053885 [CENF] marine metagenome genome assembly TARA_004_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 312 403 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170125772 CENP01066816 [CENP] marine metagenome genome assembly TARA_030_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 606 697 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170139926 CENX01042489 [CENX] marine metagenome genome assembly TARA_018_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1823 1914 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170143642 CENY01085779 [CENY] marine metagenome genome assembly TARA_032_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 244 153 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170159351 CEOK01058428 [CEOK] marine metagenome genome assembly TARA_030_SRF_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 604 695 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170174994 CEOQ01418021 [CEOQ] marine metagenome genome assembly TARA_034_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 597 688 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170181302 CEOW01262714 [CEOW] marine metagenome genome assembly TARA_058_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1247 1338 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170184597 CEOZ01117210 [CEOZ] marine metagenome genome assembly TARA_064_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2798 2707 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170190796 CEPC01150057 [CEPC] marine metagenome genome assembly TARA_064_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 3024 2933 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170197915 CEPK01178390 [CEPK] marine metagenome genome assembly TARA_042_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1675 1766 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170228243 CEQF01254173 [CEQF] marine metagenome genome assembly TARA_068_MES_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1022 1113 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170238711 CEQM01225400 [CEQM] marine metagenome genome assembly TARA_078_DCM_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 670 761 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170239986 CEQN01084589 [CEQN] marine metagenome genome assembly TARA_078_DCM_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 126 35 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170246763 CEQP01312031 [CEQP] marine metagenome genome assembly TARA_076_DCM_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 904 813 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170248868 CEQQ01229551 [CEQQ] marine metagenome genome assembly TARA_076_DCM_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 432 341 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170253395 CEQU01082465 [CEQU] marine metagenome genome assembly TARA_076_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1461 1552 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170255822 CEQX01026612 [CEQX] marine metagenome genome assembly TARA_070_SRF_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 333 424 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170260100 CEQY01388972 [CEQY] marine metagenome genome assembly TARA_070_SRF_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 493 402 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170263958 CERC01125617 [CERC] marine metagenome genome assembly TARA_070_MES_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 827 918 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170268578 CERG01097359 [CERG] marine metagenome genome assembly TARA_068_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 163 72 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170271129 CERI01255517 [CERI] marine metagenome genome assembly TARA_067_SRF_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 261 352 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170272445 CERK01099141 [CERK] marine metagenome genome assembly TARA_066_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 104 13 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170273901 CERL01190543 [CERL] marine metagenome genome assembly TARA_068_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 93 2 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170280689 CERR01222453 [CERR] marine metagenome genome assembly TARA_068_SRF_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 93 2 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170281219 CERS01029244 [CERS] marine metagenome genome assembly TARA_068_SRF_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 775 866 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170284374 CERV01041897 [CERV] marine metagenome genome assembly TARA_068_DCM_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 244 153 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170288441 CERX01094651 [CERX] marine metagenome genome assembly TARA_068_DCM_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2190 2099 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170295042 CESD01014358 [CESD] marine metagenome genome assembly TARA_098_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 775 866 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170308237 CESL01012392 [CESL] marine metagenome genome assembly TARA_102_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 304 213 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170312065 CESM01217202 [CESM] marine metagenome genome assembly TARA_102_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 725 634 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170317939 CESQ01000474 [CESQ] marine metagenome genome assembly TARA_100_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 890 981 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170320773 CESR01010183 [CESR] marine metagenome genome assembly TARA_100_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1454 1363 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170332053 CESW01126303 [CESW] marine metagenome genome assembly TARA_096_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 543 452 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170333223 CESY01017935 [CESY] marine metagenome genome assembly TARA_098_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 259 168 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170338171 CETB01009717 [CETB] marine metagenome genome assembly TARA_112_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 120 211 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170343285 CETD01365903 [CETD] marine metagenome genome assembly TARA_110_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1751 1660 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170349607 CETH01032710 [CETH] marine metagenome genome assembly TARA_122_DCM_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1595 1504 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170353646 CETI01036390 [CETI] marine metagenome genome assembly TARA_111_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2180 2089 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170364027 CETM01199360 [CETM] marine metagenome genome assembly TARA_122_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 851 942 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170373049 CETS01159401 [CETS] marine metagenome genome assembly TARA_122_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 5808 5899 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170374150 CETT01055321 [CETT] marine metagenome genome assembly TARA_110_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 365 274 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170377255 CETU01145020 [CETU] marine metagenome genome assembly TARA_142_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 376 285 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170378434 CETV01021215 [CETV] marine metagenome genome assembly TARA_133_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2330 2421 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170382219 CETX01003239 [CETX] marine metagenome genome assembly TARA_138_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1997 2088 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV020896 AACY020560301 Marine microbial communities from Global Ocean Sampling (GOS) 807 898 + Ser GGA [ENA]
>WENV170396568 CEUC01314823 [CEUC] marine metagenome genome assembly TARA_137_DCM_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 542 451 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170396987 CEUD01015041 [CEUD] marine metagenome genome assembly TARA_137_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2382 2291 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170415591 CEUL01052193 [CEUL] marine metagenome genome assembly TARA_124_MIX_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1713 1622 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170428612 CEUQ01479339 [CEUQ] marine metagenome genome assembly TARA_124_MIX_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 796 887 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170434376 CEUS01256584 [CEUS] marine metagenome genome assembly TARA_125_MIX_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 434 525 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170446990 CEUY01185176 [CEUY] marine metagenome genome assembly TARA_123_MIX_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 3948 3857 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170453619 CEUZ01503445 [CEUZ] marine metagenome genome assembly TARA_125_SRF_0.22-0.45 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1593 1502 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170463235 CEVD01123630 [CEVD] marine metagenome genome assembly TARA_123_MIX_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 3397 3306 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170476746 CEVI01190840 [CEVI] marine metagenome genome assembly TARA_142_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 739 648 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170481112 CEVL01166078 [CEVL] marine metagenome genome assembly TARA_146_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 33 124 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170486552 CEVN01309821 [CEVN] marine metagenome genome assembly TARA_142_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 174 83 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170487194 CEVO01033707 [CEVO] marine metagenome genome assembly TARA_152_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2795 2704 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170492400 CEVQ01136287 [CEVQ] marine metagenome genome assembly TARA_148b_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2933 2842 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170494052 CEVR01050070 [CEVR] marine metagenome genome assembly TARA_148_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 439 530 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170506514 CEVW01248737 [CEVW] marine metagenome genome assembly TARA_149_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 95 4 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170507668 CEVX01075023 [CEVX] marine metagenome genome assembly TARA_152_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 135 226 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170509272 CEVY01015855 [CEVY] marine metagenome genome assembly TARA_065_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1463 1372 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170511748 CEVZ01116159 [CEVZ] marine metagenome genome assembly TARA_041_DCM_0.22-1.6 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 4051 4142 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170515737 CEWB01048966 [CEWB] marine metagenome genome assembly TARA_068_SRF_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 1469 1378 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170526951 CEWI01092055 [CEWI] marine metagenome genome assembly TARA_111_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 270 179 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170535310 CEWP01044529 [CEWP] marine metagenome genome assembly TARA_067_SRF_0.45-0.8 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 729 820 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170537682 CEWR01021824 [CEWR] marine metagenome genome assembly TARA_085_MES_0.22-3 ,contig; saline water (ENVO:00002010), including plankton (ENVO:xxxxxxxx) 2651 2560 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170618457 FUWD012969540 [FUWD] metagenome; unknown 181 90 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170741666 LULT01000885 [LULT] marine metagenome; Red Sea water column Station 108 - depth 100m 181 90 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170753886 LUMK01013656 [LUMK] marine metagenome; Red Sea water column Station 22 - depth 200m 122 31 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170765066 LWDU01034851 [LWDU] hydrothermal vent metagenome; deep sea hydrothermal plume seawater 85571 85480 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170823420 MDSY01057335 [MDSY] marine metagenome; seawater 5 96 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170831532 MDSZ01045924 [MDSZ] marine metagenome; seawater 856 765 - Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170859594 MDTB01038380 [MDTB] marine metagenome; seawater 12767 12858 + Ser GGA [ENA] ¡û
>WENV170876349 MDTC01038472 [MDTC] marine metagenome; seawater 1795 1704 - Ser GGA [ENA] ¡û
>SRA1007897 SRR020490.114211 Microbial community gene content and expression in the Central North Pacific Gyre, Station ALOHA, HOT186 (SRP001041) 176 85 - Ser GGA [SRA]
>SRA1008754 SRR020491.15535 Microbial community gene content and expression in the Central North Pacific Gyre, Station ALOHA, HOT186 (SRP001041) 102 11 - Ser GGA [SRA]
>WENV055549 AACY023231177 Marine microbial communities from Global Ocean Sampling (GOS) 1316 1407 + Ser GGA [ENA]
>WENV076705 AACY024107273 Marine microbial communities from Global Ocean Sampling (GOS) 130 221 + Ser GGA [ENA]
Select
Sequence ID Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species Start End Direction AA Anticodon Genome/Seq. Info. Decision
Download Sequence Representative sequence of each cluster
View ClustalW result

BACK