This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
103 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183519055
OMNT01000089
281593
Bacillota
CAT
Met
>WENV183520158
OMNT01006385
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183520211
OMNT01007253
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183520595
OMNT01029588
176033
Bacillota
CAT
Met
>WENV183520663
OMNT01039676
280870
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183520674
OMNT01040366
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183520770
OMNT01063725
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519106
OMNT01000128
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519333
OMNT01000417
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519483
OMNT01000852
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519934
OMNT01003289
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519657
OMNT01001509
180107
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183520219
OMNT01007353
480359
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183519827
OMNT01002417
281017
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519127
OMNT01000137
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183519444
OMNT01000768
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183520785
OMNT01065931
280642
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183519836
OMNT01002472
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183519965
OMNT01003673
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183520786
OMNT01065931
280639
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183520148
OMNT01006242
29930
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183519515
OMNT01000938
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183520163
OMNT01006520
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183520183
OMNT01006900
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183520457
OMNT01017099
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183519946
OMNT01003410
20274
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183520168
OMNT01006601
20360
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183520201
OMNT01007088
281015
Bacillota
GTG
His
>WENV183519671
OMNT01001546
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183520250
OMNT01008291
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183520385
OMNT01012858
179176
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183520117
OMNT01005788
184687
Bacillota
CAT
Met
>WENV183520690
OMNT01042391
295166
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183520198
OMNT01007088
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183519828
OMNT01002422
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183520784
OMNT01065931
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183519016
OMNT01000055
73664
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183519743
OMNT01001915
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183519819
OMNT01002381
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183520245
OMNT01008212
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183519866
OMNT01002717
284723
Bacillota
TAC
Val
>WENV183520157
OMNT01006385
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183520186
OMNT01006972
481217
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183520203
OMNT01007088
283502
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183520739
OMNT01054273
280646
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183520458
OMNT01017117
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183519579
OMNT01001174
407840
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183520191
OMNT01006999
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183519735
OMNT01001862
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183520090
OMNT01005214
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183519896
OMNT01003123
290325
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183519968
OMNT01003697
21311
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183519852
OMNT01002583
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183520631
OMNT01035180
189679
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183520220
OMNT01007366
399041
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183518888
OMNT01000008
294020
Bacillota
TAC
Val
>WENV183519604
OMNT01001266
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183520190
OMNT01006999
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183520197
OMNT01007087
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183520415
OMNT01014509
399272
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183520266
OMNT01008836
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183520392
OMNT01013279
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183520588
OMNT01029588
119278
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183519972
OMNT01003739
120584
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183520391
OMNT01013279
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183520265
OMNT01008836
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183519781
OMNT01002119
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183520543
OMNT01024301
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183519621
OMNT01001330
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183520827
OMNT01079784
180688
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183519362
OMNT01000481
175899
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183519014
OMNT01000055
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183519015
OMNT01000055
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183519978
OMNT01003778
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183520200
OMNT01007088
182384
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183519918
OMNT01003208
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183519071
OMNT01000105
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183520758
OMNT01060574
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183519350
OMNT01000465
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183520277
OMNT01009167
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183519894
OMNT01003077
58120
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183519489
OMNT01000872
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183519867
OMNT01002717
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183519829
OMNT01002422
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183520254
OMNT01008420
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183519478
OMNT01000839
282755
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183519310
OMNT01000373
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183519138
OMNT01000143
280462
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183519058
OMNT01000091
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183519072
OMNT01000105
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183519554
OMNT01001060
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183520610
OMNT01032023
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183518989
OMNT01000038
280483
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183520647
OMNT01037436
285601
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183519008
OMNT01000052
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183520783
OMNT01065931
141617
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183520308
OMNT01010150
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183520825
OMNT01079784
285556
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183520757
OMNT01060574
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183520890
OMNT01101622
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183519818
OMNT01002381
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183520244
OMNT01008212
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183520058
OMNT01004837
280473
Bacillota
TGG
Pro
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK