This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
82 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183545146
OOAQ01000595
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183545147
OOAQ01000595
56079
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183545096
OOAQ01000422
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183545179
OOAQ01000766
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183545081
OOAQ01000355
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183545099
OOAQ01000428
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183545069
OOAQ01000338
179917
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545802
OOAQ01039747
176018
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545330
OOAQ01001955
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545772
OOAQ01030521
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545180
OOAQ01000768
291629
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183545841
OOAQ01052906
497729
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183545484
OOAQ01004751
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183545879
OOAQ01069440
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183545098
OOAQ01000423
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183545206
OOAQ01000876
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183545600
OOAQ01009255
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183544999
OOAQ01000163
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545232
OOAQ01000990
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545378
OOAQ01002409
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545486
OOAQ01004800
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545097
OOAQ01000423
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545113
OOAQ01000480
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545205
OOAQ01000876
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545369
OOAQ01002308
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545374
OOAQ01002390
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545091
OOAQ01000416
280492
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183545413
OOAQ01003125
284627
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545351
OOAQ01002109
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545214
OOAQ01000902
280462
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545221
OOAQ01000935
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545301
OOAQ01001615
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545402
OOAQ01002885
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545845
OOAQ01054491
189473
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545755
OOAQ01026643
175916
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545648
OOAQ01012687
186051
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545663
OOAQ01014027
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545434
OOAQ01003492
405363
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545777
OOAQ01031696
481217
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545893
OOAQ01076293
343590
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545075
OOAQ01000345
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545631
OOAQ01011326
456201
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545122
OOAQ01000486
321753
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545453
OOAQ01003856
285756
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545048
OOAQ01000296
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545072
OOAQ01000340
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183545487
OOAQ01004807
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183545651
OOAQ01013041
184497
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183545196
OOAQ01000841
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545336
OOAQ01002023
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545547
OOAQ01006863
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545340
OOAQ01002037
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545435
OOAQ01003492
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545446
OOAQ01003761
120584
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183544927
OOAQ01000032
117745
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545666
OOAQ01014053
118669
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545350
OOAQ01002109
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545739
OOAQ01023573
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545335
OOAQ01002023
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545593
OOAQ01009030
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV183545548
OOAQ01006901
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183545735
OOAQ01022686
46835
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183545450
OOAQ01003856
290391
Bacillota
TAC
Val
>WENV183545432
OOAQ01003459
510477
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183544982
OOAQ01000124
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183545305
OOAQ01001674
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183545071
OOAQ01000340
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183545756
OOAQ01026643
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545623
OOAQ01010804
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545653
OOAQ01013236
295350
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545804
OOAQ01039747
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545502
OOAQ01005071
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545656
OOAQ01013529
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545337
OOAQ01002037
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545105
OOAQ01000461
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545692
OOAQ01016195
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545286
OOAQ01001546
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545365
OOAQ01002253
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183545773
OOAQ01030521
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183545594
OOAQ01009030
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183545207
OOAQ01000876
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183545258
OOAQ01001271
346451
Bacillota
TTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK