This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
79 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183546798
OOAU01000047
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546804
OOAU01000052
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546805
OOAU01000052
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546806
OOAU01000052
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546807
OOAU01000052
291629
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183546808
OOAU01000052
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546809
OOAU01000052
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546810
OOAU01000052
405393
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546847
OOAU01000084
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183546875
OOAU01000122
312274
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183546893
OOAU01000160
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546903
OOAU01000189
346451
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183546916
OOAU01000237
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546939
OOAU01000307
186123
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546940
OOAU01000307
291634
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546952
OOAU01000355
287289
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546963
OOAU01000372
321753
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546999
OOAU01000558
303718
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183547022
OOAU01000670
480322
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183547033
OOAU01000730
510477
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183547064
OOAU01000912
228119
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547066
OOAU01000912
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547067
OOAU01000916
280447
Bacillota
GAC
Val
>WENV183547074
OOAU01000931
228119
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547088
OOAU01000988
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547090
OOAU01000993
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183547103
OOAU01001056
332181
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183547106
OOAU01001056
289123
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547117
OOAU01001164
480324
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183547146
OOAU01001478
280436
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547147
OOAU01001478
175825
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547156
OOAU01001548
190476
Bacillota
CAT
Met
>WENV183547157
OOAU01001548
398832
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183547177
OOAU01002144
201856
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547178
OOAU01002144
292374
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547187
OOAU01002186
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183547223
OOAU01002950
175842
Bacillota
CAC
Val
>WENV183547232
OOAU01003282
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547233
OOAU01003292
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547238
OOAU01003707
280473
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183547240
OOAU01003812
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547246
OOAU01004068
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547271
OOAU01004673
291581
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183547294
OOAU01005404
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547310
OOAU01006426
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547311
OOAU01006426
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV183547313
OOAU01006426
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183547334
OOAU01008071
291576
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183547338
OOAU01008437
175911
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547344
OOAU01008751
56074
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183547345
OOAU01008751
5692
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183547346
OOAU01008953
215243
Bacillota
CAT
Met
>WENV183547347
OOAU01008953
460732
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183547352
OOAU01009525
280428
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183547353
OOAU01009525
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547356
OOAU01009644
175916
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547357
OOAU01009644
280500
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547378
OOAU01012263
73009
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547382
OOAU01012280
175857
Bacillota
GTG
His
>WENV183547383
OOAU01012280
401685
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183547387
OOAU01012495
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547388
OOAU01012495
280444
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547390
OOAU01012826
179755
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183547394
OOAU01014061
291597
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547417
OOAU01016648
398854
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547418
OOAU01016648
175868
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183547440
OOAU01020461
175859
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547449
OOAU01022504
175915
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547476
OOAU01027220
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547477
OOAU01027220
280466
Bacillota
TAC
Val
>WENV183547485
OOAU01029978
280476
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547492
OOAU01031454
398852
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547501
OOAU01034750
175831
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183547502
OOAU01034756
398833
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183547503
OOAU01034756
99852
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183547506
OOAU01035511
194260
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547509
OOAU01035773
175849
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547510
OOAU01035773
349107
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547511
OOAU01035773
405363
Bacillota
GCA
Cys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK