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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA genes clustered and arranged according to each identical group
Plant
Anticodon = TGA
HIT:
10 Group(s).
Download Sequence
Representative sequence of each cluster
View ClustalW result
Sort by Identical group No.
Sort by the number of tRNAs in the Identical group
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
Identical group No.31081 (205 seq.)
>WENV170659480
JXWR01006722
[JXWR] soil metagenome; rice field; ambient CO2
3310
3397
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>CHL1810000270
AM777385
Viridiplantae
Lolium perenne (AM777385)
11456
11369
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810001286
EU325680
Viridiplantae
Brachypodium distachyon (EU325680)
11273
11186
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810001667
FJ261955
Viridiplantae
Coix lacryma-jobi (FJ261955)
12121
12034
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810001688
FJ466687
Viridiplantae
Festuca arundinacea (FJ466687)
11425
11338
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810001992
FJ970915
Viridiplantae
Bambusa oldhamii (FJ970915)
11654
11567
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810002021
FJ970916
Viridiplantae
Dendrocalamus latiflorus (FJ970916)
11684
11597
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810002302
GQ329703
Viridiplantae
Anomochloa marantoidea (GQ329703)
12016
11929
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810002791
HF543599
Viridiplantae
Lecomtella madagascariensis (HF543599)
11897
11810
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810003851
HQ337797
Viridiplantae
Bambusa emeiensis (HQ337797)
11673
11586
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810004482
JN005831
Viridiplantae
Oryza meridionalis (JN005831)
11595
11508
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810004511
JN005832
Viridiplantae
Oryza rufipogon (JN005832)
11593
11506
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810004678
JN032131
Viridiplantae
Pharus latifolius (JN032131)
12227
12140
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810005468
JQ740834
Viridiplantae
Aegilops speltoides (JQ740834)
11322
11235
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810005517
JQ754651
Viridiplantae
Aegilops tauschii (JQ754651)
11375
11288
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810007918
KC311467
Viridiplantae
Pharus lappulaceus (KC311467)
12218
12131
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810008455
KC534841
Viridiplantae
Puelia olyriformis (KC534841)
12140
12053
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009348
KC912690
Viridiplantae
Triticum monococcum (KC912690)
11357
11270
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009371
KC912691
Viridiplantae
Secale cereale (KC912691)
11369
11282
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009394
KC912693
Viridiplantae
Triticum urartu (KC912693)
11338
11251
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009916
KF356392
Viridiplantae
Neyraudia reynaudiana (KF356392)
11752
11665
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009945
KF359911
Viridiplantae
Oryza rhizomatis (KF359911)
11679
11592
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810009974
KF359912
Viridiplantae
Oryza eichingeri (KF359912)
11678
11591
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010003
KF359913
Viridiplantae
Oryza alta (KF359913)
11678
11591
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010032
KF359914
Viridiplantae
Oryza grandiglumis (KF359914)
11679
11592
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010061
KF359915
Viridiplantae
Oryza latifolia (KF359915)
11675
11588
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010148
KF359921
Viridiplantae
Oryza meyeriana (KF359921)
11604
11517
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010177
KF359922
Viridiplantae
Leersia japonica (KF359922)
11113
11026
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010422
KF534489
Viridiplantae
Aegilops cylindrica (KF534489)
11337
11250
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010445
KF534490
Viridiplantae
Aegilops geniculata (KF534490)
11329
11242
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810010613
KF730315
Viridiplantae
Phragmites australis (KF730315)
11966
11879
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810011245
KF998272
Viridiplantae
Sorghum timorense (KF998272)
12353
12266
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012150
KJ614397
Viridiplantae
Triticum turgidum (KJ614397)
11277
11190
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012179
KJ614410
Viridiplantae
Triticum timopheevii (KJ614410)
11316
11229
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012208
KJ614414
Viridiplantae
Aegilops searsii (KJ614414)
11346
11259
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012237
KJ614416
Viridiplantae
Aegilops longissima (KJ614416)
11350
11263
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012266
KJ614418
Viridiplantae
Aegilops bicornis (KJ614418)
11353
11266
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012295
KJ614419
Viridiplantae
Aegilops sharonensis (KJ614419)
11352
11265
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012324
KJ614420
Viridiplantae
Aegilops kotschyi (KJ614420)
11352
11265
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810012687
KJ722536
Viridiplantae
Bambusa multiplex (KJ722536)
11658
11571
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810013287
KJ819549
Viridiplantae
Sartidia perrieri (KJ819549)
11421
11334
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810013316
KJ819550
Viridiplantae
Sartidia dewinteri (KJ819550)
11477
11390
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810013345
KJ830774
Viridiplantae
Oryza australiensis (KJ830774)
11611
11524
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810014093
KM103369
Viridiplantae
Oryza sativa (KM103369)
11529
11442
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810014122
KM103375
Viridiplantae
Oryza punctata (KM103375)
11179
11092
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810015945
KM881634
Viridiplantae
Oryza barthii (KM881634)
11600
11513
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810015974
KM881640
Viridiplantae
Oryza glumipatula (KM881640)
11587
11500
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810016003
KM881641
Viridiplantae
Oryza longistaminata (KM881641)
11587
11500
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810016032
KM881643
Viridiplantae
Oryza officinalis (KM881643)
11679
11592
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810018557
KR078265
Viridiplantae
Chikusichloa aquatica (KR078265)
11549
11462
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810018698
KR232941
Viridiplantae
Urochloa decumbens (KR232941)
11303
11216
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810018727
KR232942
Viridiplantae
Urochloa brizantha (KR232942)
11248
11161
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810018756
KR232943
Viridiplantae
Urochloa ruziziensis (KR232943)
11225
11138
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810018784
KR232944
Viridiplantae
Urochloa humidicola (KR232944)
11344
11257
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810019437
KR822687
Viridiplantae
Miscanthus sacchariflorus (KR822687)
12141
12054
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810019466
KR822688
Viridiplantae
Miscanthus sinensis (KR822688)
12142
12055
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810021978
KT692644
Viridiplantae
Stipa lipskyi (KT692644)
102602
102515
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810024011
KT983629
Viridiplantae
Stipa purpurea (KT983629)
11397
11310
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810024068
KT992850
Viridiplantae
Oryza brachyantha (KT992850)
11488
11401
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810024436
KU179220
Viridiplantae
Oryza minuta (KU179220)
11478
11391
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810024858
KU214867
Viridiplantae
Saccharum hybrid cultivar (KU214867)
12097
12010
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025001
KU291466
Viridiplantae
Imperata cylindrica (KU291466)
12222
12135
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025030
KU291467
Viridiplantae
Ischaemum afrum (KU291467)
12132
12045
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025059
KU291468
Viridiplantae
Iseilema macratherum (KU291468)
11555
11468
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025088
KU291469
Viridiplantae
Loudetiopsis kerstingii (KU291469)
11687
11600
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025117
KU291470
Viridiplantae
Megathyrsus maximus (KU291470)
11849
11762
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025146
KU291471
Viridiplantae
Arthraxon prionodes (KU291471)
12197
12110
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025233
KU291474
Viridiplantae
Otachyrium versicolor (KU291474)
11724
11637
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025320
KU291477
Viridiplantae
Paspalum dilatatum (KU291477)
12110
12023
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025378
KU291479
Viridiplantae
Paspalum glaziovii (KU291479)
11717
11630
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025407
KU291480
Viridiplantae
Plagiantha tenella (KU291480)
11679
11592
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025436
KU291481
Viridiplantae
Rottboellia cochinchinensis (KU291481)
12006
11919
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025552
KU291486
Viridiplantae
Urochloa reptans (KU291486)
11844
11757
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025668
KU291490
Viridiplantae
Arundinella deppeana (KU291490)
11794
11707
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025697
KU291491
Viridiplantae
Axonopus fissifolius (KU291491)
11484
11397
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025726
KU291492
Viridiplantae
Bothriochloa alta (KU291492)
10972
10885
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025755
KU291493
Viridiplantae
Capillipedium venustum (KU291493)
11513
11426
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025784
KU291495
Viridiplantae
Danthoniopsis dinteri (KU291495)
11753
11666
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025842
KU291498
Viridiplantae
Eriochloa meyeriana (KU291498)
11874
11787
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025871
KU291499
Viridiplantae
Eulalia aurea (KU291499)
11804
11717
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810025900
KU291500
Viridiplantae
Hyparrhenia subplumosa (KU291500)
11825
11738
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810027151
KU666544
Viridiplantae
Streptochaeta spicata (KU666544)
12342
12255
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810027180
KU666545
Viridiplantae
Leptaspis banksii (KU666545)
12305
12218
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810027209
KU666546
Viridiplantae
Leptaspis zeylanica (KU666546)
11762
11675
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810028318
KU961859
Viridiplantae
Pogonatherum paniceum (KU961859)
11864
11777
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810028347
KU961862
Viridiplantae
Eriochrysis cf. cayennensis 365-2 (KU961862)
11893
11806
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810028376
KU961863
Viridiplantae
Eriochrysis laxa (KU961863)
11893
11806
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810028405
KU961864
Viridiplantae
Chrysopogon serrulatus (KU961864)
12071
11984
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810030923
KX109945
Viridiplantae
Arundo donax (KX109945)
11824
11737
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810030952
KX109946
Viridiplantae
Arundo plinii (KX109946)
11834
11747
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810031039
KX139746
Viridiplantae
Saccharum spontaneum (KX139746)
12092
12005
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810035191
KX756180
Viridiplantae
Avena sterilis (KX756180)
11328
11241
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810041906
KY432778
Viridiplantae
Gastridium ventricosum (KY432778)
11301
11214
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810041935
KY432779
Viridiplantae
Gynerium sagittatum (KY432779)
11724
11637
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810041993
KY432781
Viridiplantae
Holcus lanatus (KY432781)
11323
11236
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042020
KY432782
Viridiplantae
Homolepis isocalycia (KY432782)
11744
11657
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042281
KY432791
Viridiplantae
Piptatherum songaricum (KY432791)
11314
11227
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042483
KY432799
Viridiplantae
Tricholaena monachne (KY432799)
11799
11712
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042541
KY432801
Viridiplantae
Tristachya leucothrix (KY432801)
11723
11636
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042628
KY432804
Viridiplantae
Catapodium rigidum (KY432804)
10947
10860
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042657
KY432805
Viridiplantae
Chaetium bromoides (KY432805)
11566
11479
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042686
KY432806
Viridiplantae
Cynosurus cristatus (KY432806)
11129
11042
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042773
KY432809
Viridiplantae
Eremochloa ophiuroides (KY432809)
11556
11469
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042830
KY432812
Viridiplantae
Streptogyna americana (KY432812)
11415
11328
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043248
KY596117
Viridiplantae
Kerriochloa siamensis (KY596117)
12134
12047
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043277
KY596118
Viridiplantae
Andropogon fastigiatus (KY596118)
11308
11221
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043306
KY596119
Viridiplantae
Hyparrhenia rufa (KY596119)
11882
11795
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043335
KY596121
Viridiplantae
Andropogon chinensis (KY596121)
11327
11240
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043364
KY596122
Viridiplantae
Schizachyrium brevifolium (KY596122)
11135
11048
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043393
KY596123
Viridiplantae
Themeda arundinacea (KY596123)
11450
11363
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043422
KY596124
Viridiplantae
Schizachyrium sanguineum (KY596124)
11969
11882
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043451
KY596125
Viridiplantae
Themeda triandra (KY596125)
11561
11474
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043480
KY596127
Viridiplantae
Arthraxon lanceolatus (KY596127)
12119
12032
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043509
KY596128
Viridiplantae
Dichanthium sericeum (KY596128)
11574
11487
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043538
KY596129
Viridiplantae
Themeda arguens (KY596129)
11514
11427
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043567
KY596130
Viridiplantae
Dimeria ornithopoda (KY596130)
11539
11452
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043596
KY596131
Viridiplantae
Themeda villosa (KY596131)
11450
11363
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043625
KY596132
Viridiplantae
Hemisorghum mekongense (KY596132)
12094
12007
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043654
KY596134
Viridiplantae
Eremochloa eriopoda (KY596134)
11615
11528
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043712
KY596142
Viridiplantae
Heteropogon triticeus (KY596142)
11994
11907
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043741
KY596143
Viridiplantae
Eulalia contorta (KY596143)
12109
12022
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043770
KY596145
Viridiplantae
Heteropogon contortus (KY596145)
11525
11438
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043799
KY596146
Viridiplantae
Eremochloa ciliaris (KY596146)
11573
11486
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043828
KY596147
Viridiplantae
Schizachyrium exile (KY596147)
11164
11077
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043857
KY596148
Viridiplantae
Andropogon abyssinicus (KY596148)
11739
11652
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043886
KY596149
Viridiplantae
Eulalia siamensis (KY596149)
12081
11994
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043915
KY596154
Viridiplantae
Schizachyrium scoparium (KY596154)
11969
11882
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043944
KY596155
Viridiplantae
Parahyparrhenia siamensis (KY596155)
11953
11866
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810043973
KY596158
Viridiplantae
Chrysopogon zizanioides (KY596158)
11293
11206
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044002
KY596161
Viridiplantae
Chrysopogon gryllus (KY596161)
11290
11203
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044060
KY596163
Viridiplantae
Hyparrhenia diplandra (KY596163)
11927
11840
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044089
KY596164
Viridiplantae
Andropogon burmanicus (KY596164)
11994
11907
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044118
KY596166
Viridiplantae
Schizachyrium spicatum (KY596166)
11963
11876
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044147
KY596169
Viridiplantae
Cymbopogon flexuosus (KY596169)
11950
11863
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044176
KY596170
Viridiplantae
Andropogon distachyos (KY596170)
11757
11670
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044205
KY596171
Viridiplantae
Garnotia thailandica (KY596171)
11792
11705
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044234
KY596172
Viridiplantae
Schizachyrium tenerum (KY596172)
11917
11830
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044263
KY596173
Viridiplantae
Polytoca digitata (KY596173)
12042
11955
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044292
KY596174
Viridiplantae
Schizachyrium imberbe (KY596174)
11598
11511
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044321
KY596175
Viridiplantae
Germainia capitata (KY596175)
12106
12019
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044350
KY596177
Viridiplantae
Chrysopogon orientalis (KY596177)
11988
11901
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044379
KY596179
Viridiplantae
Arthraxon hispidus (KY596179)
12101
12014
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044408
KY596182
Viridiplantae
Eulaliopsis binata (KY596182)
12089
12002
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044437
KY596183
Viridiplantae
Arthraxon microphyllus (KY596183)
12128
12041
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810044466
KY596184
Viridiplantae
Garnotia tenella (KY596184)
11884
11797
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810045133
KY707773
Viridiplantae
Themeda quadrivalvis (KY707773)
11576
11489
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810046764
LC005978
Viridiplantae
Triticum macha (LC005978)
11314
11227
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810047102
LC160130
Viridiplantae
Saccharum arundinaceum (LC160130)
12123
12036
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810048469
LN849913
Viridiplantae
Saccharum officinarum (LN849913)
12096
12009
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810048638
LN869215
Viridiplantae
Miscanthus floridulus (LN869215)
12120
12033
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810048667
LN869216
Viridiplantae
Miscanthus junceus (LN869216)
12123
12036
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810048696
LN869229
Viridiplantae
Miscanthus transmorrisonensis (LN869229)
12120
12033
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810048725
LN869230
Viridiplantae
Miscanthus x giganteus (LN869230)
12093
12006
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049116
MF035966
Viridiplantae
Alloeochaete namuliensis (MF035966)
11805
11718
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049145
MF035967
Viridiplantae
Alloeochaete oreogena (MF035967)
11780
11693
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049174
MF035968
Viridiplantae
Alloeochaete uluguruensis (MF035968)
11779
11692
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049203
MF035969
Viridiplantae
Amphipogon caricinus (MF035969)
11728
11641
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049232
MF035970
Viridiplantae
Amphipogon turbinatus (MF035970)
11408
11321
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049261
MF035973
Viridiplantae
Chasmanthium laxum (MF035973)
12006
11919
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049319
MF035975
Viridiplantae
Crinipes abyssinicus (MF035975)
12080
11993
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049348
MF035976
Viridiplantae
Crinipes longifolius (MF035976)
12069
11982
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049377
MF035978
Viridiplantae
Dichaetaria wightii (MF035978)
11902
11815
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049580
MF035992
Viridiplantae
Nematopoa longipes (MF035992)
11633
11546
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049667
MF035997
Viridiplantae
Styppeiochloa gynoglossa (MF035997)
12086
11999
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052572
MF460972
Viridiplantae
Prosphytochloa prehensilis (MF460972)
11581
11494
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052601
MF460974
Viridiplantae
Taeniatherum caput-medusae (MF460974)
11302
11215
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052659
MF460976
Viridiplantae
Agrostis gigantea (MF460976)
11326
11239
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052688
MF460977
Viridiplantae
Alopecurus arundinaceus (MF460977)
11368
11281
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052717
MF460978
Viridiplantae
Aristida ternipes (MF460978)
12068
11981
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052746
MF460979
Viridiplantae
Connorochloa tenuis (MF460979)
11270
11183
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810052891
MF460984
Viridiplantae
Zingeria biebersteiniana (MF460984)
11357
11270
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053168
MF563365
Viridiplantae
Stipagrostis hirtigluma (MF563365)
11339
11252
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053197
MF563366
Viridiplantae
Loudetia simplex (MF563366)
11668
11581
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053226
MF563367
Viridiplantae
Paspalum paniculatum (MF563367)
12125
12038
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053255
MF563368
Viridiplantae
Tristachya humbertii (MF563368)
11754
11667
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053284
MF563369
Viridiplantae
Streptostachys asperifolia (MF563369)
12048
11961
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053313
MF563370
Viridiplantae
Sartidia isaloensis (MF563370)
11486
11399
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053342
MF563371
Viridiplantae
Saccharum hildebrandtii (MF563371)
12088
12001
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053516
MF563377
Viridiplantae
Hildaea pallens (MF563377)
11949
11862
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053545
MF563378
Viridiplantae
Homolepis aturensis (MF563378)
11752
11665
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053661
MF563383
Viridiplantae
Axonopus ramosus (MF563383)
11484
11397
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810053690
MF563384
Viridiplantae
Aristida rufescens (MF563384)
11480
11393
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810054110
MF614917
Viridiplantae
Littledalea racemosa (MF614917)
11294
11207
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810057362
MG383937
Viridiplantae
Oryza coarctata (MG383937)
11815
11728
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810057468
MG386499
Viridiplantae
Tripsacum dactyloides (MG386499)
12163
12076
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810057736
MG463107
Viridiplantae
Littledalea przevalskyi (MG463107)
11282
11195
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810058151
MG570144
Viridiplantae
Littledalea alaica (MG570144)
11282
11195
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>R05100062
AP008207
Plant
Oryza sativa Japonica Group
35300030
35299940
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100179
AP008208
Plant
Oryza sativa Japonica Group
15032941
15033031
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100262
AP008209
Plant
Oryza sativa Japonica Group
35387803
35387713
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100355
AP008210
Plant
Oryza sativa Japonica Group
9413550
9413460
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100361
AP008210
Plant
Oryza sativa Japonica Group
9226648
9226558
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100416
AP008211
Plant
Oryza sativa Japonica Group
13007633
13007543
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100608
AP008216
Plant
Oryza sativa Japonica Group
11216872
11216782
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>CHL090100088
AB042240
Viridiplantae
Triticum aestivum
11660
11573
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090100859
AP006714
Viridiplantae
Saccharum officinarum
12097
12010
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090100922
AP006728
Viridiplantae
Oryza nivara
11527
11440
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090101483
AY522329
Viridiplantae
Oryza sativa Indica Group
11529
11442
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090101512
AY522331
Viridiplantae
Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S
11592
11505
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090101706
AY928077
Viridiplantae
Zea mays cultivar B73
11750
11663
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090102800
EF115541
Viridiplantae
Hordeum vulgare subsp. vulgare
11822
11735
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090102829
EF115542
Viridiplantae
Sorghum bicolor
12610
12523
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090102858
EF115543
Viridiplantae
Agrostis stolonifera
11868
11781
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090103261
X15901
Viridiplantae
Oryza sativa Japonica Group
11590
11503
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL090103319
X86563
Viridiplantae
Zea mays
11756
11669
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
Identical group No.36880 (4 seq.)
>CHL1810042338
KY432793
Viridiplantae
Rytidosperma semiannulare (KY432793)
11211
11124
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810042454
KY432798
Viridiplantae
Tribolium hispidum (KY432798)
11223
11136
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>CHL1810049609
MF035993
Viridiplantae
Phaenanthoecium koestlinii (MF035993)
11432
11345
-
Ser
TGA
[ENA]
¡û
>R05100124
AP008218
Plant
Oryza sativa Japonica Group
13568013
13568103
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
Identical group No.48182 (18 seq.)
>WENV180188984
OAWX01003447
[OAWX] human gut metagenome; faeces
108
195
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV180225972
OBBP01009107
[OBBP] human oral metagenome; human oral
144
57
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181039796
ODXQ01053059
[ODXQ] human metagenome; G_DNA_Tongue dorsum
536
623
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181297464
OFHK01049383
[OFHK] soil metagenome; Clay
390
477
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181551459
OGIN01017239
[OGIN] metagenome; Human gut stool
802
889
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181574553
OGJT01000813
[OGJT] metagenome; Human gut stool
7600
7687
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181597741
OGKZ01019085
[OGKZ] metagenome; Human gut stool
646
733
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181609119
OGLN01008274
[OGLN] metagenome; Human gut stool
1698
1611
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181634686
OGMW01010605
[OGMW] metagenome; Human gut stool
415
502
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV182642233
OJLL01007638
[OJLL] metagenome; surface
528
615
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV183106751
OLNL01054984
[OLNL] human gut metagenome; faeces
93
6
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV183220272
OLQK01045979
[OLQK] human gut metagenome; faeces
415
502
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV183296448
OLSL01055137
[OLSL] human gut metagenome; faeces
392
305
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV183765184
PPYE01331867
[PPYE] human gut metagenome; stool from patient with ulcerative colitis
130
217
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV170659214
JXWR01001601
[JXWR] soil metagenome; rice field; ambient CO2
40116
40205
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV170660097
JXWS01149231
[JXWS] soil metagenome; rice field; elevated CO2
842
753
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>R05100152
AP008218
Plant
Oryza sativa Japonica Group
20810363
20810274
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100331
AP008210
Plant
Oryza sativa Japonica Group
33378781
33378692
-
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
Identical group No.53921 (5 seq.)
>WENV180889244
ODMN01021841
[ODMN] human metagenome; G_DNA_Supragingival plaque
1273
1186
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181446448
OGDT01005179
[OGDT] metagenome; Human gut stool
1201
1114
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>WENV181556436
OGIU01027681
[OGIU] metagenome; Human gut stool
264
351
+
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>AD01000161
NC_003071
Plant
Arabidopsis thaliana
3369354
3369441
+
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
>AD01000169
NC_003071
Plant
Arabidopsis thaliana
3503522
3503609
+
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
Identical group No.190916 (8 seq.)
>WENV170659857
JXWS01010583
[JXWS] soil metagenome; rice field; elevated CO2
256
173
-
Ser
TGA
[ENA]
¢þ
>R05100006
AP008207
Plant
Oryza sativa Japonica Group
3420334
3420418
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100085
AP008217
Plant
Oryza sativa Japonica Group
584869
584955
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100112
AP008218
Plant
Oryza sativa Japonica Group
625416
625502
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>R05100376
AP008211
Plant
Oryza sativa Japonica Group
3871977
3872061
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
>AD01000067
NC_003070
Plant
Arabidopsis thaliana
20791311
20791392
+
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
>AD01000363
NC_003075
Plant
Arabidopsis thaliana
13058913
13058832
-
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
>AD01000446
NC_003076
Plant
Arabidopsis thaliana
21257916
21257833
-
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
Identical group No.190919 (1 seq.)
>R05300034
AP008209
Plant
Oryza sativa Japonica Group
12678465
12678551
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
Identical group No.205489 (2 seq.)
>AD01000308
NC_003074
Plant
Arabidopsis thaliana
2945777
2945696
-
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
>AD01000476
NC_003076
Plant
Arabidopsis thaliana
642482
642399
-
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
Identical group No.205490 (1 seq.)
>AD01000310
NC_003074
Plant
Arabidopsis thaliana
2253756
2253675
-
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
Identical group No.213542 (1 seq.)
>R05100471
AP008213
Plant
Oryza sativa Japonica Group
29361377
29361463
+
Ser
TGA
[RAP-DB]
¡û
Identical group No.215904 (1 seq.)
>AD01000102
NC_003070
Plant
Arabidopsis thaliana
28634691
28634774
+
Ser
TGA
[TAIR]
¡û
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Species
Start
End
Direction
AA
Anticodon
Genome/Seq. Info.
Decision
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Representative sequence of each cluster
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