This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
124 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180818332
ODJQ01017495
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818684
ODJQ01055321
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818836
ODJQ01096235
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818555
ODJQ01035904
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818826
ODJQ01093269
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818092
ODJQ01008036
155113
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180818455
ODJQ01026249
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180817792
ODJQ01002759
238816
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818613
ODJQ01044657
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180818433
ODJQ01023683
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180819157
ODJQ01298851
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180817868
ODJQ01003560
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818288
ODJQ01015370
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818801
ODJQ01086080
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180817477
ODJQ01000789
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180817893
ODJQ01003988
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180819033
ODJQ01201843
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180818119
ODJQ01009066
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180817585
ODJQ01001201
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180818640
ODJQ01049543
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818685
ODJQ01055321
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180819167
ODJQ01300446
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818409
ODJQ01022177
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818122
ODJQ01009073
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180818777
ODJQ01077692
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180817877
ODJQ01003684
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180817878
ODJQ01003684
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180817998
ODJQ01005960
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180818924
ODJQ01127296
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818635
ODJQ01048951
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818827
ODJQ01093511
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818839
ODJQ01096552
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818754
ODJQ01070436
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180817919
ODJQ01004306
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180818985
ODJQ01168309
345329
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818945
ODJQ01141952
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818968
ODJQ01155548
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818043
ODJQ01006964
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180818215
ODJQ01011846
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180818346
ODJQ01018140
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180818556
ODJQ01035944
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180818835
ODJQ01096235
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817894
ODJQ01003988
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180817941
ODJQ01004659
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180819151
ODJQ01297185
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818296
ODJQ01015490
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818639
ODJQ01049543
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818185
ODJQ01010838
173314
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180818804
ODJQ01086510
173314
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180819120
ODJQ01284557
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV180819145
ODJQ01296798
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180818786
ODJQ01080260
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180819135
ODJQ01296124
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180817747
ODJQ01002412
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180818423
ODJQ01022691
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180817945
ODJQ01004778
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180818799
ODJQ01084982
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180818462
ODJQ01026660
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180819046
ODJQ01214793
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180819075
ODJQ01234475
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180819081
ODJQ01239451
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180817523
ODJQ01000948
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180817790
ODJQ01002759
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818789
ODJQ01080657
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180817730
ODJQ01002334
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180817478
ODJQ01000789
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180818321
ODJQ01016868
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180818480
ODJQ01028408
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180818843
ODJQ01098336
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180818120
ODJQ01009066
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180817785
ODJQ01002732
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180818333
ODJQ01017495
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180817846
ODJQ01003279
185292
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180818196
ODJQ01011071
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180818585
ODJQ01040785
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180818780
ODJQ01077692
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180819085
ODJQ01240311
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180818956
ODJQ01149042
154711
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180818620
ODJQ01045822
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180818141
ODJQ01009623
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180817793
ODJQ01002761
256380
Bacillota
>WENV180817875
ODJQ01003676
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818206
ODJQ01011354
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180819072
ODJQ01231263
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV180817887
ODJQ01003835
388132
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818289
ODJQ01015370
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180819063
ODJQ01223412
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180817808
ODJQ01002806
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180818662
ODJQ01052059
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180818217
ODJQ01011939
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818726
ODJQ01063098
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180819129
ODJQ01293737
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818719
ODJQ01061191
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180819020
ODJQ01194643
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818519
ODJQ01032335
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818420
ODJQ01022586
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180818331
ODJQ01017495
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180817431
ODJQ01000630
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818300
ODJQ01015531
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818658
ODJQ01051374
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818091
ODJQ01007900
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180818181
ODJQ01010807
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180817952
ODJQ01004880
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180817933
ODJQ01004480
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180817874
ODJQ01003671
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180818860
ODJQ01103948
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180818520
ODJQ01032335
194064
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180817382
ODJQ01000516
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818195
ODJQ01011071
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180818193
ODJQ01011071
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180818184
ODJQ01010838
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180818811
ODJQ01089051
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180818952
ODJQ01144935
152018
Bacillota
CCT
Arg
>WENV180817946
ODJQ01004778
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818059
ODJQ01007209
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818800
ODJQ01084982
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180818377
ODJQ01020188
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180818762
ODJQ01073227
292012
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180817392
ODJQ01000532
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180817993
ODJQ01005731
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818299
ODJQ01015515
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818399
ODJQ01021507
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818429
ODJQ01022825
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180818194
ODJQ01011071
245344
Bacillota
GAA
Phe
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK