This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
115 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180994303
ODVQ01057430
361659
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180994073
ODVQ01026809
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994091
ODVQ01028884
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180994161
ODVQ01034733
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993233
ODVQ01001203
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994269
ODVQ01054889
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180994493
ODVQ01110749
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180994499
ODVQ01114257
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180994256
ODVQ01051701
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180993031
ODVQ01000395
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180993363
ODVQ01002105
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180994597
ODVQ01168384
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180994199
ODVQ01039185
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994202
ODVQ01039464
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994267
ODVQ01053615
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994364
ODVQ01073620
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994580
ODVQ01161068
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994133
ODVQ01031727
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180993015
ODVQ01000379
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180993502
ODVQ01003342
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180994125
ODVQ01031021
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180994134
ODVQ01031765
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180994261
ODVQ01052856
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180992662
ODVQ01000001
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180992663
ODVQ01000001
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180992664
ODVQ01000001
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180994059
ODVQ01025525
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180994302
ODVQ01057430
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180994688
ODVQ01234654
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180993083
ODVQ01000506
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180993934
ODVQ01016252
345329
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180993358
ODVQ01002043
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180994165
ODVQ01034733
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994291
ODVQ01056339
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994516
ODVQ01121011
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994732
ODVQ01262315
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994741
ODVQ01263105
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994561
ODVQ01148905
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180994721
ODVQ01261895
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993364
ODVQ01002105
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180994738
ODVQ01262796
338550
Bacillota
>WENV180993426
ODVQ01002664
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180994260
ODVQ01052652
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994494
ODVQ01112918
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994660
ODVQ01212804
162028
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180994266
ODVQ01053615
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180993739
ODVQ01008140
173314
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994018
ODVQ01020993
173314
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180994224
ODVQ01045700
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180993805
ODVQ01010719
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180994342
ODVQ01067602
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180994337
ODVQ01065833
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180993207
ODVQ01001080
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180994255
ODVQ01051701
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180993172
ODVQ01000887
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180994711
ODVQ01253492
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180994733
ODVQ01262384
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180993803
ODVQ01010719
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993825
ODVQ01011306
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180992927
ODVQ01000207
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180993096
ODVQ01000593
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180993960
ODVQ01017264
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180994547
ODVQ01140338
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180993032
ODVQ01000395
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180992995
ODVQ01000341
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180993234
ODVQ01001203
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180994336
ODVQ01065833
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180993965
ODVQ01017833
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180992698
ODVQ01000016
242249
Bacillota
TAC
Val
>WENV180992994
ODVQ01000341
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993231
ODVQ01001203
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993463
ODVQ01002941
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180994279
ODVQ01055766
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180994496
ODVQ01114083
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180994096
ODVQ01029079
313104
Bacillota
TAC
Val
>WENV180994340
ODVQ01067145
313104
Bacillota
TAC
Val
>WENV180993194
ODVQ01000961
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180994509
ODVQ01118162
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180994659
ODVQ01212804
37193
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180994229
ODVQ01046407
301896
Bacillota
TAC
Val
>WENV180994355
ODVQ01070359
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180994137
ODVQ01031765
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180993955
ODVQ01016931
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180993750
ODVQ01008559
256380
Bacillota
>WENV180994507
ODVQ01117805
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180994637
ODVQ01191107
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180994301
ODVQ01057430
237963
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180994298
ODVQ01057430
201667
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180994678
ODVQ01228987
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180994299
ODVQ01057430
279635
Bacillota
GTG
His
>WENV180994138
ODVQ01031765
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180994384
ODVQ01077862
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180993025
ODVQ01000395
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180993829
ODVQ01011365
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180994265
ODVQ01053527
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994679
ODVQ01229413
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994144
ODVQ01032872
91122
Bacillota
CAA
Leu
>WENV180994225
ODVQ01045700
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180994589
ODVQ01166409
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180994441
ODVQ01093029
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180994130
ODVQ01031638
21693
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180994497
ODVQ01114083
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180994539
ODVQ01135275
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180993963
ODVQ01017372
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180994438
ODVQ01092085
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180993880
ODVQ01013322
194064
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180993738
ODVQ01008140
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180994483
ODVQ01107768
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180993173
ODVQ01000887
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180993795
ODVQ01010006
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180994284
ODVQ01055966
292012
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180994503
ODVQ01116158
292012
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180994620
ODVQ01181126
146770
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180993816
ODVQ01010975
376360
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180994119
ODVQ01030415
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK