This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
124 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183263036
OLRQ01038043
37528
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183261682
OLRQ01000032
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183261834
OLRQ01000130
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183262691
OLRQ01004986
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183262555
OLRQ01002921
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183261777
OLRQ01000095
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV183262183
OLRQ01000876
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV183262281
OLRQ01001282
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183262566
OLRQ01003019
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183262512
OLRQ01002672
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183262854
OLRQ01012071
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183262577
OLRQ01003160
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183262324
OLRQ01001416
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183263012
OLRQ01029524
152156
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183262717
OLRQ01005599
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183262191
OLRQ01000892
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183263094
OLRQ01052280
80951
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183262984
OLRQ01027095
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183262016
OLRQ01000404
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183262271
OLRQ01001211
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183263013
OLRQ01029548
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183262402
OLRQ01001801
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183262417
OLRQ01001875
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183262991
OLRQ01027918
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183262085
OLRQ01000546
155273
Bacillota
CAT
Met
>WENV183262059
OLRQ01000501
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183261853
OLRQ01000152
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183261854
OLRQ01000152
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183263081
OLRQ01048833
37083
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183261961
OLRQ01000292
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183261979
OLRQ01000323
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183262393
OLRQ01001773
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183262411
OLRQ01001835
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183262612
OLRQ01003519
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183262996
OLRQ01028235
379268
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183262582
OLRQ01003160
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183262681
OLRQ01004668
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183262058
OLRQ01000501
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV183262263
OLRQ01001176
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262300
OLRQ01001324
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262693
OLRQ01005020
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262628
OLRQ01003700
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183261789
OLRQ01000117
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183261892
OLRQ01000216
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183261975
OLRQ01000323
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183261977
OLRQ01000323
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262155
OLRQ01000777
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262202
OLRQ01000901
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262259
OLRQ01001139
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262261
OLRQ01001159
295714
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262586
OLRQ01003267
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183262319
OLRQ01001402
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183263001
OLRQ01028235
380750
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183261768
OLRQ01000077
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183261877
OLRQ01000195
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183262025
OLRQ01000425
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV183262844
OLRQ01011716
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183262875
OLRQ01013116
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183261636
OLRQ01000018
173810
Bacillota
CAT
Met
>WENV183261946
OLRQ01000285
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183261947
OLRQ01000285
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183262884
OLRQ01014422
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183261595
OLRQ01000007
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183261599
OLRQ01000009
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183261838
OLRQ01000139
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183261875
OLRQ01000189
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183261897
OLRQ01000237
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183262089
OLRQ01000559
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183262448
OLRQ01002050
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183261752
OLRQ01000063
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262282
OLRQ01001282
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262435
OLRQ01002003
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183262785
OLRQ01008019
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183261638
OLRQ01000018
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183262108
OLRQ01000628
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183262113
OLRQ01000648
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183262275
OLRQ01001224
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183262688
OLRQ01004935
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183262718
OLRQ01005599
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183261616
OLRQ01000012
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183261751
OLRQ01000063
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183261968
OLRQ01000301
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183262279
OLRQ01001282
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183262416
OLRQ01001862
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183262997
OLRQ01028235
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183262692
OLRQ01004986
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183262927
OLRQ01018574
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183262656
OLRQ01004332
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262057
OLRQ01000501
152151
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183263000
OLRQ01028235
235289
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183262315
OLRQ01001374
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183262535
OLRQ01002761
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183262637
OLRQ01003898
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183262977
OLRQ01025950
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183262326
OLRQ01001433
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183262567
OLRQ01003019
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183262564
OLRQ01003019
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183262164
OLRQ01000816
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262887
OLRQ01014730
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183262956
OLRQ01022806
345314
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183262298
OLRQ01001309
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183262763
OLRQ01007008
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183261909
OLRQ01000246
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183261867
OLRQ01000163
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183262353
OLRQ01001574
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183262234
OLRQ01001040
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183262587
OLRQ01003267
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183262840
OLRQ01011391
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183261893
OLRQ01000220
157719
Bacillota
CAT
Met
>WENV183262549
OLRQ01002901
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183261712
OLRQ01000049
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262548
OLRQ01002897
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183262170
OLRQ01000826
287480
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183261830
OLRQ01000130
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183262902
OLRQ01015851
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183262507
OLRQ01002559
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183263077
OLRQ01047168
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183261683
OLRQ01000032
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183262166
OLRQ01000816
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183261836
OLRQ01000130
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV183262241
OLRQ01001072
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183262332
OLRQ01001442
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183262400
OLRQ01001799
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183262429
OLRQ01001954
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK