This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
141 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV182796273
OJSQ01011438
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182796164
OJSQ01007625
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182796166
OJSQ01007642
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182796188
OJSQ01008166
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182796418
OJSQ01019301
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV182795965
OJSQ01003838
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796039
OJSQ01005012
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796290
OJSQ01012140
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796378
OJSQ01017121
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182794961
OJSQ01000013
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV182796044
OJSQ01005127
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV182795441
OJSQ01000670
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182795988
OJSQ01004375
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV182795374
OJSQ01000568
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182796411
OJSQ01018929
340263
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182795637
OJSQ01001351
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182796312
OJSQ01013468
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796478
OJSQ01023688
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182795707
OJSQ01001754
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182795889
OJSQ01003083
425593
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182796450
OJSQ01021673
241441
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182795614
OJSQ01001255
37549
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182796404
OJSQ01018929
148348
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182796699
OJSQ01058660
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182795697
OJSQ01001677
37071
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182795389
OJSQ01000587
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182796309
OJSQ01013160
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182795744
OJSQ01001982
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182795300
OJSQ01000366
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182795916
OJSQ01003321
193585
Bacillota
CGG
Pro
>WENV182796641
OJSQ01045437
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182795738
OJSQ01001947
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795737
OJSQ01001947
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795736
OJSQ01001947
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795377
OJSQ01000568
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795295
OJSQ01000360
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795198
OJSQ01000216
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182795584
OJSQ01001163
152047
Bacillota
GGG
Pro
>WENV182796098
OJSQ01006226
16820
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182795496
OJSQ01000831
152512
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182795286
OJSQ01000339
152459
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182795371
OJSQ01000551
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182796686
OJSQ01056150
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182796153
OJSQ01007335
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182796549
OJSQ01032849
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182796183
OJSQ01007976
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182796528
OJSQ01029693
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182796414
OJSQ01018976
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182795324
OJSQ01000406
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV182795299
OJSQ01000366
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV182796300
OJSQ01012487
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182795386
OJSQ01000585
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182796405
OJSQ01018929
239076
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182795917
OJSQ01003321
10943
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182796268
OJSQ01011199
235697
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182795840
OJSQ01002693
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182795658
OJSQ01001424
342736
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182795388
OJSQ01000587
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182796432
OJSQ01020797
340265
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182796698
OJSQ01058660
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182796227
OJSQ01009583
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182796211
OJSQ01009069
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV182796099
OJSQ01006300
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182795538
OJSQ01001007
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182795784
OJSQ01002287
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV182795373
OJSQ01000568
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182796277
OJSQ01011706
37551
Bacillota
CGA
Ser
>WENV182796088
OJSQ01005984
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV182795287
OJSQ01000339
81644
Bacillota
GAG
Leu
>WENV182795160
OJSQ01000171
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182795898
OJSQ01003168
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV182796579
OJSQ01036722
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182795347
OJSQ01000478
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182796313
OJSQ01013468
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV182795783
OJSQ01002287
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV182795758
OJSQ01002104
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV182796181
OJSQ01007958
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182795860
OJSQ01002809
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182796479
OJSQ01023688
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182795708
OJSQ01001754
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182795296
OJSQ01000365
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV182796148
OJSQ01007239
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182795348
OJSQ01000479
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182796526
OJSQ01029561
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182796342
OJSQ01015159
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182796293
OJSQ01012213
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182795613
OJSQ01001255
419945
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182796403
OJSQ01018929
239079
Bacillota
TAC
Val
>WENV182796412
OJSQ01018929
304759
Bacillota
TAC
Val
>WENV182795915
OJSQ01003320
304759
Bacillota
TAC
Val
>WENV182796615
OJSQ01040665
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182795577
OJSQ01001131
152045
Bacillota
CAT
Met
>WENV182795914
OJSQ01003320
243398
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182795036
OJSQ01000043
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182795715
OJSQ01001800
37588
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182796028
OJSQ01004849
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV182795948
OJSQ01003658
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV182795589
OJSQ01001174
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV182795453
OJSQ01000693
152046
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182795869
OJSQ01002897
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182795761
OJSQ01002127
152051
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182795421
OJSQ01000638
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182795284
OJSQ01000333
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182796643
OJSQ01045605
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182796419
OJSQ01019572
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182796734
OJSQ01068829
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182796359
OJSQ01015842
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182796131
OJSQ01006853
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182795912
OJSQ01003318
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182796394
OJSQ01018351
345314
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182796558
OJSQ01033269
237963
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182796555
OJSQ01033269
201667
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796360
OJSQ01015844
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182796221
OJSQ01009422
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182796239
OJSQ01009937
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182796012
OJSQ01004622
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182796471
OJSQ01023140
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182796442
OJSQ01021459
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182796637
OJSQ01044854
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182796228
OJSQ01009583
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182796212
OJSQ01009069
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182795370
OJSQ01000551
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182796187
OJSQ01008158
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182796155
OJSQ01007341
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182796097
OJSQ01006185
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV182796484
OJSQ01023899
21693
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182796439
OJSQ01021434
157719
Bacillota
CAT
Met
>WENV182796332
OJSQ01014207
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182796553
OJSQ01033269
401573
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182796247
OJSQ01010350
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182796705
OJSQ01061067
194064
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182795576
OJSQ01001131
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182796386
OJSQ01017809
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182796665
OJSQ01051242
248507
Bacillota
CAT
Met
>WENV182795942
OJSQ01003596
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV182795376
OJSQ01000568
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182796356
OJSQ01015692
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182796348
OJSQ01015420
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182796024
OJSQ01004789
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182795606
OJSQ01001230
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182795485
OJSQ01000800
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK