This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
32 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV170705320
LLEQ01008484
358471
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705370
LLEQ01025264
358471
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705253
LLEQ01001391
209809
Alphaproteobacteria
CCT
Arg
>WENV170705243
LLEQ01001211
446430
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV170705262
LLEQ01001687
446430
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV170705227
LLEQ01000506
399001
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV170705255
LLEQ01001454
143406
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV170705257
LLEQ01001488
143406
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV170705352
LLEQ01021730
335303
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705272
LLEQ01002188
315952
Alphaproteobacteria
GAA
Phe
>WENV170705189
LLEQ01000188
73490
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV170705268
LLEQ01001963
73490
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV170705303
LLEQ01004775
399480
Alphaproteobacteria
GAA
Phe
>WENV170705276
LLEQ01002674
400384
Alphaproteobacteria
TTC
Glu
>WENV170705274
LLEQ01002479
340918
Alphaproteobacteria
CGT
Thr
>WENV170705311
LLEQ01006195
340918
Alphaproteobacteria
CGT
Thr
>WENV170705290
LLEQ01003405
32398
Alphaproteobacteria
CGA
Ser
>WENV170705300
LLEQ01004739
398999
Alphaproteobacteria
GGT
Thr
>WENV170705316
LLEQ01007657
398999
Alphaproteobacteria
GGT
Thr
>WENV170705277
LLEQ01002758
183628
Alphaproteobacteria
CCG
Arg
>WENV170705220
LLEQ01000375
195764
Alphaproteobacteria
ACG
Arg
>WENV170705240
LLEQ01001001
400515
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV170705176
LLEQ01000027
398994
Alphaproteobacteria
GTT
Asn
>WENV170705242
LLEQ01001151
398994
Alphaproteobacteria
GTT
Asn
>WENV170705263
LLEQ01001847
179721
Alphaproteobacteria
CCG
Arg
>WENV170705285
LLEQ01003138
281676
Alphaproteobacteria
TAC
Val
>WENV170705273
LLEQ01002467
145313
Alphaproteobacteria
>WENV170705284
LLEQ01003083
178507
Alphaproteobacteria
GTG
His
>WENV170705246
LLEQ01001231
178784
Alphaproteobacteria
CAT
Met
>WENV170705294
LLEQ01004022
178784
Alphaproteobacteria
CAT
Met
>WENV170705278
LLEQ01002759
398996
Alphaproteobacteria
GCC
Gly
>WENV170705238
LLEQ01000847
283257
Alphaproteobacteria
TTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK