This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
132 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180131477
OATG01043252
270507
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180130876
OATG01001305
468330
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180131039
OATG01002325
468330
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180131144
OATG01003374
468330
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180130658
OATG01000554
451336
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180131258
OATG01005570
451336
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180130221
OATG01000007
458652
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180131548
OATG01062665
458652
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180131069
OATG01002548
451468
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131107
OATG01002785
275710
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180131132
OATG01003144
270416
Bacillota
CAC
Val
>WENV180130315
OATG01000059
183038
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180131491
OATG01044673
183038
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180130965
OATG01001766
455828
Bacillota
TAC
Val
>WENV180130967
OATG01001766
455828
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131478
OATG01043252
455828
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131337
OATG01009689
653346
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180130347
OATG01000082
270436
Bacillota
GTG
His
>WENV180131275
OATG01006008
270436
Bacillota
GTG
His
>WENV180131291
OATG01006494
467910
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180131236
OATG01005057
281602
Bacillota
CAT
Met
>WENV180131521
OATG01055067
451587
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180131563
OATG01069169
656947
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180130958
OATG01001724
86860
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180130959
OATG01001724
8223
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180130489
OATG01000246
270488
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180131120
OATG01002991
779387
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180131566
OATG01070020
465106
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180131270
OATG01005787
30751
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180130922
OATG01001549
466790
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180131413
OATG01020699
270426
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180130220
OATG01000007
451367
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131545
OATG01062665
451367
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131529
OATG01055643
281884
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180131013
OATG01002088
451355
Bacillota
GAC
Val
>WENV180131181
OATG01003911
451355
Bacillota
GAC
Val
>WENV180131256
OATG01005570
451377
Bacillota
TAC
Val
>WENV180131290
OATG01006494
279224
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180130231
OATG01000011
653367
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180130232
OATG01000011
653367
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180130233
OATG01000011
653367
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180131550
OATG01066591
112978
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180130662
OATG01000554
661851
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180131629
OATG01111220
458368
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180131186
OATG01004121
270438
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180131451
OATG01031182
466758
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180130837
OATG01001146
451352
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180130909
OATG01001451
451352
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180131412
OATG01020699
467963
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180130914
OATG01001481
455831
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180130995
OATG01001969
112239
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180131047
OATG01002359
112239
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180131445
OATG01031172
451398
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180131441
OATG01030030
451398
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180130747
OATG01000829
286459
Bacillota
CAT
Met
>WENV180130254
OATG01000022
779389
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180130494
OATG01000246
779389
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180130586
OATG01000396
779389
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180131046
OATG01002325
779389
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180131214
OATG01004529
779389
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180130495
OATG01000246
275792
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180130935
OATG01001577
72902
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180131492
OATG01044673
284661
Bacillota
CAT
Met
>WENV180130660
OATG01000554
284668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180130908
OATG01001451
284668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180131257
OATG01005570
284668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180131098
OATG01002742
274799
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180131184
OATG01004056
282519
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180131570
OATG01071352
451582
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180131203
OATG01004353
72992
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180130688
OATG01000616
284667
Bacillota
CAT
Met
>WENV180130690
OATG01000616
284667
Bacillota
CAT
Met
>WENV180131452
OATG01031644
284667
Bacillota
CAT
Met
>WENV180131041
OATG01002325
270421
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180131146
OATG01003374
270421
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180131496
OATG01045682
452437
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180130556
OATG01000350
466782
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180131208
OATG01004422
659703
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180130737
OATG01000796
779385
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180130921
OATG01001549
779385
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180130862
OATG01001204
451357
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180131453
OATG01031703
451357
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180131446
OATG01031182
219171
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180131360
OATG01011986
452813
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180131425
OATG01024267
451414
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180131501
OATG01046990
451414
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180130525
OATG01000287
270518
Bacillota
CAT
Met
>WENV180131316
OATG01007935
279706
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180131336
OATG01009689
270546
Bacillota
CAT
Met
>WENV180131448
OATG01031182
289179
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180131038
OATG01002316
20504
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180131458
OATG01033318
281604
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180131547
OATG01062665
451395
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180130642
OATG01000504
451384
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180130698
OATG01000648
467075
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180130576
OATG01000380
282417
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180131283
OATG01006236
451375
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180131304
OATG01007047
451375
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180130724
OATG01000745
270447
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180130836
OATG01001141
270447
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180131235
OATG01005057
463248
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180131251
OATG01005527
282466
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180130723
OATG01000745
653369
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180130861
OATG01001204
653369
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180131031
OATG01002246
458370
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180131238
OATG01005142
458370
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180130661
OATG01000554
451376
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180131255
OATG01005570
451376
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180130659
OATG01000554
451376
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180131276
OATG01006008
656948
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180131018
OATG01002159
653373
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180130504
OATG01000264
653373
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180131361
OATG01011986
654810
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180130441
OATG01000191
458649
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180130442
OATG01000191
458649
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180130547
OATG01000337
458649
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180130704
OATG01000648
451334
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180130801
OATG01001021
653347
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180130947
OATG01001681
154348
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180131328
OATG01008999
270405
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180131520
OATG01054028
270405
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180130628
OATG01000475
780500
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180131060
OATG01002438
780500
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180131179
OATG01003887
780500
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180131213
OATG01004529
780500
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180131435
OATG01027114
780500
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180131540
OATG01059723
454988
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180130316
OATG01000059
115212
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180131043
OATG01002325
115212
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180131148
OATG01003374
115212
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180131402
OATG01017920
658259
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180130580
OATG01000386
113007
Bacillota
CAG
Leu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK