This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
36 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV170705243
LLEQ01001211
381459
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV170705262
LLEQ01001687
381459
Alphaproteobacteria
CAC
Val
>WENV170705286
LLEQ01003186
251191
Alphaproteobacteria
TAC
Val
>WENV170705320
LLEQ01008484
303708
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705370
LLEQ01025264
303708
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705230
LLEQ01000576
176908
Alphaproteobacteria
GTC
Asp
>WENV170705176
LLEQ01000027
338282
Alphaproteobacteria
GTT
Asn
>WENV170705242
LLEQ01001151
338282
Alphaproteobacteria
GTT
Asn
>WENV170705240
LLEQ01001001
339723
Alphaproteobacteria
>WENV170705290
LLEQ01003405
23560
Alphaproteobacteria
CGA
Ser
>WENV170705263
LLEQ01001847
148157
Alphaproteobacteria
CCG
Arg
>WENV170705220
LLEQ01000375
166353
Alphaproteobacteria
ACG
Arg
>WENV170705238
LLEQ01000847
237740
Alphaproteobacteria
TTT
Lys
>WENV170705246
LLEQ01001231
147334
Alphaproteobacteria
CAT
Met
>WENV170705294
LLEQ01004022
147334
Alphaproteobacteria
CAT
Met
>WENV170705227
LLEQ01000506
338289
Alphaproteobacteria
GAC
Val
>WENV170705352
LLEQ01021730
283763
Alphaproteobacteria
TGC
Ala
>WENV170705272
LLEQ01002188
266911
Alphaproteobacteria
GAA
Phe
>WENV170705253
LLEQ01001391
153068
Alphaproteobacteria
CCT
Arg
>WENV170705277
LLEQ01002758
151730
Alphaproteobacteria
CCG
Arg
>WENV170705358
LLEQ01023302
340106
Alphaproteobacteria
GCC
Gly
>WENV170705189
LLEQ01000188
59164
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV170705268
LLEQ01001963
59164
Alphaproteobacteria
GAG
Leu
>WENV170705274
LLEQ01002479
284043
Alphaproteobacteria
CGT
Thr
>WENV170705311
LLEQ01006195
284043
Alphaproteobacteria
CGT
Thr
>WENV170705303
LLEQ01004775
338760
Alphaproteobacteria
GAA
Phe
>WENV170705284
LLEQ01003083
147087
Alphaproteobacteria
GTG
His
>WENV170705247
LLEQ01001319
319925
Alphaproteobacteria
TGT
Thr
>WENV170705288
LLEQ01003211
319925
Alphaproteobacteria
TGT
Thr
>WENV170705300
LLEQ01004739
338287
Alphaproteobacteria
GGT
Thr
>WENV170705316
LLEQ01007657
338287
Alphaproteobacteria
GGT
Thr
>WENV170705276
LLEQ01002674
339606
Alphaproteobacteria
>WENV170705255
LLEQ01001454
113715
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV170705257
LLEQ01001488
113715
Alphaproteobacteria
TAG
Leu
>WENV170705285
LLEQ01003138
236256
Alphaproteobacteria
TAC
Val
>WENV170705273
LLEQ01002467
113767
Alphaproteobacteria
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK