This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
71 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180540401
OCHQ01033353
158247
Bacillota
>WENV180540483
OCHQ01046540
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180540756
OCHQ01176399
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180540500
OCHQ01051422
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180540604
OCHQ01079081
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180540379
OCHQ01031044
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180540168
OCHQ01000341
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180540526
OCHQ01055862
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180540327
OCHQ01022542
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180540432
OCHQ01038814
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180540695
OCHQ01119841
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180540741
OCHQ01154604
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180540262
OCHQ01011617
162003
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540442
OCHQ01040126
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180540265
OCHQ01011617
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180540317
OCHQ01021489
37083
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180540333
OCHQ01023266
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540331
OCHQ01022542
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540812
OCHQ01210913
148104
Bacillota
CAT
Met
>WENV180540188
OCHQ01001538
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180540764
OCHQ01184947
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180540322
OCHQ01021801
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180540380
OCHQ01031044
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180540817
OCHQ01271350
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180540623
OCHQ01087729
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180540324
OCHQ01021801
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180540223
OCHQ01005055
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180540396
OCHQ01033074
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180540358
OCHQ01028197
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180540685
OCHQ01116771
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180540466
OCHQ01043899
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180540436
OCHQ01039396
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180540372
OCHQ01029879
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180540772
OCHQ01188442
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180540404
OCHQ01033647
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180540169
OCHQ01000341
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180540283
OCHQ01014471
254697
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180540260
OCHQ01011617
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180540543
OCHQ01058309
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180540453
OCHQ01041608
154748
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540793
OCHQ01201206
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540639
OCHQ01096625
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540540
OCHQ01057373
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540418
OCHQ01035729
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540413
OCHQ01035333
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540320
OCHQ01021489
154711
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180540208
OCHQ01003296
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180540218
OCHQ01004499
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180540303
OCHQ01020012
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180540300
OCHQ01020012
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180540528
OCHQ01055862
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180540287
OCHQ01015035
345314
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180540552
OCHQ01063779
254433
Bacillota
TAC
Val
>WENV180540805
OCHQ01210235
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540622
OCHQ01087729
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540429
OCHQ01038125
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540414
OCHQ01035333
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180540221
OCHQ01004698
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180540710
OCHQ01132102
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540224
OCHQ01005055
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180540783
OCHQ01194712
235292
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180540814
OCHQ01256848
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180540698
OCHQ01122981
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180540271
OCHQ01012213
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180540392
OCHQ01032424
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180540734
OCHQ01150588
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180540325
OCHQ01021801
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180540259
OCHQ01011617
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180540582
OCHQ01073008
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180540239
OCHQ01007376
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180540477
OCHQ01045305
150669
Bacillota
GAT
Ile
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK