This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
87 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183732398
PJTX01000107
147880
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV183732455
PJTX01000450
147880
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV183732353
PJTX01000041
412419
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV183732324
PJTX01000013
147867
Bacteroidota
GTG
His
>WENV183732344
PJTX01000035
147867
Bacteroidota
GTG
His
>WENV183732330
PJTX01000018
145315
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732409
PJTX01000133
145315
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732508
PJTX01001283
145315
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732331
PJTX01000018
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732446
PJTX01000320
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732448
PJTX01000358
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732465
PJTX01000612
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732466
PJTX01000612
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732471
PJTX01000676
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732481
PJTX01000940
147864
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732361
PJTX01000053
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732510
PJTX01001314
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732513
PJTX01001377
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732515
PJTX01001397
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732552
PJTX01001981
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732839
PJTX01021363
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732905
PJTX01034778
45276
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732322
PJTX01000013
119517
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV183732304
PJTX01000003
119517
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV183732884
PJTX01031267
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732432
PJTX01000239
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732431
PJTX01000239
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732342
PJTX01000033
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732333
PJTX01000020
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732332
PJTX01000020
235817
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732786
PJTX01014319
59351
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV183732668
PJTX01005507
59351
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV183732407
PJTX01000122
59351
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV183732380
PJTX01000070
59351
Bacteroidota
GAG
Leu
>WENV183732348
PJTX01000039
338509
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV183732347
PJTX01000039
338509
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV183732336
PJTX01000023
338509
Bacteroidota
TTC
Glu
>WENV183732604
PJTX01003296
237429
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732428
PJTX01000229
237429
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732417
PJTX01000160
237429
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732408
PJTX01000124
237429
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732659
PJTX01005066
151405
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV183732308
PJTX01000006
127215
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732306
PJTX01000006
127215
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732445
PJTX01000308
95684
Bacteroidota
TAG
Leu
>WENV183732912
PJTX01034817
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732911
PJTX01034817
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732910
PJTX01034800
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732909
PJTX01034800
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732907
PJTX01034784
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732906
PJTX01034784
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732904
PJTX01034777
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732903
PJTX01034777
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732661
PJTX01005067
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732660
PJTX01005067
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732557
PJTX01002035
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732556
PJTX01002035
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732441
PJTX01000295
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732399
PJTX01000109
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732396
PJTX01000102
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732395
PJTX01000098
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732394
PJTX01000098
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732393
PJTX01000098
238600
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732686
PJTX01006171
342824
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV183732352
PJTX01000041
342824
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV183732900
PJTX01034700
235818
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732429
PJTX01000231
126680
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732412
PJTX01000144
126680
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732307
PJTX01000006
126680
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732627
PJTX01004058
411719
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732507
PJTX01001240
411719
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732327
PJTX01000016
411719
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732746
PJTX01010147
25256
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV183732589
PJTX01002910
25256
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV183732458
PJTX01000500
25256
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV183732341
PJTX01000033
25256
Bacteroidota
GCT
Ser
>WENV183732351
PJTX01000041
251069
Bacteroidota
TCC
Gly
>WENV183732329
PJTX01000018
147863
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732392
PJTX01000094
239103
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732388
PJTX01000084
239103
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732321
PJTX01000011
239103
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732553
PJTX01001981
44923
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV183732550
PJTX01001952
237427
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732500
PJTX01001171
237427
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732349
PJTX01000041
237427
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732320
PJTX01000011
237427
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732319
PJTX01000011
237427
Bacteroidota
TGT
Thr
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK