This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
150 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV181425842
OGCQ01001350
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181426654
OGCQ01009489
339630
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426871
OGCQ01016907
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181427002
OGCQ01023694
347350
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181425098
OGCQ01000140
158247
Bacillota
>WENV181426953
OGCQ01020180
158247
Bacillota
>WENV181425967
OGCQ01001838
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181426162
OGCQ01003151
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181426672
OGCQ01009814
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181427085
OGCQ01029102
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181425530
OGCQ01000628
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181427187
OGCQ01042915
156189
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181426190
OGCQ01003355
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV181426432
OGCQ01005331
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV181427343
OGCQ01066521
155040
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181426837
OGCQ01015587
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181426924
OGCQ01019266
237387
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181425095
OGCQ01000138
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181427386
OGCQ01076554
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181427462
OGCQ01099293
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181426692
OGCQ01010217
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181426879
OGCQ01017124
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181426230
OGCQ01003718
235906
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181425136
OGCQ01000159
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181425137
OGCQ01000159
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181425194
OGCQ01000202
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181425368
OGCQ01000374
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181426138
OGCQ01002983
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181426637
OGCQ01009324
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181426638
OGCQ01009324
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181426944
OGCQ01019751
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV181426885
OGCQ01017385
97943
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181426518
OGCQ01006592
245370
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181426299
OGCQ01004243
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181426619
OGCQ01008837
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181427416
OGCQ01083617
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181427466
OGCQ01101883
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181427372
OGCQ01072729
23437
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181427201
OGCQ01044346
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181427342
OGCQ01066278
37083
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181427518
OGCQ01121798
148104
Bacillota
CAT
Met
>WENV181427440
OGCQ01094577
243227
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181426593
OGCQ01008115
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181426989
OGCQ01022592
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV181426392
OGCQ01004956
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181426636
OGCQ01009299
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV181426090
OGCQ01002671
347453
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181426929
OGCQ01019266
162028
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426715
OGCQ01010852
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181426914
OGCQ01018877
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV181426382
OGCQ01004921
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181426751
OGCQ01011923
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV181426620
OGCQ01008857
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV181426430
OGCQ01005317
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV181426955
OGCQ01020642
338547
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181424747
OGCQ01000002
242777
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181425118
OGCQ01000153
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181425357
OGCQ01000362
152149
Bacillota
GTG
His
>WENV181426562
OGCQ01007534
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV181425555
OGCQ01000671
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181425675
OGCQ01000885
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181425823
OGCQ01001268
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181426472
OGCQ01005801
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181426541
OGCQ01007053
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV181426061
OGCQ01002453
338676
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181425795
OGCQ01001154
411585
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181427281
OGCQ01056224
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV181426349
OGCQ01004603
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181425741
OGCQ01001022
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426381
OGCQ01004921
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181426750
OGCQ01011923
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181426815
OGCQ01014922
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV181425344
OGCQ01000348
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426263
OGCQ01003983
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426265
OGCQ01003990
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426343
OGCQ01004546
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426693
OGCQ01010217
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181426880
OGCQ01017124
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV181426539
OGCQ01007041
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181426727
OGCQ01011458
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181425826
OGCQ01001279
254697
Bacillota
TTT
Lys
>WENV181425393
OGCQ01000414
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181426346
OGCQ01004578
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181426565
OGCQ01007586
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181426652
OGCQ01009471
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181426136
OGCQ01002960
353847
Bacillota
CCT
Arg
>WENV181426229
OGCQ01003718
150597
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181426928
OGCQ01019266
37193
Bacillota
TAA
Leu
>WENV181426189
OGCQ01003345
235289
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181426046
OGCQ01002332
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181426711
OGCQ01010590
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181426489
OGCQ01006086
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV181426655
OGCQ01009489
154711
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181426013
OGCQ01002130
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181426386
OGCQ01004942
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181426603
OGCQ01008372
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181426713
OGCQ01010664
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181426998
OGCQ01023612
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV181426795
OGCQ01014178
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181425616
OGCQ01000765
256380
Bacillota
>WENV181426488
OGCQ01006084
256380
Bacillota
>WENV181426300
OGCQ01004252
166673
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181425941
OGCQ01001727
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181427278
OGCQ01055911
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV181426744
OGCQ01011876
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181426302
OGCQ01004253
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181426703
OGCQ01010372
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV181425997
OGCQ01002056
345314
Bacillota
TTG
Gln
>WENV181426187
OGCQ01003338
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV181426369
OGCQ01004866
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV181426650
OGCQ01009471
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV181427473
OGCQ01102952
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV181425926
OGCQ01001659
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181426351
OGCQ01004621
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181426374
OGCQ01004883
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181426716
OGCQ01010852
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181426915
OGCQ01018877
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV181426521
OGCQ01006592
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV181426222
OGCQ01003595
157719
Bacillota
CAT
Met
>WENV181425693
OGCQ01000921
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181426827
OGCQ01015372
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181427190
OGCQ01043107
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181425807
OGCQ01001194
415519
Bacillota
GCA
Cys
>WENV181425578
OGCQ01000699
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181425219
OGCQ01000228
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181427363
OGCQ01070568
242686
Bacillota
TGC
Ala
>WENV181426745
OGCQ01011887
338545
Bacillota
>WENV181426301
OGCQ01004253
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV181427337
OGCQ01065356
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV181426228
OGCQ01003718
411738
Bacillota
TCC
Gly
>WENV181425282
OGCQ01000285
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181425466
OGCQ01000513
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV181426988
OGCQ01022452
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV181426195
OGCQ01003417
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV181426922
OGCQ01019266
146770
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181425341
OGCQ01000341
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426371
OGCQ01004882
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426825
OGCQ01015274
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426849
OGCQ01015953
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181426866
OGCQ01016744
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV181427340
OGCQ01066075
238857
Bacillota
CCA
Trp
>WENV181427205
OGCQ01044822
151836
Bacillota
TCT
Arg
>WENV181425686
OGCQ01000908
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181425992
OGCQ01002051
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181426114
OGCQ01002829
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181426139
OGCQ01002984
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181426193
OGCQ01003402
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181426797
OGCQ01014265
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV181425748
OGCQ01001043
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV181427378
OGCQ01074018
150669
Bacillota
GAT
Ile
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK