This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
85 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183732304
PJTX01000003
147838
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV183732305
PJTX01000004
179380
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV183732307
PJTX01000006
155775
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732306
PJTX01000006
156339
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732308
PJTX01000006
156339
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732319
PJTX01000011
281213
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732320
PJTX01000011
281213
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732321
PJTX01000011
284068
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732324
PJTX01000013
179377
Bacteroidota
GTG
His
>WENV183732322
PJTX01000013
147838
Bacteroidota
CAA
Leu
>WENV183732327
PJTX01000016
480500
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732330
PJTX01000018
176607
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732329
PJTX01000018
179373
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732331
PJTX01000018
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732332
PJTX01000020
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732333
PJTX01000020
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732343
PJTX01000033
281210
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV183732342
PJTX01000033
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732344
PJTX01000035
179377
Bacteroidota
GTG
His
>WENV183732349
PJTX01000041
281213
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732352
PJTX01000041
403862
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV183732353
PJTX01000041
481263
Bacteroidota
CCA
Trp
>WENV183732359
PJTX01000048
281210
Bacteroidota
GCC
Gly
>WENV183732361
PJTX01000053
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732388
PJTX01000084
284068
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732392
PJTX01000094
284068
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732393
PJTX01000098
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732394
PJTX01000098
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732395
PJTX01000098
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732396
PJTX01000102
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732398
PJTX01000107
183378
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV183732399
PJTX01000109
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732408
PJTX01000124
289692
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732409
PJTX01000133
176607
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732410
PJTX01000136
284499
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732412
PJTX01000144
155775
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732413
PJTX01000144
156726
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732417
PJTX01000160
289692
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732428
PJTX01000229
289692
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732429
PJTX01000231
155775
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732430
PJTX01000231
156726
Bacteroidota
TAC
Val
>WENV183732433
PJTX01000239
179380
Bacteroidota
GGG
Pro
>WENV183732431
PJTX01000239
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732432
PJTX01000239
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732441
PJTX01000295
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732446
PJTX01000320
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732448
PJTX01000358
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732455
PJTX01000450
183378
Bacteroidota
GGC
Ala
>WENV183732465
PJTX01000612
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732466
PJTX01000612
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732471
PJTX01000676
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732481
PJTX01000940
179374
Bacteroidota
TGG
Pro
>WENV183732500
PJTX01001171
281213
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732507
PJTX01001240
480500
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732508
PJTX01001283
176607
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732510
PJTX01001314
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732513
PJTX01001377
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732515
PJTX01001397
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732550
PJTX01001952
281213
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732552
PJTX01001981
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732553
PJTX01001981
56146
Bacteroidota
TAA
Leu
>WENV183732556
PJTX01002035
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732557
PJTX01002035
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732604
PJTX01003296
289692
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732627
PJTX01004058
480500
Bacteroidota
GCA
Cys
>WENV183732660
PJTX01005067
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732661
PJTX01005067
281193
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732686
PJTX01006171
403862
Bacteroidota
GGT
Thr
>WENV183732768
PJTX01011910
284499
Bacteroidota
TGT
Thr
>WENV183732796
PJTX01015208
179822
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV183732822
PJTX01018068
179822
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV183732839
PJTX01021363
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732871
PJTX01028226
179822
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV183732884
PJTX01031267
281207
Bacteroidota
GAA
Phe
>WENV183732887
PJTX01032196
179822
Bacteroidota
TGC
Ala
>WENV183732900
PJTX01034700
298201
Bacteroidota
TTT
Lys
>WENV183732903
PJTX01034777
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732904
PJTX01034777
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732905
PJTX01034778
56539
Bacteroidota
TGA
Ser
>WENV183732906
PJTX01034784
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732907
PJTX01034784
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732909
PJTX01034800
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732910
PJTX01034800
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732911
PJTX01034817
284228
Bacteroidota
CAT
Met
>WENV183732912
PJTX01034817
284228
Bacteroidota
CAT
Met
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK