This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
168 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV182963649
OKWQ01005765
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963651
OKWQ01005765
200563
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963635
OKWQ01004500
178956
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182963521
OKWQ01000931
280870
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963634
OKWQ01004500
280870
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963478
OKWQ01000487
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963563
OKWQ01001946
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963585
OKWQ01002821
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963593
OKWQ01003267
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963594
OKWQ01003267
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963610
OKWQ01003718
480520
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963503
OKWQ01000683
184537
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963285
OKWQ01000052
20221
Bacillota
>WENV182963343
OKWQ01000129
29462
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963390
OKWQ01000210
408526
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963236
OKWQ01000006
282753
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963376
OKWQ01000176
282753
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963541
OKWQ01001433
282753
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963256
OKWQ01000022
291579
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963667
OKWQ01006584
480359
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963525
OKWQ01001042
400111
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963472
OKWQ01000466
176678
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963518
OKWQ01000925
176678
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963673
OKWQ01007431
412083
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963459
OKWQ01000418
281017
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963630
OKWQ01004325
281017
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963535
OKWQ01001316
296855
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963650
OKWQ01005765
280644
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963386
OKWQ01000205
48505
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963444
OKWQ01000400
398935
Bacillota
>WENV182963270
OKWQ01000038
418726
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963305
OKWQ01000079
418726
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963490
OKWQ01000554
418726
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963410
OKWQ01000255
291629
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963409
OKWQ01000255
291629
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963433
OKWQ01000356
29930
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963438
OKWQ01000399
29930
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963595
OKWQ01003302
289717
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963277
OKWQ01000047
20274
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963402
OKWQ01000230
20360
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963304
OKWQ01000079
298270
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963654
OKWQ01005765
176018
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963666
OKWQ01006584
398915
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963559
OKWQ01001786
282752
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963456
OKWQ01000406
20932
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963397
OKWQ01000219
20932
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963388
OKWQ01000210
291553
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963498
OKWQ01000626
13228
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963609
OKWQ01003718
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963292
OKWQ01000060
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963252
OKWQ01000021
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963245
OKWQ01000010
141334
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963505
OKWQ01000727
482593
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182963432
OKWQ01000352
482593
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182963318
OKWQ01000085
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963366
OKWQ01000156
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963494
OKWQ01000593
176014
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963465
OKWQ01000449
20238
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963467
OKWQ01000449
20238
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963377
OKWQ01000176
210775
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963237
OKWQ01000006
210775
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963527
OKWQ01001173
20942
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963416
OKWQ01000294
20942
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963317
OKWQ01000085
398916
Bacillota
>WENV182963419
OKWQ01000313
480360
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963254
OKWQ01000021
291558
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963605
OKWQ01003718
291558
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963420
OKWQ01000313
176087
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963372
OKWQ01000172
487804
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963381
OKWQ01000192
487804
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963608
OKWQ01003718
283502
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963613
OKWQ01003769
402717
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963588
OKWQ01003095
402717
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963483
OKWQ01000517
402717
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963628
OKWQ01004080
399266
Bacillota
>WENV182963612
OKWQ01003766
399266
Bacillota
>WENV182963553
OKWQ01001780
399266
Bacillota
>WENV182963507
OKWQ01000740
399266
Bacillota
>WENV182963424
OKWQ01000319
399266
Bacillota
>WENV182963474
OKWQ01000478
140815
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963295
OKWQ01000060
281303
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963294
OKWQ01000060
480519
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963544
OKWQ01001576
480519
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963247
OKWQ01000011
281591
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963235
OKWQ01000006
317763
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963369
OKWQ01000160
415857
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963238
OKWQ01000006
280871
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963554
OKWQ01001780
280871
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963573
OKWQ01002502
280871
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963629
OKWQ01004148
280871
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963475
OKWQ01000478
400112
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182963324
OKWQ01000115
281594
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963345
OKWQ01000137
281594
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963342
OKWQ01000129
415856
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963536
OKWQ01001316
184495
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963460
OKWQ01000419
141202
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963461
OKWQ01000428
46663
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182963540
OKWQ01001433
424271
Bacillota
>WENV182963519
OKWQ01000925
424271
Bacillota
>WENV182963401
OKWQ01000227
29614
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963296
OKWQ01000070
399041
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963297
OKWQ01000070
399041
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963316
OKWQ01000085
195133
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963476
OKWQ01000478
480905
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963229
OKWQ01000002
142210
Bacillota
>WENV182963477
OKWQ01000478
282756
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963496
OKWQ01000604
100098
Bacillota
GAG
Leu
>WENV182963606
OKWQ01003718
281302
Bacillota
GTG
His
>WENV182963241
OKWQ01000007
147834
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963532
OKWQ01001316
289713
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963421
OKWQ01000313
280640
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963488
OKWQ01000549
404091
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963504
OKWQ01000688
302187
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963466
OKWQ01000449
22123
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963656
OKWQ01006277
399272
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963290
OKWQ01000056
399272
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963231
OKWQ01000004
399272
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963272
OKWQ01000044
141533
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963487
OKWQ01000549
289716
Bacillota
GTG
His
>WENV182963442
OKWQ01000400
119278
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963564
OKWQ01001957
73395
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963385
OKWQ01000197
120584
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963598
OKWQ01003360
100097
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963569
OKWQ01002317
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963537
OKWQ01001329
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963526
OKWQ01001078
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963510
OKWQ01000847
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963274
OKWQ01000046
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963431
OKWQ01000351
301920
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963403
OKWQ01000230
20361
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963530
OKWQ01001295
480337
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963426
OKWQ01000321
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963326
OKWQ01000117
398857
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963647
OKWQ01005401
119459
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963248
OKWQ01000015
399249
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963408
OKWQ01000253
117940
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963557
OKWQ01001786
282757
Bacillota
GTG
His
>WENV182963407
OKWQ01000250
280547
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963387
OKWQ01000210
280547
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963314
OKWQ01000085
486506
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963299
OKWQ01000074
124780
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963489
OKWQ01000549
289761
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963370
OKWQ01000164
401835
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963556
OKWQ01001786
176771
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963404
OKWQ01000230
178065
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963435
OKWQ01000383
203851
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963574
OKWQ01002514
282754
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963597
OKWQ01003360
282754
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963495
OKWQ01000599
282758
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963398
OKWQ01000221
484342
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963491
OKWQ01000565
282755
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963552
OKWQ01001749
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963464
OKWQ01000431
289715
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963361
OKWQ01000152
20943
Bacillota
CGA
Ser
>WENV182963473
OKWQ01000466
399260
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963230
OKWQ01000003
1287
Bacillota
>WENV182963529
OKWQ01001295
208539
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963604
OKWQ01003667
184539
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963531
OKWQ01001295
184539
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963233
OKWQ01000005
399261
Bacillota
>WENV182963375
OKWQ01000176
399261
Bacillota
>WENV182963378
OKWQ01000178
399261
Bacillota
>WENV182963380
OKWQ01000184
399261
Bacillota
>WENV182963558
OKWQ01001786
400113
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963652
OKWQ01005765
176017
Bacillota
GAT
Ile
>WENV182963400
OKWQ01000227
400110
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963500
OKWQ01000636
282751
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963561
OKWQ01001843
282751
Bacillota
TGC
Ala
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK