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tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
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HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
77 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180780784
ODIO01001244
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180780921
ODIO01002716
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180780981
ODIO01003967
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180781328
ODIO01063746
202812
Bacillota
CAT
Met
>WENV180781077
ODIO01007879
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180781006
ODIO01004444
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180780703
ODIO01000741
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180780604
ODIO01000341
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180781039
ODIO01005662
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180780986
ODIO01004038
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180780942
ODIO01002918
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180780838
ODIO01001608
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180781173
ODIO01016324
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180780966
ODIO01003509
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180780922
ODIO01002716
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180780920
ODIO01002716
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180780786
ODIO01001244
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180780782
ODIO01001244
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180781258
ODIO01029949
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180780996
ODIO01004087
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180780999
ODIO01004134
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180780963
ODIO01003413
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180781385
ODIO01106949
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180781231
ODIO01024407
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180781233
ODIO01024787
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180780750
ODIO01001047
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180781126
ODIO01012288
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180780806
ODIO01001331
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180781042
ODIO01005746
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180780783
ODIO01001244
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180780943
ODIO01002918
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180780919
ODIO01002716
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180780785
ODIO01001244
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180780965
ODIO01003509
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180780914
ODIO01002649
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180780824
ODIO01001475
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180780985
ODIO01004006
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180781066
ODIO01007103
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180781257
ODIO01029949
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180781307
ODIO01049384
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180781238
ODIO01025336
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180780894
ODIO01002372
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180780987
ODIO01004038
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180780984
ODIO01004006
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180780911
ODIO01002592
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180780839
ODIO01001608
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180780983
ODIO01003967
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180780982
ODIO01003967
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180780993
ODIO01004079
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180780930
ODIO01002816
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180780953
ODIO01003073
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180780958
ODIO01003337
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180780803
ODIO01001324
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180781378
ODIO01102058
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180780823
ODIO01001449
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180781065
ODIO01007030
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180781106
ODIO01010468
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180780819
ODIO01001423
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180781346
ODIO01075758
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180780980
ODIO01003967
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180781182
ODIO01017415
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180780825
ODIO01001475
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180780882
ODIO01002129
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180780725
ODIO01000850
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180780698
ODIO01000708
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180781193
ODIO01019697
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180780915
ODIO01002649
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180780992
ODIO01004079
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180781212
ODIO01021813
198135
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180780644
ODIO01000433
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180780885
ODIO01002189
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180781277
ODIO01040331
152018
Bacillota
CCT
Arg
>WENV180781387
ODIO01107115
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180780709
ODIO01000776
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180781055
ODIO01006426
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180781349
ODIO01076268
413179
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180780973
ODIO01003632
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
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