This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
168 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV182963489
OKWQ01000549
243647
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963238
OKWQ01000006
235507
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963554
OKWQ01001780
235507
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963573
OKWQ01002502
235507
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963629
OKWQ01004148
235507
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963547
OKWQ01001607
248982
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963433
OKWQ01000356
26899
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963438
OKWQ01000399
26899
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963361
OKWQ01000152
16842
Bacillota
CGA
Ser
>WENV182963535
OKWQ01001316
235693
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963403
OKWQ01000230
18465
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963314
OKWQ01000085
418445
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963275
OKWQ01000047
16815
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963276
OKWQ01000047
16815
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963498
OKWQ01000626
10560
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963598
OKWQ01003360
80838
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963326
OKWQ01000117
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963426
OKWQ01000321
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963473
OKWQ01000466
338544
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963270
OKWQ01000038
356488
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963305
OKWQ01000079
356488
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963490
OKWQ01000554
356488
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963404
OKWQ01000230
146697
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963673
OKWQ01007431
359540
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963574
OKWQ01002514
237285
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963597
OKWQ01003360
237285
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963299
OKWQ01000074
95737
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963408
OKWQ01000253
95737
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963477
OKWQ01000478
237286
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963237
OKWQ01000006
173811
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963377
OKWQ01000176
173811
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963295
OKWQ01000060
235906
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963235
OKWQ01000006
274026
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963316
OKWQ01000085
162003
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963500
OKWQ01000636
243346
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963561
OKWQ01001843
243346
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963474
OKWQ01000478
113680
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963385
OKWQ01000197
97943
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV182963229
OKWQ01000002
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963245
OKWQ01000010
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963252
OKWQ01000021
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963609
OKWQ01003718
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963512
OKWQ01000849
422863
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963317
OKWQ01000085
338208
Bacillota
>WENV182963285
OKWQ01000052
16235
Bacillota
>WENV182963372
OKWQ01000172
419288
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963381
OKWQ01000192
419288
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963343
OKWQ01000129
23437
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963282
OKWQ01000048
18548
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963476
OKWQ01000478
412107
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963437
OKWQ01000383
344203
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182963496
OKWQ01000604
80839
Bacillota
GAG
Leu
>WENV182963472
OKWQ01000466
145606
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963518
OKWQ01000925
145606
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963397
OKWQ01000219
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963456
OKWQ01000406
16834
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963371
OKWQ01000164
150517
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963511
OKWQ01000849
359258
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963618
OKWQ01004003
359258
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963638
OKWQ01004761
359258
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963336
OKWQ01000117
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV182963550
OKWQ01001749
243646
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963460
OKWQ01000419
114002
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963424
OKWQ01000319
338550
Bacillota
>WENV182963507
OKWQ01000740
338550
Bacillota
>WENV182963553
OKWQ01001780
338550
Bacillota
>WENV182963612
OKWQ01003766
338550
Bacillota
>WENV182963628
OKWQ01004080
338550
Bacillota
>WENV182963272
OKWQ01000044
114284
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963391
OKWQ01000210
37437
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182963464
OKWQ01000431
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963552
OKWQ01001749
243612
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963654
OKWQ01005765
144766
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963461
OKWQ01000428
39475
Bacillota
TAA
Leu
>WENV182963399
OKWQ01000221
258936
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963491
OKWQ01000565
258936
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963501
OKWQ01000650
258936
Bacillota
GGT
Thr
>WENV182963292
OKWQ01000060
115075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV182963520
OKWQ01000931
173810
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963247
OKWQ01000011
236175
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963370
OKWQ01000164
340941
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963419
OKWQ01000313
411585
Bacillota
GCA
Cys
>WENV182963321
OKWQ01000094
344320
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963503
OKWQ01000683
147135
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963558
OKWQ01001786
339364
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963413
OKWQ01000264
353537
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963359
OKWQ01000149
353537
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963471
OKWQ01000466
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963484
OKWQ01000517
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963457
OKWQ01000407
342895
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963499
OKWQ01000631
342895
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963465
OKWQ01000449
16252
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963467
OKWQ01000449
16252
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963525
OKWQ01001042
339362
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963667
OKWQ01006584
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963342
OKWQ01000129
353847
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963324
OKWQ01000115
236177
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963345
OKWQ01000137
236177
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963293
OKWQ01000060
350782
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182963435
OKWQ01000383
150597
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963388
OKWQ01000210
250349
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963369
OKWQ01000160
353848
Bacillota
GTT
Asn
>WENV182963228
OKWQ01000001
1074
Bacillota
>WENV182963475
OKWQ01000478
339363
Bacillota
GCC
Gly
>WENV182963466
OKWQ01000449
18547
Bacillota
GCT
Ser
>WENV182963254
OKWQ01000021
258997
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963605
OKWQ01003718
258997
Bacillota
CTT
Lys
>WENV182963387
OKWQ01000210
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963407
OKWQ01000250
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV182963283
OKWQ01000048
166673
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963606
OKWQ01003718
235905
Bacillota
GTG
His
>WENV182963421
OKWQ01000313
235288
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963478
OKWQ01000487
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963563
OKWQ01001946
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963585
OKWQ01002821
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963593
OKWQ01003267
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963594
OKWQ01003267
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963610
OKWQ01003718
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963557
OKWQ01001786
237287
Bacillota
GTG
His
>WENV182963459
OKWQ01000418
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963630
OKWQ01004325
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963521
OKWQ01000931
235506
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963634
OKWQ01004500
235506
Bacillota
TGC
Ala
>WENV182963564
OKWQ01001957
59079
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963649
OKWQ01005765
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963651
OKWQ01005765
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV182963504
OKWQ01000688
259290
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963608
OKWQ01003718
237963
Bacillota
TTT
Lys
>WENV182963376
OKWQ01000176
237284
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963541
OKWQ01001433
237284
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963236
OKWQ01000006
237284
Bacillota
TAC
Val
>WENV182963487
OKWQ01000549
243613
Bacillota
GTG
His
>WENV182963401
OKWQ01000227
23575
Bacillota
GGA
Ser
>WENV182963335
OKWQ01000117
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963420
OKWQ01000313
144833
Bacillota
ACG
Arg
>WENV182963392
OKWQ01000211
148495
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963556
OKWQ01001786
145469
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963650
OKWQ01005765
235292
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963536
OKWQ01001316
152491
Bacillota
CAT
Met
>WENV182963483
OKWQ01000517
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963519
OKWQ01000925
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963540
OKWQ01001433
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963588
OKWQ01003095
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963613
OKWQ01003769
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963318
OKWQ01000085
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963366
OKWQ01000156
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963494
OKWQ01000593
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963230
OKWQ01000003
1080
Bacillota
>WENV182963532
OKWQ01001316
273029
Bacillota
TGT
Thr
>WENV182963531
OKWQ01001295
178024
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963604
OKWQ01003667
178024
Bacillota
TCT
Arg
>WENV182963402
OKWQ01000230
16361
Bacillota
TGA
Ser
>WENV182963233
OKWQ01000005
338545
Bacillota
>WENV182963375
OKWQ01000176
338545
Bacillota
>WENV182963378
OKWQ01000178
338545
Bacillota
>WENV182963380
OKWQ01000184
338545
Bacillota
>WENV182963495
OKWQ01000599
237288
Bacillota
CCA
Trp
>WENV182963400
OKWQ01000227
339361
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963294
OKWQ01000060
411738
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963544
OKWQ01001576
411738
Bacillota
TCC
Gly
>WENV182963432
OKWQ01000352
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182963505
OKWQ01000727
413657
Bacillota
CCC
Gly
>WENV182963256
OKWQ01000022
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV182963241
OKWQ01000007
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV182963248
OKWQ01000015
338533
Bacillota
CCT
Arg
>WENV182963488
OKWQ01000549
343027
Bacillota
TTG
Gln
>WENV182963666
OKWQ01006584
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV182963559
OKWQ01001786
237283
Bacillota
TTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK