This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
81 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183546798
OOAU01000047
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546811
OOAU01000052
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183546810
OOAU01000052
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546806
OOAU01000052
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546808
OOAU01000052
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546804
OOAU01000052
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546809
OOAU01000052
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546805
OOAU01000052
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546856
OOAU01000104
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183546875
OOAU01000122
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183546939
OOAU01000307
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183546940
OOAU01000307
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183546952
OOAU01000355
241441
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183546963
OOAU01000372
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547022
OOAU01000670
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183547061
OOAU01000886
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183547066
OOAU01000912
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547064
OOAU01000912
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547067
OOAU01000916
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183547074
OOAU01000931
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547088
OOAU01000988
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547090
OOAU01000993
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183547094
OOAU01001024
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183547101
OOAU01001055
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183547106
OOAU01001056
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547117
OOAU01001164
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183547147
OOAU01001478
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547146
OOAU01001478
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547151
OOAU01001493
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183547157
OOAU01001548
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183547178
OOAU01002144
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547177
OOAU01002144
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547187
OOAU01002186
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183547223
OOAU01002950
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183547232
OOAU01003282
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547233
OOAU01003292
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547234
OOAU01003365
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183547238
OOAU01003707
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183547240
OOAU01003812
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547246
OOAU01004068
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547271
OOAU01004673
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183547294
OOAU01005404
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547310
OOAU01006426
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547311
OOAU01006426
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV183547313
OOAU01006426
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183547322
OOAU01007585
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547334
OOAU01008071
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183547344
OOAU01008751
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183547345
OOAU01008751
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183547346
OOAU01008953
202812
Bacillota
CAT
Met
>WENV183547353
OOAU01009525
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547352
OOAU01009525
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183547357
OOAU01009644
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183547378
OOAU01012263
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183547383
OOAU01012280
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183547382
OOAU01012280
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183547381
OOAU01012280
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547387
OOAU01012495
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547388
OOAU01012495
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183547389
OOAU01012791
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183547390
OOAU01012826
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183547391
OOAU01013056
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183547392
OOAU01013262
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183547417
OOAU01016648
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547418
OOAU01016648
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183547420
OOAU01016787
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183547431
OOAU01018866
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183547437
OOAU01020092
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183547440
OOAU01020461
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183547449
OOAU01022504
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547476
OOAU01027220
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547477
OOAU01027220
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV183547485
OOAU01029978
313164
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183547492
OOAU01031454
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183547501
OOAU01034750
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183547503
OOAU01034756
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183547502
OOAU01034756
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183547506
OOAU01035511
198135
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183547509
OOAU01035773
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183547510
OOAU01035773
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183547512
OOAU01036454
238910
Bacillota
CTT
Lys
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK