This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
89 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183545147
OOAQ01000595
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183545146
OOAQ01000595
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183545096
OOAQ01000422
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183545179
OOAQ01000766
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183545099
OOAQ01000428
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183545081
OOAQ01000355
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183545330
OOAQ01001955
202812
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545802
OOAQ01039747
144766
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545069
OOAQ01000338
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV183545841
OOAQ01052906
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183545393
OOAQ01002756
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183545334
OOAQ01002023
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183545484
OOAQ01004751
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183545879
OOAQ01069440
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183545219
OOAQ01000931
155113
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183545206
OOAQ01000876
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183545098
OOAQ01000423
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183545486
OOAQ01004800
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545378
OOAQ01002409
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545232
OOAQ01000990
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183544999
OOAQ01000163
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545600
OOAQ01009255
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183545374
OOAQ01002390
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545369
OOAQ01002308
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545205
OOAQ01000876
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545113
OOAQ01000480
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545097
OOAQ01000423
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183545386
OOAQ01002597
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183545091
OOAQ01000416
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183545601
OOAQ01009255
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183545070
OOAQ01000338
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545413
OOAQ01003125
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545214
OOAQ01000902
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545351
OOAQ01002109
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183545402
OOAQ01002885
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545301
OOAQ01001615
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545221
OOAQ01000935
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183545845
OOAQ01054491
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545663
OOAQ01014027
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545648
OOAQ01012687
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183545720
OOAQ01020643
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545777
OOAQ01031696
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545049
OOAQ01000296
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183545631
OOAQ01011326
390153
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545075
OOAQ01000345
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545453
OOAQ01003856
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545048
OOAQ01000296
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545122
OOAQ01000486
248965
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183545072
OOAQ01000340
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183545426
OOAQ01003350
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183545026
OOAQ01000249
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183545487
OOAQ01004807
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183545651
OOAQ01013041
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183545547
OOAQ01006863
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545336
OOAQ01002023
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545196
OOAQ01000841
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545340
OOAQ01002037
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183545446
OOAQ01003761
97943
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545666
OOAQ01014053
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545435
OOAQ01003492
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183544927
OOAQ01000032
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183545335
OOAQ01002023
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545427
OOAQ01003370
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545350
OOAQ01002109
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183545593
OOAQ01009030
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183545364
OOAQ01002253
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183545548
OOAQ01006901
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183545768
OOAQ01029383
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183545735
OOAQ01022686
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183545450
OOAQ01003856
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV183545354
OOAQ01002155
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183545466
OOAQ01004348
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183545305
OOAQ01001674
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183544982
OOAQ01000124
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183545071
OOAQ01000340
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183545756
OOAQ01026643
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545779
OOAQ01032167
247057
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545623
OOAQ01010804
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545659
OOAQ01013776
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545722
OOAQ01021095
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183545656
OOAQ01013529
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545502
OOAQ01005071
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545804
OOAQ01039747
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183545286
OOAQ01001546
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183545365
OOAQ01002253
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183545773
OOAQ01030521
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183544893
OOAQ01000001
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183545594
OOAQ01009030
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183545207
OOAQ01000876
411549
Bacillota
TTG
Gln
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK