This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
105 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183540765
OOAK01000351
256380
Bacillota
>WENV183541413
OOAK01029433
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183540884
OOAK01000746
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183541093
OOAK01002553
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183540741
OOAK01000300
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183540944
OOAK01001108
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183540597
OOAK01000082
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183541088
OOAK01002526
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183541024
OOAK01001849
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183541360
OOAK01017520
202812
Bacillota
CAT
Met
>WENV183541007
OOAK01001634
144766
Bacillota
CAT
Met
>WENV183540587
OOAK01000075
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183541270
OOAK01008972
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV183541034
OOAK01001940
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183540869
OOAK01000652
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183540998
OOAK01001565
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183541101
OOAK01002633
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183540796
OOAK01000448
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183541014
OOAK01001694
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183540698
OOAK01000214
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183541386
OOAK01022509
152512
Bacillota
CCT
Arg
>WENV183541375
OOAK01019763
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183541111
OOAK01002801
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183540662
OOAK01000151
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183540661
OOAK01000151
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183540660
OOAK01000151
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183540634
OOAK01000114
338143
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183541273
OOAK01009103
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183541169
OOAK01004124
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183541108
OOAK01002798
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183540981
OOAK01001421
239080
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183541110
OOAK01002801
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183540831
OOAK01000527
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183540808
OOAK01000477
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183541033
OOAK01001935
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183540573
OOAK01000062
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183540818
OOAK01000513
239076
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183540970
OOAK01001340
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183540843
OOAK01000556
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183540623
OOAK01000105
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183540956
OOAK01001219
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183540795
OOAK01000443
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183540778
OOAK01000395
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183541404
OOAK01026647
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183541246
OOAK01007696
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183541232
OOAK01006592
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183541068
OOAK01002181
388249
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183540763
OOAK01000344
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183540973
OOAK01001340
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183540971
OOAK01001340
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183540652
OOAK01000138
340265
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183540574
OOAK01000062
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183541297
OOAK01012128
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183540791
OOAK01000436
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183540747
OOAK01000314
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183541116
OOAK01002906
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183540776
OOAK01000390
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183540945
OOAK01001113
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183541206
OOAK01005631
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183540764
OOAK01000349
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183541000
OOAK01001565
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183540733
OOAK01000282
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183540841
OOAK01000556
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183540621
OOAK01000105
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183540569
OOAK01000056
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183541210
OOAK01005752
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183540972
OOAK01001340
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183540999
OOAK01001565
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183540817
OOAK01000513
148348
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183540618
OOAK01000105
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183541057
OOAK01002105
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183540889
OOAK01000769
235697
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183540885
OOAK01000751
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183541382
OOAK01021215
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183541170
OOAK01004124
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183541109
OOAK01002798
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183540951
OOAK01001154
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183540711
OOAK01000244
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183540883
OOAK01000733
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183541157
OOAK01003819
37193
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183540619
OOAK01000105
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV183540571
OOAK01000062
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183540650
OOAK01000138
304759
Bacillota
TAC
Val
>WENV183540593
OOAK01000078
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183540828
OOAK01000522
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183541026
OOAK01001878
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183541056
OOAK01002105
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183540713
OOAK01000246
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183540790
OOAK01000436
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183540746
OOAK01000314
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183540924
OOAK01000986
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183540693
OOAK01000205
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183541247
OOAK01007696
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183541254
OOAK01008142
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183541403
OOAK01026647
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183541323
OOAK01014117
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183540873
OOAK01000656
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183541031
OOAK01001910
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183540886
OOAK01000751
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183540824
OOAK01000513
340263
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183541180
OOAK01004744
369244
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183540928
OOAK01001006
146770
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183540697
OOAK01000214
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183540969
OOAK01001340
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183540967
OOAK01001337
411549
Bacillota
TTG
Gln
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK