This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
120 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183631554
OOIF01000010
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183631631
OOIF01000057
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183631690
OOIF01000108
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183631699
OOIF01000115
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183631722
OOIF01000142
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV183631723
OOIF01000142
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183631742
OOIF01000161
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183631783
OOIF01000204
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183631787
OOIF01000209
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183631788
OOIF01000209
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV183631814
OOIF01000246
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183631840
OOIF01000265
338127
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183631883
OOIF01000333
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV183631894
OOIF01000371
256380
Bacillota
>WENV183631930
OOIF01000486
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV183631933
OOIF01000486
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183631954
OOIF01000525
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183631955
OOIF01000525
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183631981
OOIF01000606
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183631994
OOIF01000653
390329
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183632025
OOIF01000750
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV183632027
OOIF01000750
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV183632034
OOIF01000776
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183632041
OOIF01000835
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183632046
OOIF01000851
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183632047
OOIF01000851
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183632068
OOIF01000945
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183632081
OOIF01001007
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183632105
OOIF01001095
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV183632129
OOIF01001200
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632131
OOIF01001205
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632147
OOIF01001294
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183632148
OOIF01001305
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183632149
OOIF01001305
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632154
OOIF01001331
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183632156
OOIF01001340
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183632162
OOIF01001353
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183632172
OOIF01001399
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183632208
OOIF01001623
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183632221
OOIF01001767
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183632231
OOIF01001832
379268
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183632232
OOIF01001832
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183632233
OOIF01001832
313104
Bacillota
TAC
Val
>WENV183632260
OOIF01001961
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183632264
OOIF01002038
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183632269
OOIF01002041
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183632268
OOIF01002041
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632277
OOIF01002112
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632285
OOIF01002176
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632293
OOIF01002249
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183632294
OOIF01002275
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183632295
OOIF01002290
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183632299
OOIF01002299
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183632306
OOIF01002420
59296
Bacillota
AAG
Leu
>WENV183632308
OOIF01002471
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV183632323
OOIF01002571
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183632326
OOIF01002605
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183632335
OOIF01002690
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632336
OOIF01002695
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183632338
OOIF01002701
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183632339
OOIF01002710
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183632342
OOIF01002739
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183632343
OOIF01002739
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632347
OOIF01002764
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183632348
OOIF01002772
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632374
OOIF01003013
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183632375
OOIF01003013
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183632380
OOIF01003035
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183632383
OOIF01003056
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183632384
OOIF01003056
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183632416
OOIF01003294
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183632481
OOIF01004311
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183632480
OOIF01004311
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632483
OOIF01004349
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183632486
OOIF01004396
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183632509
OOIF01004938
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183632513
OOIF01005047
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183632515
OOIF01005054
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183632514
OOIF01005054
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632518
OOIF01005088
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183632521
OOIF01005143
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183632530
OOIF01005424
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183632531
OOIF01005424
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183632544
OOIF01005655
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183632545
OOIF01005655
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632560
OOIF01006304
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183632561
OOIF01006304
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183632562
OOIF01006359
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183632569
OOIF01006632
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183632578
OOIF01006972
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632583
OOIF01007361
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183632589
OOIF01007568
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183632598
OOIF01007618
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183632602
OOIF01007675
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183632609
OOIF01007921
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183632610
OOIF01008020
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183632626
OOIF01008422
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183632627
OOIF01008448
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183632663
OOIF01010397
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183632670
OOIF01010533
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632696
OOIF01011606
313454
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183632711
OOIF01012186
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183632713
OOIF01012224
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183632714
OOIF01012224
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632723
OOIF01013140
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632740
OOIF01013975
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183632769
OOIF01016666
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183632775
OOIF01017740
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183632816
OOIF01021315
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183632830
OOIF01022773
198135
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183632829
OOIF01022773
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183632880
OOIF01032092
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183632882
OOIF01032092
198770
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183632919
OOIF01038270
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183632937
OOIF01042550
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183632936
OOIF01042550
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183632938
OOIF01042849
342061
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183632942
OOIF01043873
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183632944
OOIF01044056
292012
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183632972
OOIF01054556
247057
Bacillota
TGC
Ala
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK